RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360338.3

ZNF460-201, Transcript of zinc finger protein 460, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF460, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF460-201ENST00000360338 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.54■□□□□ 0.24
ZNF460-201ENST00000360338 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.53■□□□□ 0.24
ZNF460-201ENST00000360338 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.52■□□□□ 0.23
ZNF460-201ENST00000360338 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ZNF460-201ENST00000360338 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.48■□□□□ 0.23
ZNF460-201ENST00000360338 TOPBP1Q92547 1522 aa16.48■□□□□ 0.23
ZNF460-201ENST00000360338 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
ZNF460-201ENST00000360338 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.44■□□□□ 0.22
ZNF460-201ENST00000360338 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
ZNF460-201ENST00000360338 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.42■□□□□ 0.22
ZNF460-201ENST00000360338 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.41■□□□□ 0.22
ZNF460-201ENST00000360338 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.41■□□□□ 0.22
ZNF460-201ENST00000360338 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ZNF460-201ENST00000360338 TRIM52Q96A61 297 aa16.38■□□□□ 0.21
ZNF460-201ENST00000360338 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.38■□□□□ 0.21
ZNF460-201ENST00000360338 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ZNF460-201ENST00000360338 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.34■□□□□ 0.21
ZNF460-201ENST00000360338 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
ZNF460-201ENST00000360338 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.32■□□□□ 0.2
ZNF460-201ENST00000360338 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ZNF460-201ENST00000360338 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.31■□□□□ 0.2
ZNF460-201ENST00000360338 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.3■□□□□ 0.2
ZNF460-201ENST00000360338 FOXD1Q16676 465 aa16.29■□□□□ 0.2
ZNF460-201ENST00000360338 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
ZNF460-201ENST00000360338 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.28■□□□□ 0.2
ZNF460-201ENST00000360338 KCNH8Q96L42 1107 aa16.28■□□□□ 0.2
ZNF460-201ENST00000360338 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
ZNF460-201ENST00000360338 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ZNF460-201ENST00000360338 ERCC6Q03468 1493 aa16.25■□□□□ 0.19
ZNF460-201ENST00000360338 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.24■□□□□ 0.19
ZNF460-201ENST00000360338 TIAM1Q13009 1591 aa16.23■□□□□ 0.19
ZNF460-201ENST00000360338 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ZNF460-201ENST00000360338 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
ZNF460-201ENST00000360338 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.18■□□□□ 0.18
ZNF460-201ENST00000360338 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
ZNF460-201ENST00000360338 FMN1Q68DA7 1419 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF460-201ENST00000360338 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.16■□□□□ 0.18
ZNF460-201ENST00000360338 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.16■□□□□ 0.18
ZNF460-201ENST00000360338 MYT1Q01538 1121 aa16.15■□□□□ 0.18
ZNF460-201ENST00000360338 PRDM2Q13029 1718 aa16.14■□□□□ 0.17
ZNF460-201ENST00000360338 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.13■□□□□ 0.17
ZNF460-201ENST00000360338 TONSLQ96HA7 1378 aa16.13■□□□□ 0.17
ZNF460-201ENST00000360338 BCANQ96GW7 911 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF460-201ENST00000360338 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF460-201ENST00000360338 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF460-201ENST00000360338 PTPRKQ15262 1439 aa16.09■□□□□ 0.17
ZNF460-201ENST00000360338 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
ZNF460-201ENST00000360338 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.08■□□□□ 0.16
ZNF460-201ENST00000360338 NCOA2Q15596 1464 aa16.07■□□□□ 0.16
ZNF460-201ENST00000360338 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.06■□□□□ 0.16
ZNF460-201ENST00000360338 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.04■□□□□ 0.16
ZNF460-201ENST00000360338 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ZNF460-201ENST00000360338 JPH4Q96JJ6 628 aa16.03■□□□□ 0.16
ZNF460-201ENST00000360338 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ZNF460-201ENST00000360338 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.02■□□□□ 0.16
ZNF460-201ENST00000360338 MAPKBP1O60336 1514 aa16.02■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 GRIN2BQ13224 1484 aa16■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 WDR97A6NE52 1622 aa16■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 CUL7Q14999 1698 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF460-201ENST00000360338 ANP32CO43423 234 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 NAIPQ13075 1403 aa15.91■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 MAP3K1Q13233 1512 aa15.91■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 IQGAP2Q13576 1575 aa15.91■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.9■□□□□ 0.14
ZNF460-201ENST00000360338 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ZNF460-201ENST00000360338 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ZNF460-201ENST00000360338 IFT140Q96RY7 1462 aa15.88■□□□□ 0.13
ZNF460-201ENST00000360338 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.87■□□□□ 0.13
ZNF460-201ENST00000360338 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ZNF460-201ENST00000360338 HFM1A2PYH4 1435 aa15.84■□□□□ 0.13
ZNF460-201ENST00000360338 RGL3Q3MIN7 710 aa15.84■□□□□ 0.13
ZNF460-201ENST00000360338 GRIN2AQ12879 1464 aa15.84■□□□□ 0.13
ZNF460-201ENST00000360338 UACAQ9BZF9 1416 aa15.83■□□□□ 0.13
ZNF460-201ENST00000360338 PKD2Q13563 968 aa15.83■□□□□ 0.12
ZNF460-201ENST00000360338 ADAMTS12P58397 1594 aa15.82■□□□□ 0.12
ZNF460-201ENST00000360338 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.82■□□□□ 0.12
ZNF460-201ENST00000360338 FKBP8Q14318 412 aa15.82■□□□□ 0.12
ZNF460-201ENST00000360338 TSPY4P0CV99 314 aa15.81■□□□□ 0.12
ZNF460-201ENST00000360338 TSPY10P0CW01 314 aa15.81■□□□□ 0.12
ZNF460-201ENST00000360338 SAMD9Q5K651 1589 aa15.81■□□□□ 0.12
ZNF460-201ENST00000360338 PBRM1Q86U86 1689 aa15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms