RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 TIAM1Q13009 1591 aa28.66■■■□□ 2.18
PPP1CC-201ENST00000335007 CCER2I3L3R5 266 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
PPP1CC-201ENST00000335007 CUX1P39880 1505 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP1CC-201ENST00000335007 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-201ENST00000335007 ANP32CO43423 234 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CC-201ENST00000335007 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM52Q96A61 297 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CC-201ENST00000335007 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.44■■■□□ 2.14
PPP1CC-201ENST00000335007 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP1CC-201ENST00000335007 HMGXB3Q12766 1538 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP1CC-201ENST00000335007 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-201ENST00000335007 MSH5O43196 834 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP1CC-201ENST00000335007 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP1CC-201ENST00000335007 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PPP1CC-201ENST00000335007 CFTRP13569 1480 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-201ENST00000335007 NCAPD3P42695 1498 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-201ENST00000335007 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-201ENST00000335007 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.123e-6■■□□□ 12.8
PPP1CC-201ENST00000335007 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PPP1CC-201ENST00000335007 IGF1RP08069 1367 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP1CC-201ENST00000335007 PRDM2Q13029 1718 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-201ENST00000335007 TONSLQ96HA7 1378 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP1CC-201ENST00000335007 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP1CC-201ENST00000335007 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP1CC-201ENST00000335007 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.16■■■□□ 2.1
PPP1CC-201ENST00000335007 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
PPP1CC-201ENST00000335007 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.13■■■□□ 2.09
PPP1CC-201ENST00000335007 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.13■■■□□ 2.09
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.11■■■□□ 2.09
PPP1CC-201ENST00000335007 UACAQ9BZF9 1416 aa28.09■■■□□ 2.09
PPP1CC-201ENST00000335007 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.084e-8■■■■■ 43
PPP1CC-201ENST00000335007 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-201ENST00000335007 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.04■■■□□ 2.08
PPP1CC-201ENST00000335007 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-201ENST00000335007 HFM1A2PYH4 1435 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-201ENST00000335007 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-201ENST00000335007 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP1CC-201ENST00000335007 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP1CC-201ENST00000335007 P3H3Q8IVL6 736 aa27.95■■■□□ 2.06
PPP1CC-201ENST00000335007 NCOA2Q15596 1464 aa27.91■■■□□ 2.06
PPP1CC-201ENST00000335007 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP1CC-201ENST00000335007 NAIPQ13075 1403 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPRKQ15262 1439 aa27.88■■■□□ 2.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.87■■■□□ 2.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.86■■■□□ 2.05
PPP1CC-201ENST00000335007 FMN1Q68DA7 1419 aa27.85■■■□□ 2.05
PPP1CC-201ENST00000335007 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
PPP1CC-201ENST00000335007 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.81■■■□□ 2.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.8■■■□□ 2.04
PPP1CC-201ENST00000335007 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
PPP1CC-201ENST00000335007 HECW1Q76N89 1606 aa27.78■■■□□ 2.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.78■■■□□ 2.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.78■■■□□ 2.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CUL7Q14999 1698 aa27.77■■■□□ 2.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.77■■■□□ 2.04
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.76■■■□□ 2.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
PPP1CC-201ENST00000335007 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.74■■■□□ 2.03
PPP1CC-201ENST00000335007 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.73■■■□□ 2.03
PPP1CC-201ENST00000335007 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC184Q52MB2 194 aa27.71■■■□□ 2.03
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.71■■■□□ 2.03
PPP1CC-201ENST00000335007 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 NCOA1Q15788 1441 aa27.69■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.68■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.67■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.66■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 MRS2Q9HD23 443 aa27.66■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC7Q96M83 1385 aa27.66■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PPP1CC-201ENST00000335007 SAMD9Q5K651 1589 aa27.63■■■□□ 2.01
PPP1CC-201ENST00000335007 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
PPP1CC-201ENST00000335007 GRIN2BQ13224 1484 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP1CC-201ENST00000335007 AKNAQ7Z591 1439 aa27.6■■■□□ 2.01
PPP1CC-201ENST00000335007 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.6■■■□□ 2.01
PPP1CC-201ENST00000335007 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.6■■■□□ 2.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.6■■■□□ 2.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGEF11O15085 1522 aa27.57■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.56■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.53■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.53■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 NBR1Q14596 966 aa27.53■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.52■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
PPP1CC-201ENST00000335007 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
PPP1CC-201ENST00000335007 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.5■■□□□ 1.99
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM6BO15054 1643 aa27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms