RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273153.9

CSRNP1-201, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRNP1, Length 3,148 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1-201ENST00000273153 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.02■■■■□ 3.2
CSRNP1-201ENST00000273153 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.99■■■□□ 2.55
CSRNP1-201ENST00000273153 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CSRNP1-201ENST00000273153 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.89■■■□□ 2.38
CSRNP1-201ENST00000273153 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
CSRNP1-201ENST00000273153 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.59■■■□□ 2.33
CSRNP1-201ENST00000273153 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.52■■■□□ 2.32
CSRNP1-201ENST00000273153 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.29■■■□□ 2.28
CSRNP1-201ENST00000273153 HRCP23327 699 aa29.21■■■□□ 2.27
CSRNP1-201ENST00000273153 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.19■■■□□ 2.26
CSRNP1-201ENST00000273153 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CSRNP1-201ENST00000273153 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.03■■■□□ 2.24
CSRNP1-201ENST00000273153 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.45■■■□□ 2.14
CSRNP1-201ENST00000273153 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.36■■■□□ 2.13
CSRNP1-201ENST00000273153 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CSRNP1-201ENST00000273153 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CSRNP1-201ENST00000273153 TRIM41Q8WV44 630 aa28.12■■■□□ 2.09
CSRNP1-201ENST00000273153 SCRIBQ14160 1630 aa28.09■■■□□ 2.09
CSRNP1-201ENST00000273153 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CSRNP1-201ENST00000273153 ABCC9O60706 1549 aa28■■■□□ 2.07
CSRNP1-201ENST00000273153 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.87■■■□□ 2.05
CSRNP1-201ENST00000273153 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1-201ENST00000273153 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CSRNP1-201ENST00000273153 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CSRNP1-201ENST00000273153 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1-201ENST00000273153 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
CSRNP1-201ENST00000273153 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CSRNP1-201ENST00000273153 WIZO95785 1651 aa27.35■■□□□ 1.97
CSRNP1-201ENST00000273153 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1-201ENST00000273153 NACADO15069 1562 aa27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1-201ENST00000273153 ABCC8Q09428 1581 aa27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1-201ENST00000273153 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.96■■□□□ 1.91
CSRNP1-201ENST00000273153 NEUROD1Q13562 356 aa26.93■■□□□ 1.9
CSRNP1-201ENST00000273153 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
CSRNP1-201ENST00000273153 SOGA1O94964 1423 aa26.88■■□□□ 1.89
CSRNP1-201ENST00000273153 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1-201ENST00000273153 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1-201ENST00000273153 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CSRNP1-201ENST00000273153 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1-201ENST00000273153 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.79■■□□□ 1.88
CSRNP1-201ENST00000273153 CEP162Q5TB80 1403 aa26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1-201ENST00000273153 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
CSRNP1-201ENST00000273153 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.69■■□□□ 1.86
CSRNP1-201ENST00000273153 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CSRNP1-201ENST00000273153 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.65■■□□□ 1.86
CSRNP1-201ENST00000273153 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1-201ENST00000273153 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1-201ENST00000273153 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1-201ENST00000273153 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1-201ENST00000273153 SMARCA2P51531 1590 aa26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1-201ENST00000273153 SMARCA4P51532 1647 aa26.57■■□□□ 1.84
CSRNP1-201ENST00000273153 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1-201ENST00000273153 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1-201ENST00000273153 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CSRNP1-201ENST00000273153 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1-201ENST00000273153 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.36■■□□□ 1.81
CSRNP1-201ENST00000273153 MIER1Q8N108 512 aa26.33■■□□□ 1.81
CSRNP1-201ENST00000273153 GOLGA3Q08378 1498 aa26.31■■□□□ 1.8
CSRNP1-201ENST00000273153 EEA1Q15075 1411 aa26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1-201ENST00000273153 CLIP1P30622 1438 aa26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1-201ENST00000273153 SYNJ1O43426 1573 aa26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1-201ENST00000273153 APLP2Q06481 763 aa26.16■■□□□ 1.78
CSRNP1-201ENST00000273153 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.11■■□□□ 1.77
CSRNP1-201ENST00000273153 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1-201ENST00000273153 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.05■■□□□ 1.76
CSRNP1-201ENST00000273153 VPS8Q8N3P4 1428 aa26■■□□□ 1.75
CSRNP1-201ENST00000273153 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1-201ENST00000273153 ITGAEP38570 1179 aa25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1-201ENST00000273153 KIF21BO75037 1637 aa25.9■■□□□ 1.74
CSRNP1-201ENST00000273153 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1-201ENST00000273153 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CSRNP1-201ENST00000273153 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1-201ENST00000273153 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1-201ENST00000273153 ARAP1Q96P48 1450 aa25.66■■□□□ 1.7
CSRNP1-201ENST00000273153 KCNH8Q96L42 1107 aa25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1-201ENST00000273153 TOP2BQ02880 1626 aa25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1-201ENST00000273153 PRXQ9BXM0 1461 aa25.54■■□□□ 1.68
CSRNP1-201ENST00000273153 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1-201ENST00000273153 CUX1P39880 1505 aa25.47■■□□□ 1.67
CSRNP1-201ENST00000273153 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1-201ENST00000273153 P3H3Q8IVL6 736 aa25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1-201ENST00000273153 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1-201ENST00000273153 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1-201ENST00000273153 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.41■■□□□ 1.66
CSRNP1-201ENST00000273153 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1-201ENST00000273153 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1-201ENST00000273153 KIF27Q86VH2 1401 aa25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1-201ENST00000273153 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1-201ENST00000273153 BCANQ96GW7 911 aa25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1-201ENST00000273153 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.39■■□□□ 1.65
CSRNP1-201ENST00000273153 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CSRNP1-201ENST00000273153 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CSRNP1-201ENST00000273153 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1-201ENST00000273153 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1-201ENST00000273153 CUX2O14529 1486 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1-201ENST00000273153 IGF1RP08069 1367 aa25.2■■□□□ 1.63
CSRNP1-201ENST00000273153 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1-201ENST00000273153 MAPKBP1O60336 1514 aa25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1-201ENST00000273153 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1-201ENST00000273153 MYT1Q01538 1121 aa25.17■■□□□ 1.62
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