RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359548.8

GPAT2-201, Transcript of glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPAT2, Length 2,761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT2-201ENST00000359548 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
GPAT2-201ENST00000359548 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAT2-201ENST00000359548 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GPAT2-201ENST00000359548 P3H3Q8IVL6 736 aa24.27■■□□□ 1.48
GPAT2-201ENST00000359548 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GPAT2-201ENST00000359548 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
GPAT2-201ENST00000359548 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.24■■□□□ 1.47
GPAT2-201ENST00000359548 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.24■■□□□ 1.47
GPAT2-201ENST00000359548 CUX2O14529 1486 aa24.22■■□□□ 1.47
GPAT2-201ENST00000359548 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GPAT2-201ENST00000359548 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.2■■□□□ 1.46
GPAT2-201ENST00000359548 ERCC6Q03468 1493 aa24.2■■□□□ 1.46
GPAT2-201ENST00000359548 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GPAT2-201ENST00000359548 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.16■■□□□ 1.46
GPAT2-201ENST00000359548 IGF1RP08069 1367 aa24.14■■□□□ 1.45
GPAT2-201ENST00000359548 MAPKBP1O60336 1514 aa24.12■■□□□ 1.45
GPAT2-201ENST00000359548 BCANQ96GW7 911 aa24.11■■□□□ 1.45
GPAT2-201ENST00000359548 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GPAT2-201ENST00000359548 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.11■■□□□ 1.45
GPAT2-201ENST00000359548 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.08■■□□□ 1.45
GPAT2-201ENST00000359548 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.06■■□□□ 1.44
GPAT2-201ENST00000359548 TIAM1Q13009 1591 aa24.05■■□□□ 1.44
GPAT2-201ENST00000359548 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GPAT2-201ENST00000359548 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.02■■□□□ 1.44
GPAT2-201ENST00000359548 WDR97A6NE52 1622 aa24.02■■□□□ 1.44
GPAT2-201ENST00000359548 WDR62O43379 1518 aa24.02■■□□□ 1.44
GPAT2-201ENST00000359548 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24■■□□□ 1.43
GPAT2-201ENST00000359548 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GPAT2-201ENST00000359548 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
GPAT2-201ENST00000359548 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.97■■□□□ 1.43
GPAT2-201ENST00000359548 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.95■■□□□ 1.42
GPAT2-201ENST00000359548 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
GPAT2-201ENST00000359548 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.9■■□□□ 1.42
GPAT2-201ENST00000359548 TRIM52Q96A61 297 aa23.89■■□□□ 1.42
GPAT2-201ENST00000359548 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.89■■□□□ 1.41
GPAT2-201ENST00000359548 FKBP8Q14318 412 aa23.89■■□□□ 1.41
GPAT2-201ENST00000359548 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
GPAT2-201ENST00000359548 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
GPAT2-201ENST00000359548 IFT140Q96RY7 1462 aa23.85■■□□□ 1.41
GPAT2-201ENST00000359548 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
GPAT2-201ENST00000359548 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.81■■□□□ 1.4
GPAT2-201ENST00000359548 MAP3K1Q13233 1512 aa23.8■■□□□ 1.4
GPAT2-201ENST00000359548 CUL7Q14999 1698 aa23.76■■□□□ 1.39
GPAT2-201ENST00000359548 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.76■■□□□ 1.39
GPAT2-201ENST00000359548 PBRM1Q86U86 1689 aa23.75■■□□□ 1.39
GPAT2-201ENST00000359548 ANP32CO43423 234 aa23.7■■□□□ 1.38
GPAT2-201ENST00000359548 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GPAT2-201ENST00000359548 GRIN2BQ13224 1484 aa23.68■■□□□ 1.38
GPAT2-201ENST00000359548 TONSLQ96HA7 1378 aa23.68■■□□□ 1.38
GPAT2-201ENST00000359548 PTPRKQ15262 1439 aa23.67■■□□□ 1.38
GPAT2-201ENST00000359548 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.64■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.63■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.63■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.63■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.62■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.61■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 NEFLP07196 543 aa23.6■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 ADAMTS12P58397 1594 aa23.59■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.59■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 ARID3CA6NKF2 412 aa23.59■■□□□ 1.37
GPAT2-201ENST00000359548 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
GPAT2-201ENST00000359548 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.57■■□□□ 1.36
GPAT2-201ENST00000359548 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.55■■□□□ 1.36
GPAT2-201ENST00000359548 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.54■■□□□ 1.36
GPAT2-201ENST00000359548 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.54■■□□□ 1.36
GPAT2-201ENST00000359548 CCER2I3L3R5 266 aa23.53■■□□□ 1.36
GPAT2-201ENST00000359548 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.51■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 FBLN2P98095 1184 aa23.5■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.49■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 FMN1Q68DA7 1419 aa23.49■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.49■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 NAIPQ13075 1403 aa23.47■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 UACAQ9BZF9 1416 aa23.47■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 NCOA2Q15596 1464 aa23.47■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 HFM1A2PYH4 1435 aa23.47■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 FOXD1Q16676 465 aa23.47■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GPAT2-201ENST00000359548 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
GPAT2-201ENST00000359548 GRIN2AQ12879 1464 aa23.42■■□□□ 1.34
GPAT2-201ENST00000359548 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GPAT2-201ENST00000359548 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.41■■□□□ 1.34
GPAT2-201ENST00000359548 SYNJ2O15056 1496 aa23.4■■□□□ 1.34
GPAT2-201ENST00000359548 CCDC184Q52MB2 194 aa23.4■■□□□ 1.34
GPAT2-201ENST00000359548 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.39■■□□□ 1.34
GPAT2-201ENST00000359548 BCL11AQ9H165 835 aa23.37■■□□□ 1.33
GPAT2-201ENST00000359548 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.37■■□□□ 1.33
GPAT2-201ENST00000359548 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.36■■□□□ 1.33
GPAT2-201ENST00000359548 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
GPAT2-201ENST00000359548 IQGAP2Q13576 1575 aa23.34■■□□□ 1.33
GPAT2-201ENST00000359548 KDM6BO15054 1643 aa23.32■■□□□ 1.32
GPAT2-201ENST00000359548 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GPAT2-201ENST00000359548 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GPAT2-201ENST00000359548 SAMD9Q5K651 1589 aa23.3■■□□□ 1.32
GPAT2-201ENST00000359548 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GPAT2-201ENST00000359548 CEP170Q5SW79 1584 aa23.29■■□□□ 1.32
GPAT2-201ENST00000359548 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.28■■□□□ 1.32
GPAT2-201ENST00000359548 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.27■■□□□ 1.32
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