RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357480.9

NFE2L1-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L1, Length 4,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L1-201ENST00000357480 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.57■□□□□ 0.08
NFE2L1-201ENST00000357480 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.57■□□□□ 0.08
NFE2L1-201ENST00000357480 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.53■□□□□ 0.08
NFE2L1-201ENST00000357480 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
NFE2L1-201ENST00000357480 C14orf37Q86TY3 774 aa15.53■□□□□ 0.08
NFE2L1-201ENST00000357480 CFTRP13569 1480 aa15.51■□□□□ 0.07
NFE2L1-201ENST00000357480 JPH4Q96JJ6 628 aa15.5■□□□□ 0.07
NFE2L1-201ENST00000357480 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
NFE2L1-201ENST00000357480 GOLGA3Q08378 1498 aa15.47■□□□□ 0.07
NFE2L1-201ENST00000357480 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
NFE2L1-201ENST00000357480 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.44■□□□□ 0.06
NFE2L1-201ENST00000357480 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.43■□□□□ 0.06
NFE2L1-201ENST00000357480 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NFE2L1-201ENST00000357480 MLECQ14165 292 aa15.43■□□□□ 0.06
NFE2L1-201ENST00000357480 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.43■□□□□ 0.06
NFE2L1-201ENST00000357480 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
NFE2L1-201ENST00000357480 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.41■□□□□ 0.06
NFE2L1-201ENST00000357480 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
NFE2L1-201ENST00000357480 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.39■□□□□ 0.05
NFE2L1-201ENST00000357480 CLIP1P30622 1438 aa15.38■□□□□ 0.05
NFE2L1-201ENST00000357480 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.38■□□□□ 0.05
NFE2L1-201ENST00000357480 CEP162Q5TB80 1403 aa15.36■□□□□ 0.05
NFE2L1-201ENST00000357480 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NFE2L1-201ENST00000357480 PTPRGP23470 1445 aa15.34■□□□□ 0.05
NFE2L1-201ENST00000357480 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NFE2L1-201ENST00000357480 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.32■□□□□ 0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 IFT140Q96RY7 1462 aa15.3■□□□□ 0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.3■□□□□ 0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 ANP32CO43423 234 aa15.3■□□□□ 0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 NEFMP07197 916 aa15.28■□□□□ 0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.28■□□□□ 0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.26■□□□□ 0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.26■□□□□ 0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.25■□□□□ 0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 KANK1Q14678 1352 aa15.25■□□□□ 0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 TOPBP1Q92547 1522 aa15.25■□□□□ 0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 CUX1P39880 1505 aa15.25■□□□□ 0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.035e-10■■■■■ 28.8
NFE2L1-201ENST00000357480 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.22■□□□□ 0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 SYNJ1O43426 1573 aa15.22■□□□□ 0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 GRIN2BQ13224 1484 aa15.22■□□□□ 0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 NEUROD1Q13562 356 aa15.2■□□□□ 0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 GGT6Q6P531 493 aa15.2■□□□□ 0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 SLC24A1O60721 1099 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 EID1Q9Y6B2 187 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 FMN1Q68DA7 1419 aa15.13■□□□□ 0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.13■□□□□ 0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.13■□□□□ 0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.11■□□□□ 0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 TONSLQ96HA7 1378 aa15.11■□□□□ 0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 WDR62O43379 1518 aa15.1■□□□□ 0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 A0A0G2JS52 829 aa15.1■□□□□ 0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NFE2L1-201ENST00000357480 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
NFE2L1-201ENST00000357480 PRDM2Q13029 1718 aa15.07■□□□□ 0
NFE2L1-201ENST00000357480 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
NFE2L1-201ENST00000357480 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.06■□□□□ 0
NFE2L1-201ENST00000357480 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.04■□□□□ -0
NFE2L1-201ENST00000357480 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.03■□□□□ -0
NFE2L1-201ENST00000357480 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.03■□□□□ -0
NFE2L1-201ENST00000357480 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 TOP2BQ02880 1626 aa15.02□□□□□ -0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 POGKQ9P215 609 aa15□□□□□ -0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15□□□□□ -0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 KIF3BO15066 747 aa14.99□□□□□ -0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 PLEKHG5O94827 1062 aa14.98□□□□□ -0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.97□□□□□ -0.01
NFE2L1-201ENST00000357480 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.95□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.95□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.94□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.93□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 RGL3Q3MIN7 710 aa14.92□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.91□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 IGF1RP08069 1367 aa14.9□□□□□ -0.02
NFE2L1-201ENST00000357480 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.88□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.88□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 MIER1Q8N108 512 aa14.87□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.85□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 FOXD1Q16676 465 aa14.85□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 SYNJ2O15056 1496 aa14.85□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 CDCA8Q53HL2 280 aa14.85□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.84□□□□□ -0.03
NFE2L1-201ENST00000357480 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.82□□□□□ -0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NFE2L1-201ENST00000357480 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.9 ms