RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273153.9

CSRNP1-201, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRNP1, Length 3,148 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1-201ENST00000273153 NCAPD3P42695 1498 aa25.16■■□□□ 1.62
CSRNP1-201ENST00000273153 CFTRP13569 1480 aa25.14■■□□□ 1.62
CSRNP1-201ENST00000273153 WDR97A6NE52 1622 aa25.12■■□□□ 1.61
CSRNP1-201ENST00000273153 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.12■■□□□ 1.61
CSRNP1-201ENST00000273153 TRIM52Q96A61 297 aa25.11■■□□□ 1.61
CSRNP1-201ENST00000273153 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1-201ENST00000273153 FKBP8Q14318 412 aa25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1-201ENST00000273153 TIAM1Q13009 1591 aa25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1-201ENST00000273153 HMGXB3Q12766 1538 aa25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1-201ENST00000273153 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.04■■□□□ 1.6
CSRNP1-201ENST00000273153 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.01■■□□□ 1.59
CSRNP1-201ENST00000273153 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25■■□□□ 1.59
CSRNP1-201ENST00000273153 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CSRNP1-201ENST00000273153 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1-201ENST00000273153 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1-201ENST00000273153 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1-201ENST00000273153 ANP32CO43423 234 aa24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1-201ENST00000273153 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CSRNP1-201ENST00000273153 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.81■■□□□ 1.56
CSRNP1-201ENST00000273153 TONSLQ96HA7 1378 aa24.77■■□□□ 1.56
CSRNP1-201ENST00000273153 NEFLP07196 543 aa24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1-201ENST00000273153 ARID3CA6NKF2 412 aa24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1-201ENST00000273153 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1-201ENST00000273153 MAP3K1Q13233 1512 aa24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1-201ENST00000273153 PTPRKQ15262 1439 aa24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1-201ENST00000273153 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1-201ENST00000273153 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1-201ENST00000273153 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1-201ENST00000273153 NESP48681 1621 aa24.69■■□□□ 1.54
CSRNP1-201ENST00000273153 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.69■■□□□ 1.54
CSRNP1-201ENST00000273153 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.68■■□□□ 1.54
CSRNP1-201ENST00000273153 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CSRNP1-201ENST00000273153 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.66■■□□□ 1.54
CSRNP1-201ENST00000273153 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
CSRNP1-201ENST00000273153 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.65■■□□□ 1.54
CSRNP1-201ENST00000273153 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.549e-7■■■■■ 34.8
CSRNP1-201ENST00000273153 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
CSRNP1-201ENST00000273153 CCER2I3L3R5 266 aa24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1-201ENST00000273153 FOXD1Q16676 465 aa24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1-201ENST00000273153 PRDM2Q13029 1718 aa24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1-201ENST00000273153 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1-201ENST00000273153 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1-201ENST00000273153 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1-201ENST00000273153 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1-201ENST00000273153 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1-201ENST00000273153 CCDC184Q52MB2 194 aa24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1-201ENST00000273153 TOPBP1Q92547 1522 aa24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1-201ENST00000273153 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1-201ENST00000273153 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1-201ENST00000273153 NAIPQ13075 1403 aa24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 UACAQ9BZF9 1416 aa24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 NCOA2Q15596 1464 aa24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 HFM1A2PYH4 1435 aa24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 FMN1Q68DA7 1419 aa24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1-201ENST00000273153 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1-201ENST00000273153 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1-201ENST00000273153 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1-201ENST00000273153 MSH5O43196 834 aa24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1-201ENST00000273153 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1-201ENST00000273153 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1-201ENST00000273153 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1-201ENST00000273153 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1-201ENST00000273153 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1-201ENST00000273153 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1-201ENST00000273153 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1-201ENST00000273153 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.36■■□□□ 1.49
CSRNP1-201ENST00000273153 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1-201ENST00000273153 KDM6BO15054 1643 aa24.35■■□□□ 1.49
CSRNP1-201ENST00000273153 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 32.6
CSRNP1-201ENST00000273153 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1-201ENST00000273153 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1-201ENST00000273153 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.33■■□□□ 1.49
CSRNP1-201ENST00000273153 GRIN2BQ13224 1484 aa24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1-201ENST00000273153 CUL7Q14999 1698 aa24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1-201ENST00000273153 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1-201ENST00000273153 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1-201ENST00000273153 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1-201ENST00000273153 MRS2Q9HD23 443 aa24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1-201ENST00000273153 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CSRNP1-201ENST00000273153 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1-201ENST00000273153 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1-201ENST00000273153 BCL11AQ9H165 835 aa24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1-201ENST00000273153 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1-201ENST00000273153 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1-201ENST00000273153 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1-201ENST00000273153 SAMD9Q5K651 1589 aa24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1-201ENST00000273153 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1-201ENST00000273153 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1-201ENST00000273153 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1-201ENST00000273153 CCDC7Q96M83 1385 aa24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1-201ENST00000273153 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1-201ENST00000273153 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1-201ENST00000273153 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1-201ENST00000273153 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.11■■□□□ 1.45
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