RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299179.9

MRPL43-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPL43, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL43-201ENST00000299179 CUL7Q14999 1698 aa28■■■□□ 2.07
MRPL43-201ENST00000299179 IGF1RP08069 1367 aa27.99■■■□□ 2.07
MRPL43-201ENST00000299179 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.92■■■□□ 2.06
MRPL43-201ENST00000299179 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
MRPL43-201ENST00000299179 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.87■■■□□ 2.05
MRPL43-201ENST00000299179 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
MRPL43-201ENST00000299179 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
MRPL43-201ENST00000299179 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.74■■■□□ 2.03
MRPL43-201ENST00000299179 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.73■■■□□ 2.03
MRPL43-201ENST00000299179 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.73■■■□□ 2.03
MRPL43-201ENST00000299179 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.73■■■□□ 2.03
MRPL43-201ENST00000299179 PTPRGP23470 1445 aa27.7■■■□□ 2.03
MRPL43-201ENST00000299179 MAPKBP1O60336 1514 aa27.7■■■□□ 2.02
MRPL43-201ENST00000299179 IQGAP2Q13576 1575 aa27.69■■■□□ 2.02
MRPL43-201ENST00000299179 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.68■■■□□ 2.02
MRPL43-201ENST00000299179 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.64■■■□□ 2.02
MRPL43-201ENST00000299179 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.64■■■□□ 2.01
MRPL43-201ENST00000299179 DIP2BQ9P265 1576 aa27.6■■■□□ 2.01
MRPL43-201ENST00000299179 ABCC2Q92887 1545 aa27.51■■■□□ 2
MRPL43-201ENST00000299179 DISP1Q96F81 1524 aa27.48■■□□□ 1.99
MRPL43-201ENST00000299179 UACAQ9BZF9 1416 aa27.48■■□□□ 1.99
MRPL43-201ENST00000299179 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.46■■□□□ 1.99
MRPL43-201ENST00000299179 TSPOAP1O95153 1857 aa27.45■■□□□ 1.99
MRPL43-201ENST00000299179 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.44■■□□□ 1.98
MRPL43-201ENST00000299179 ASXL2Q76L83 1435 aa27.43■■□□□ 1.98
MRPL43-201ENST00000299179 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.43■■□□□ 1.98
MRPL43-201ENST00000299179 KDM6BO15054 1643 aa27.41■■□□□ 1.98
MRPL43-201ENST00000299179 KIAA0556O60303 1618 aa27.41■■□□□ 1.98
MRPL43-201ENST00000299179 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.39■■□□□ 1.97
MRPL43-201ENST00000299179 GOLGA3Q08378 1498 aa27.35■■□□□ 1.97
MRPL43-201ENST00000299179 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.31■■□□□ 1.96
MRPL43-201ENST00000299179 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
MRPL43-201ENST00000299179 PRXQ9BXM0 1461 aa27.29■■□□□ 1.96
MRPL43-201ENST00000299179 GLI2P10070 1586 aa27.29■■□□□ 1.96
MRPL43-201ENST00000299179 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
MRPL43-201ENST00000299179 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
MRPL43-201ENST00000299179 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.18■■□□□ 1.94
MRPL43-201ENST00000299179 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.18■■□□□ 1.94
MRPL43-201ENST00000299179 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.17■■□□□ 1.94
MRPL43-201ENST00000299179 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
MRPL43-201ENST00000299179 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.15■■□□□ 1.94
MRPL43-201ENST00000299179 P3H3Q8IVL6 736 aa27.12■■□□□ 1.93
MRPL43-201ENST00000299179 ABCA8O94911 1581 aa27.12■■□□□ 1.93
MRPL43-201ENST00000299179 KCNH8Q96L42 1107 aa27.11■■□□□ 1.93
MRPL43-201ENST00000299179 EEA1Q15075 1411 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL43-201ENST00000299179 ARID3CA6NKF2 412 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL43-201ENST00000299179 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.03■■□□□ 1.92
MRPL43-201ENST00000299179 CD109Q6YHK3 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
MRPL43-201ENST00000299179 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
MRPL43-201ENST00000299179 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.98■■□□□ 1.91
MRPL43-201ENST00000299179 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
MRPL43-201ENST00000299179 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
MRPL43-201ENST00000299179 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
MRPL43-201ENST00000299179 SAMD9Q5K651 1589 aa26.95■■□□□ 1.9
MRPL43-201ENST00000299179 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.94■■□□□ 1.9
MRPL43-201ENST00000299179 ATP10BO94823 1461 aa26.91■■□□□ 1.9
MRPL43-201ENST00000299179 ADGRL1O94910 1474 aa26.9■■□□□ 1.9
MRPL43-201ENST00000299179 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.9■■□□□ 1.9
MRPL43-201ENST00000299179 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.84■■□□□ 1.89
MRPL43-201ENST00000299179 KIF21BO75037 1637 aa26.81■■□□□ 1.88
MRPL43-201ENST00000299179 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.79■■□□□ 1.88
MRPL43-201ENST00000299179 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.76■■□□□ 1.87
MRPL43-201ENST00000299179 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.76■■□□□ 1.87
MRPL43-201ENST00000299179 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
MRPL43-201ENST00000299179 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
MRPL43-201ENST00000299179 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.76■■□□□ 1.87
MRPL43-201ENST00000299179 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.73■■□□□ 1.87
MRPL43-201ENST00000299179 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.73■■□□□ 1.87
MRPL43-201ENST00000299179 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.72■■□□□ 1.87
MRPL43-201ENST00000299179 NEO1Q92859 1461 aa26.67■■□□□ 1.86
MRPL43-201ENST00000299179 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
MRPL43-201ENST00000299179 RAPGEF3O95398 923 aa26.63■■□□□ 1.85
MRPL43-201ENST00000299179 FMN1Q68DA7 1419 aa26.56■■□□□ 1.84
MRPL43-201ENST00000299179 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
MRPL43-201ENST00000299179 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
MRPL43-201ENST00000299179 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.54■■□□□ 1.84
MRPL43-201ENST00000299179 FANCAO15360 1455 aa26.52■■□□□ 1.84
MRPL43-201ENST00000299179 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
MRPL43-201ENST00000299179 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
MRPL43-201ENST00000299179 HECW1Q76N89 1606 aa26.5■■□□□ 1.83
MRPL43-201ENST00000299179 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.5■■□□□ 1.83
MRPL43-201ENST00000299179 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
MRPL43-201ENST00000299179 AKNAQ7Z591 1439 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL43-201ENST00000299179 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.48■■□□□ 1.83
MRPL43-201ENST00000299179 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.48■■□□□ 1.83
MRPL43-201ENST00000299179 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPL43-201ENST00000299179 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.4■■□□□ 1.82
MRPL43-201ENST00000299179 RICTORQ6R327 1708 aa26.39■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 PLCH2O75038 1416 aa26.37■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 CLIP1P30622 1438 aa26.37■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 PTPRMP28827 1452 aa26.36■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.36■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 KIF14Q15058 1648 aa26.36■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.35■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.34■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.34■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.33■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.33■■□□□ 1.81
MRPL43-201ENST00000299179 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.32■■□□□ 1.8
MRPL43-201ENST00000299179 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms