RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 IGF1RP08069 1367 aa39.59■■■■□ 3.93
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CLTB-202ENST00000345807 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.33■■■■□ 3.89
CLTB-202ENST00000345807 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.15■■■■□ 3.86
CLTB-202ENST00000345807 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.14■■■■□ 3.86
CLTB-202ENST00000345807 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.14■■■■□ 3.86
CLTB-202ENST00000345807 MAPKBP1O60336 1514 aa39.06■■■■□ 3.84
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CLTB-202ENST00000345807 PTPRGP23470 1445 aa39.02■■■■□ 3.84
CLTB-202ENST00000345807 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.02■■■■□ 3.84
CLTB-202ENST00000345807 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39■■■■□ 3.83
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CLTB-202ENST00000345807 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.97■■■■□ 3.83
CLTB-202ENST00000345807 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.96■■■■□ 3.83
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CLTB-202ENST00000345807 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.81■■■■□ 3.8
CLTB-202ENST00000345807 ABCC2Q92887 1545 aa38.79■■■■□ 3.8
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CLTB-202ENST00000345807 ASXL2Q76L83 1435 aa38.64■■■■□ 3.78
CLTB-202ENST00000345807 TSPOAP1O95153 1857 aa38.63■■■■□ 3.77
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CLTB-202ENST00000345807 PRXQ9BXM0 1461 aa38.62■■■■□ 3.77
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CLTB-202ENST00000345807 P3H3Q8IVL6 736 aa38.2■■■■□ 3.71
CLTB-202ENST00000345807 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.2■■■■□ 3.71
CLTB-202ENST00000345807 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
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CLTB-202ENST00000345807 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.05■■■■□ 3.68
CLTB-202ENST00000345807 CD109Q6YHK3 1445 aa38.04■■■■□ 3.68
CLTB-202ENST00000345807 ARID3CA6NKF2 412 aa38.04■■■■□ 3.68
CLTB-202ENST00000345807 ATP10BO94823 1461 aa38.02■■■■□ 3.68
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CLTB-202ENST00000345807 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
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CLTB-202ENST00000345807 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.71■■■■□ 3.63
CLTB-202ENST00000345807 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.67■■■■□ 3.62
CLTB-202ENST00000345807 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
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CLTB-202ENST00000345807 RAPGEF3O95398 923 aa37.49■■■■□ 3.59
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CLTB-202ENST00000345807 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.45■■■■□ 3.599e-9■■■■□ 22.3
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CLTB-202ENST00000345807 FANCAO15360 1455 aa37.36■■■■□ 3.57
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CLTB-202ENST00000345807 AKNAQ7Z591 1439 aa37.35■■■■□ 3.57
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CLTB-202ENST00000345807 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.1■■■■□ 3.53
CLTB-202ENST00000345807 CLIP1P30622 1438 aa37.08■■■■□ 3.53
CLTB-202ENST00000345807 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.07■■■■□ 3.53
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