RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR97A6NE52 1622 aa31.76■■■□□ 2.67
GRAMD1A-201ENST00000317991 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.7■■■□□ 2.67
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.69■■■□□ 2.66
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM52Q96A61 297 aa31.68■■■□□ 2.66
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.61■■■□□ 2.65
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEFLP07196 543 aa31.59■■■□□ 2.65
GRAMD1A-201ENST00000317991 TIAM1Q13009 1591 aa31.58■■■□□ 2.65
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCL11AQ9H165 835 aa31.55■■■□□ 2.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.51■■■□□ 2.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANP32CO43423 234 aa31.49■■■□□ 2.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGF1RP08069 1367 aa31.48■■■□□ 2.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFTRP13569 1480 aa31.47■■■□□ 2.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCER2I3L3R5 266 aa31.46■■■□□ 2.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 P3H3Q8IVL6 736 aa31.45■■■□□ 2.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP3K1Q13233 1512 aa31.43■■■□□ 2.62
GRAMD1A-201ENST00000317991 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.39■■■□□ 2.62
GRAMD1A-201ENST00000317991 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.39■■■□□ 2.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.34■■■□□ 2.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 NESP48681 1621 aa31.33■■■□□ 2.61
GRAMD1A-201ENST00000317991 MSH5O43196 834 aa31.32■■■□□ 2.6
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
GRAMD1A-201ENST00000317991 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.23■■■□□ 2.59
GRAMD1A-201ENST00000317991 TONSLQ96HA7 1378 aa31.22■■■□□ 2.59
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.18■■■□□ 2.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.18■■■□□ 2.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.17■■■□□ 2.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRDM2Q13029 1718 aa31.16■■■□□ 2.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.11■■■□□ 2.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.09■■■□□ 2.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.05■■■□□ 2.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPRKQ15262 1439 aa31.03■■■□□ 2.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.562e-9■■■□□ 17.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.01■■■□□ 2.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 FANCIQ9NVI1 1328 aa31■■■□□ 2.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.99■■■□□ 2.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.98■■■□□ 2.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 UACAQ9BZF9 1416 aa30.97■■■□□ 2.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.97■■■□□ 2.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.94■■■□□ 2.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.549e-7■■■■■ 49.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC184Q52MB2 194 aa30.93■■■□□ 2.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 HFM1A2PYH4 1435 aa30.92■■■□□ 2.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.9■■■□□ 2.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.9■■■□□ 2.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.89■■■□□ 2.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAIPQ13075 1403 aa30.87■■■□□ 2.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.87■■■□□ 2.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.83■■■□□ 2.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.82■■■□□ 2.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.81■■■□□ 2.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.81■■■□□ 2.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.8■■■□□ 2.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.78■■■□□ 2.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.77■■■□□ 2.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.77■■■□□ 2.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.76■■■□□ 2.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.74■■■□□ 2.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 FMN1Q68DA7 1419 aa30.74■■■□□ 2.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TOPBP1Q92547 1522 aa30.74■■■□□ 2.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCOA2Q15596 1464 aa30.72■■■□□ 2.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.511e-6■■■■■ 33.8
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.71■■■□□ 2.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.71■■■□□ 2.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.7■■■□□ 2.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.66■■■□□ 2.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRS2Q9HD23 443 aa30.65■■■□□ 2.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.64■■■□□ 2.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXD1Q16676 465 aa30.63■■■□□ 2.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.63■■■□□ 2.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.63■■■□□ 2.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.62■■■□□ 2.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC7Q96M83 1385 aa30.56■■■□□ 2.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.56■■■□□ 2.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.54■■■□□ 2.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM6BO15054 1643 aa30.53■■■□□ 2.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRIN2BQ13224 1484 aa30.52■■■□□ 2.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CUL7Q14999 1698 aa30.52■■■□□ 2.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 DEKP35659 375 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCOA1Q15788 1441 aa30.51■■■□□ 2.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.49■■■□□ 2.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERCC6Q03468 1493 aa30.48■■■□□ 2.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.47■■■□□ 2.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.46■■■□□ 2.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.45■■■□□ 2.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAMD9Q5K651 1589 aa30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms