RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291281.8

PRKD2-201, Transcript of protein kinase D2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKD2, Length 3,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2-201ENST00000291281 IGF1RP08069 1367 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKD2-201ENST00000291281 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRKD2-201ENST00000291281 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKD2-201ENST00000291281 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKD2-201ENST00000291281 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PRKD2-201ENST00000291281 TOPBP1Q92547 1522 aa22.04■■□□□ 1.12
PRKD2-201ENST00000291281 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.03■■□□□ 1.12
PRKD2-201ENST00000291281 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PRKD2-201ENST00000291281 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.02■■□□□ 1.12
PRKD2-201ENST00000291281 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.02■■□□□ 1.12
PRKD2-201ENST00000291281 MAPKBP1O60336 1514 aa21.99■■□□□ 1.11
PRKD2-201ENST00000291281 MAP3K1Q13233 1512 aa21.99■■□□□ 1.11
PRKD2-201ENST00000291281 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PRKD2-201ENST00000291281 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.95■■□□□ 1.1
PRKD2-201ENST00000291281 ITGAEP38570 1179 aa21.94■■□□□ 1.1
PRKD2-201ENST00000291281 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.93■■□□□ 1.1
PRKD2-201ENST00000291281 TIAM1Q13009 1591 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKD2-201ENST00000291281 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKD2-201ENST00000291281 PRDM2Q13029 1718 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKD2-201ENST00000291281 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.88■■□□□ 1.09
PRKD2-201ENST00000291281 KCNH8Q96L42 1107 aa21.82■■□□□ 1.08
PRKD2-201ENST00000291281 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.82■■□□□ 1.08
PRKD2-201ENST00000291281 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.81■■□□□ 1.08
PRKD2-201ENST00000291281 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PRKD2-201ENST00000291281 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.81■■□□□ 1.08
PRKD2-201ENST00000291281 WDR97A6NE52 1622 aa21.8■■□□□ 1.08
PRKD2-201ENST00000291281 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PRKD2-201ENST00000291281 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.084e-7■■■■□ 22.4
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PRKD2-201ENST00000291281 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.77■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 FBLN2P98095 1184 aa21.76■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.76■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 ERCC6Q03468 1493 aa21.76■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.75■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.74■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.73■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.73■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 CCER2I3L3R5 266 aa21.72■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 FKBP8Q14318 412 aa21.71■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PRKD2-201ENST00000291281 NEFLP07196 543 aa21.67■■□□□ 1.06
PRKD2-201ENST00000291281 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PRKD2-201ENST00000291281 BCANQ96GW7 911 aa21.66■■□□□ 1.06
PRKD2-201ENST00000291281 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.66■■□□□ 1.06
PRKD2-201ENST00000291281 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
PRKD2-201ENST00000291281 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.64■■□□□ 1.05
PRKD2-201ENST00000291281 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PRKD2-201ENST00000291281 ANP32CO43423 234 aa21.61■■□□□ 1.05
PRKD2-201ENST00000291281 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.57■■□□□ 1.04
PRKD2-201ENST00000291281 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PRKD2-201ENST00000291281 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.53■■□□□ 1.04
PRKD2-201ENST00000291281 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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PRKD2-201ENST00000291281 TONSLQ96HA7 1378 aa21.48■■□□□ 1.03
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PRKD2-201ENST00000291281 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKD2-201ENST00000291281 CUL7Q14999 1698 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKD2-201ENST00000291281 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKD2-201ENST00000291281 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKD2-201ENST00000291281 UACAQ9BZF9 1416 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKD2-201ENST00000291281 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PRKD2-201ENST00000291281 HFM1A2PYH4 1435 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKD2-201ENST00000291281 GRIN2BQ13224 1484 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKD2-201ENST00000291281 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKD2-201ENST00000291281 IFT140Q96RY7 1462 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKD2-201ENST00000291281 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.39■■□□□ 1.02
PRKD2-201ENST00000291281 FMN1Q68DA7 1419 aa21.38■■□□□ 1.01
PRKD2-201ENST00000291281 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.38■■□□□ 1.01
PRKD2-201ENST00000291281 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKD2-201ENST00000291281 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.34■■□□□ 1.01
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PRKD2-201ENST00000291281 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.33■■□□□ 1
PRKD2-201ENST00000291281 PTPRKQ15262 1439 aa21.31■■□□□ 1
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PRKD2-201ENST00000291281 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.3■■□□□ 1
PRKD2-201ENST00000291281 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.28■■□□□ 1
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PRKD2-201ENST00000291281 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PRKD2-201ENST00000291281 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.22■□□□□ 0.99
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PRKD2-201ENST00000291281 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.22■□□□□ 0.99
PRKD2-201ENST00000291281 IQGAP2Q13576 1575 aa21.2■□□□□ 0.98
PRKD2-201ENST00000291281 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.2■□□□□ 0.98
PRKD2-201ENST00000291281 HECW1Q76N89 1606 aa21.2■□□□□ 0.98
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