RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
LRRC25-201ENST00000339007 IGF1RP08069 1367 aa26.1■■□□□ 1.77
LRRC25-201ENST00000339007 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.08■■□□□ 1.77
LRRC25-201ENST00000339007 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.07■■□□□ 1.76
LRRC25-201ENST00000339007 FKBP8Q14318 412 aa26.05■■□□□ 1.76
LRRC25-201ENST00000339007 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.05■■□□□ 1.76
LRRC25-201ENST00000339007 BCANQ96GW7 911 aa26.04■■□□□ 1.76
LRRC25-201ENST00000339007 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
LRRC25-201ENST00000339007 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.02■■□□□ 1.76
LRRC25-201ENST00000339007 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
LRRC25-201ENST00000339007 PRDM2Q13029 1718 aa26.02■■□□□ 1.76
LRRC25-201ENST00000339007 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.01■■□□□ 1.75
LRRC25-201ENST00000339007 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.01■■□□□ 1.75
LRRC25-201ENST00000339007 CCER2I3L3R5 266 aa25.97■■□□□ 1.75
LRRC25-201ENST00000339007 NEFLP07196 543 aa25.96■■□□□ 1.75
LRRC25-201ENST00000339007 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
LRRC25-201ENST00000339007 ANP32CO43423 234 aa25.9■■□□□ 1.74
LRRC25-201ENST00000339007 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.87■■□□□ 1.73
LRRC25-201ENST00000339007 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
LRRC25-201ENST00000339007 TRIM52Q96A61 297 aa25.84■■□□□ 1.73
LRRC25-201ENST00000339007 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
LRRC25-201ENST00000339007 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.82■■□□□ 1.72
LRRC25-201ENST00000339007 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
LRRC25-201ENST00000339007 P3H3Q8IVL6 736 aa25.79■■□□□ 1.72
LRRC25-201ENST00000339007 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.79■■□□□ 1.72
LRRC25-201ENST00000339007 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
LRRC25-201ENST00000339007 TONSLQ96HA7 1378 aa25.77■■□□□ 1.72
LRRC25-201ENST00000339007 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.77■■□□□ 1.72
LRRC25-201ENST00000339007 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.76■■□□□ 1.71
LRRC25-201ENST00000339007 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.76■■□□□ 1.71
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LRRC25-201ENST00000339007 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.71■■□□□ 1.71
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.71■■□□□ 1.71
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LRRC25-201ENST00000339007 FMN1Q68DA7 1419 aa25.62■■□□□ 1.69
LRRC25-201ENST00000339007 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.61■■□□□ 1.69
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LRRC25-201ENST00000339007 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.58■■□□□ 1.69
LRRC25-201ENST00000339007 PTPRKQ15262 1439 aa25.57■■□□□ 1.68
LRRC25-201ENST00000339007 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.57■■□□□ 1.68
LRRC25-201ENST00000339007 CUL7Q14999 1698 aa25.57■■□□□ 1.68
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LRRC25-201ENST00000339007 BCL11AQ9H165 835 aa25.56■■□□□ 1.68
LRRC25-201ENST00000339007 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.55■■□□□ 1.68
LRRC25-201ENST00000339007 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
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LRRC25-201ENST00000339007 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.53■■□□□ 1.68
LRRC25-201ENST00000339007 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.51■■□□□ 1.67
LRRC25-201ENST00000339007 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.49■■□□□ 1.67
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LRRC25-201ENST00000339007 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.45■■□□□ 1.66
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LRRC25-201ENST00000339007 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.41■■□□□ 1.66
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LRRC25-201ENST00000339007 SAMD9Q5K651 1589 aa25.41■■□□□ 1.66
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LRRC25-201ENST00000339007 GRIN2BQ13224 1484 aa25.39■■□□□ 1.66
LRRC25-201ENST00000339007 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.39■■□□□ 1.66
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LRRC25-201ENST00000339007 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
LRRC25-201ENST00000339007 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
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LRRC25-201ENST00000339007 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.33■■□□□ 1.65
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LRRC25-201ENST00000339007 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.32■■□□□ 1.64
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LRRC25-201ENST00000339007 ARHGEF11O15085 1522 aa25.3■■□□□ 1.64
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LRRC25-201ENST00000339007 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.28■■□□□ 1.64
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LRRC25-201ENST00000339007 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.23■■□□□ 1.63
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC184Q52MB2 194 aa25.22■■□□□ 1.63
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LRRC25-201ENST00000339007 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
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LRRC25-201ENST00000339007 KDM6BO15054 1643 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC25-201ENST00000339007 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
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LRRC25-201ENST00000339007 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC25-201ENST00000339007 MRS2Q9HD23 443 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC25-201ENST00000339007 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
LRRC25-201ENST00000339007 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
LRRC25-201ENST00000339007 MIA2Q96PC5 1412 aa25.13■■□□□ 1.61
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