RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312579.3

CCDC85B-201, Transcript of coiled-coil domain containing 85B, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CCDC85B, Length 1,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85B-201ENST00000312579 NUP160Q12769 1436 aa36.54■■■■□ 3.44
CCDC85B-201ENST00000312579 OSCARQ8IYS5 282 aa36.5■■■■□ 3.43
CCDC85B-201ENST00000312579 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.4■■■■□ 3.42
CCDC85B-201ENST00000312579 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.39■■■■□ 3.42
CCDC85B-201ENST00000312579 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.37■■■■□ 3.41
CCDC85B-201ENST00000312579 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
CCDC85B-201ENST00000312579 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.33■■■■□ 3.41
CCDC85B-201ENST00000312579 IQGAP2Q13576 1575 aa36.32■■■■□ 3.4
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CCDC85B-201ENST00000312579 SHROOM2Q13796 1616 aa36.15■■■■□ 3.38
CCDC85B-201ENST00000312579 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.13■■■■□ 3.37
CCDC85B-201ENST00000312579 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
CCDC85B-201ENST00000312579 CEP162Q5TB80 1403 aa36.09■■■■□ 3.37
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CCDC85B-201ENST00000312579 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.07■■■■□ 3.37
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CCDC85B-201ENST00000312579 CLIP1P30622 1438 aa36.03■■■■□ 3.36
CCDC85B-201ENST00000312579 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36■■■■□ 3.35
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CCDC85B-201ENST00000312579 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.95■■■■□ 3.35
CCDC85B-201ENST00000312579 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
CCDC85B-201ENST00000312579 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.93■■■■□ 3.34
CCDC85B-201ENST00000312579 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.92■■■■□ 3.34
CCDC85B-201ENST00000312579 ARHGEF11O15085 1522 aa35.91■■■■□ 3.34
CCDC85B-201ENST00000312579 ARAP1Q96P48 1450 aa35.86■■■■□ 3.33
CCDC85B-201ENST00000312579 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.84■■■■□ 3.33
CCDC85B-201ENST00000312579 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.84■■■■□ 3.33
CCDC85B-201ENST00000312579 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.84■■■■□ 3.33
CCDC85B-201ENST00000312579 PTPRGP23470 1445 aa35.76■■■■□ 3.31
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CCDC85B-201ENST00000312579 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.62■■■■□ 3.29
CCDC85B-201ENST00000312579 FMN1Q68DA7 1419 aa35.62■■■■□ 3.29
CCDC85B-201ENST00000312579 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.56■■■■□ 3.28
CCDC85B-201ENST00000312579 ABCA8O94911 1581 aa35.53■■■■□ 3.28
CCDC85B-201ENST00000312579 UACAQ9BZF9 1416 aa35.53■■■■□ 3.28
CCDC85B-201ENST00000312579 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
CCDC85B-201ENST00000312579 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
CCDC85B-201ENST00000312579 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.5■■■■□ 3.27
CCDC85B-201ENST00000312579 ARID3CA6NKF2 412 aa35.48■■■■□ 3.27
CCDC85B-201ENST00000312579 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.46■■■■□ 3.27
CCDC85B-201ENST00000312579 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.44■■■■□ 3.26
CCDC85B-201ENST00000312579 ABCC2Q92887 1545 aa35.43■■■■□ 3.26
CCDC85B-201ENST00000312579 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CCDC85B-201ENST00000312579 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.4■■■■□ 3.26
CCDC85B-201ENST00000312579 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.39■■■■□ 3.26
CCDC85B-201ENST00000312579 HECW1Q76N89 1606 aa35.36■■■■□ 3.25
CCDC85B-201ENST00000312579 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.33■■■■□ 3.25
CCDC85B-201ENST00000312579 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CCDC85B-201ENST00000312579 ATP10BO94823 1461 aa35.29■■■■□ 3.24
CCDC85B-201ENST00000312579 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
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CCDC85B-201ENST00000312579 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.25■■■■□ 3.23
CCDC85B-201ENST00000312579 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
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CCDC85B-201ENST00000312579 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.18■■■■□ 3.22
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CCDC85B-201ENST00000312579 TIAM1Q13009 1591 aa35.13■■■■□ 3.21
CCDC85B-201ENST00000312579 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.1■■■■□ 3.21
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CCDC85B-201ENST00000312579 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.07■■■■□ 3.2
CCDC85B-201ENST00000312579 MAP3K1Q13233 1512 aa35.05■■■■□ 3.2
CCDC85B-201ENST00000312579 ASXL2Q76L83 1435 aa35.05■■■■□ 3.2
CCDC85B-201ENST00000312579 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.03■■■■□ 3.2
CCDC85B-201ENST00000312579 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
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CCDC85B-201ENST00000312579 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.98■■■■□ 3.19
CCDC85B-201ENST00000312579 MAPKBP1O60336 1514 aa34.96■■■■□ 3.19
CCDC85B-201ENST00000312579 KCNH8Q96L42 1107 aa34.96■■■■□ 3.19
CCDC85B-201ENST00000312579 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.96■■■■□ 3.19
CCDC85B-201ENST00000312579 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CCDC85B-201ENST00000312579 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.89■■■■□ 3.18
CCDC85B-201ENST00000312579 KIF14Q15058 1648 aa34.86■■■■□ 3.17
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CCDC85B-201ENST00000312579 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.72■■■■□ 3.15
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CCDC85B-201ENST00000312579 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.65■■■■□ 3.14
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CCDC85B-201ENST00000312579 GLI2P10070 1586 aa34.63■■■■□ 3.13
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CCDC85B-201ENST00000312579 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.55■■■■□ 3.12
CCDC85B-201ENST00000312579 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.53■■■■□ 3.12
CCDC85B-201ENST00000312579 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.52■■■■□ 3.12
CCDC85B-201ENST00000312579 PLCH2O75038 1416 aa34.52■■■■□ 3.12
CCDC85B-201ENST00000312579 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.49■■■■□ 3.11
CCDC85B-201ENST00000312579 PREX2Q70Z35 1606 aa34.49■■■■□ 3.11
CCDC85B-201ENST00000312579 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
CCDC85B-201ENST00000312579 TSPOAP1O95153 1857 aa34.49■■■■□ 3.11
CCDC85B-201ENST00000312579 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.46■■■■□ 3.11
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