RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391877.3

DEGS1-202, Transcript of delta 4-desaturase, sphingolipid 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene DEGS1, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEGS1-202ENST00000391877 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
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DEGS1-202ENST00000391877 CUL7Q14999 1698 aa21.56■■□□□ 1.04
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DEGS1-202ENST00000391877 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.41■■□□□ 1.02
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DEGS1-202ENST00000391877 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.87■□□□□ 0.93
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DEGS1-202ENST00000391877 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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DEGS1-202ENST00000391877 CD109Q6YHK3 1445 aa20.74■□□□□ 0.91
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DEGS1-202ENST00000391877 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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DEGS1-202ENST00000391877 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.56■□□□□ 0.88
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DEGS1-202ENST00000391877 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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DEGS1-202ENST00000391877 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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DEGS1-202ENST00000391877 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.3■□□□□ 0.84
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DEGS1-202ENST00000391877 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.29■□□□□ 0.84
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DEGS1-202ENST00000391877 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.26■□□□□ 0.83
DEGS1-202ENST00000391877 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.26■□□□□ 0.83
DEGS1-202ENST00000391877 PTPRMP28827 1452 aa20.25■□□□□ 0.83
DEGS1-202ENST00000391877 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
DEGS1-202ENST00000391877 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
DEGS1-202ENST00000391877 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.22■□□□□ 0.83
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DEGS1-202ENST00000391877 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.22■□□□□ 0.83
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