RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323482.8

ACSS1-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS1, Length 3,680 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.83■■□□□ 1.25
ACSS1-201ENST00000323482 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ACSS1-201ENST00000323482 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSS1-201ENST00000323482 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
ACSS1-201ENST00000323482 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACSS1-201ENST00000323482 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ACSS1-201ENST00000323482 KIF21BO75037 1637 aa22.74■■□□□ 1.23
ACSS1-201ENST00000323482 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.73■■□□□ 1.23
ACSS1-201ENST00000323482 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACSS1-201ENST00000323482 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ACSS1-201ENST00000323482 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACSS1-201ENST00000323482 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.65■■□□□ 1.22
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ACSS1-201ENST00000323482 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ACSS1-201ENST00000323482 ARID3CA6NKF2 412 aa22.58■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 ARAP1Q96P48 1450 aa22.56■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 MRS2Q9HD23 443 aa22.55■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.54■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 TONSLQ96HA7 1378 aa22.54■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ACSS1-201ENST00000323482 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.5■■□□□ 1.19
ACSS1-201ENST00000323482 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.48■■□□□ 1.19
ACSS1-201ENST00000323482 KIF27Q86VH2 1401 aa22.47■■□□□ 1.19
ACSS1-201ENST00000323482 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.44■■□□□ 1.18
ACSS1-201ENST00000323482 PRXQ9BXM0 1461 aa22.42■■□□□ 1.18
ACSS1-201ENST00000323482 IL27Q8NEV9 243 aa22.42■■□□□ 1.18
ACSS1-201ENST00000323482 ARXQ96QS3 562 aa22.39■■□□□ 1.18
ACSS1-201ENST00000323482 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.39■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 TOP2BQ02880 1626 aa22.39■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC184Q52MB2 194 aa22.34■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.34■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.32■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 CCER2I3L3R5 266 aa22.32■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 NEFMP07197 916 aa22.32■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 CUX2O14529 1486 aa22.32■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.31■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 CUX1P39880 1505 aa22.31■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 FOXD1Q16676 465 aa22.28■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.25■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.25■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.24■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.24■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.22■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 IGF1RP08069 1367 aa22.22■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 SLC4A3P48751 1232 aa22.16■■□□□ 1.14
ACSS1-201ENST00000323482 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
ACSS1-201ENST00000323482 WDR97A6NE52 1622 aa22.14■■□□□ 1.14
ACSS1-201ENST00000323482 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS1-201ENST00000323482 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS1-201ENST00000323482 MAPKBP1O60336 1514 aa22.11■■□□□ 1.13
ACSS1-201ENST00000323482 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ACSS1-201ENST00000323482 TMC1Q8TDI8 760 aa22.1■■□□□ 1.13
ACSS1-201ENST00000323482 SKAP1Q86WV1 359 aa22.06■■□□□ 1.12
ACSS1-201ENST00000323482 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.06■■□□□ 1.12
ACSS1-201ENST00000323482 NCAPD3P42695 1498 aa22.05■■□□□ 1.12
ACSS1-201ENST00000323482 CFTRP13569 1480 aa22.05■■□□□ 1.12
ACSS1-201ENST00000323482 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.02■■□□□ 1.12
ACSS1-201ENST00000323482 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 TIAM1Q13009 1591 aa22■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.99■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.98■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.97■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.96■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.94■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.94■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 AKNAQ7Z591 1439 aa21.93■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 PLIN1O60240 522 aa21.92■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.9■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.9■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 RGS3P49796 1198 aa21.89■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 HMGXB3Q12766 1538 aa21.86■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 PDE4AP27815 886 aa21.81■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.8■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 NUDCQ9Y266 331 aa21.79■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.78■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 PTPRKQ15262 1439 aa21.77■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.76■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.76■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.75■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.75■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 NESP48681 1621 aa21.71■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 MAP3K1Q13233 1512 aa21.69■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms