RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269385.8

CBX8-201, Transcript of chromobox 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX8, Length 3,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8-201ENST00000269385 ITGAEP38570 1179 aa23.1■■□□□ 1.29
CBX8-201ENST00000269385 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.09■■□□□ 1.29
CBX8-201ENST00000269385 NBR1Q14596 966 aa23.05■■□□□ 1.28
CBX8-201ENST00000269385 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CBX8-201ENST00000269385 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.01■■□□□ 1.27
CBX8-201ENST00000269385 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23■■□□□ 1.27
CBX8-201ENST00000269385 KIF27Q86VH2 1401 aa22.97■■□□□ 1.27
CBX8-201ENST00000269385 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.97■■□□□ 1.27
CBX8-201ENST00000269385 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CBX8-201ENST00000269385 IGF1RP08069 1367 aa22.95■■□□□ 1.26
CBX8-201ENST00000269385 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CBX8-201ENST00000269385 NESP48681 1621 aa22.93■■□□□ 1.26
CBX8-201ENST00000269385 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.92■■□□□ 1.26
CBX8-201ENST00000269385 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.91■■□□□ 1.26
CBX8-201ENST00000269385 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.88■■□□□ 1.25
CBX8-201ENST00000269385 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.88■■□□□ 1.25
CBX8-201ENST00000269385 TOPBP1Q92547 1522 aa22.87■■□□□ 1.25
CBX8-201ENST00000269385 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.86■■□□□ 1.25
CBX8-201ENST00000269385 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.85■■□□□ 1.25
CBX8-201ENST00000269385 CUX2O14529 1486 aa22.84■■□□□ 1.25
CBX8-201ENST00000269385 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CBX8-201ENST00000269385 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.84■■□□□ 1.25
CBX8-201ENST00000269385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.83■■□□□ 1.25
CBX8-201ENST00000269385 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
CBX8-201ENST00000269385 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.82■■□□□ 1.24
CBX8-201ENST00000269385 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.82■■□□□ 1.24
CBX8-201ENST00000269385 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CBX8-201ENST00000269385 MSH5O43196 834 aa22.81■■□□□ 1.24
CBX8-201ENST00000269385 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CBX8-201ENST00000269385 MAP3K1Q13233 1512 aa22.78■■□□□ 1.24
CBX8-201ENST00000269385 CUL7Q14999 1698 aa22.77■■□□□ 1.23
CBX8-201ENST00000269385 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.76■■□□□ 1.23
CBX8-201ENST00000269385 SLC24A1O60721 1099 aa22.76■■□□□ 1.23
CBX8-201ENST00000269385 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.74■■□□□ 1.23
CBX8-201ENST00000269385 TIAM1Q13009 1591 aa22.74■■□□□ 1.23
CBX8-201ENST00000269385 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CBX8-201ENST00000269385 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CBX8-201ENST00000269385 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CBX8-201ENST00000269385 SAMD9Q5K651 1589 aa22.66■■□□□ 1.22
CBX8-201ENST00000269385 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.63■■□□□ 1.21
CBX8-201ENST00000269385 IL27Q8NEV9 243 aa22.63■■□□□ 1.21
CBX8-201ENST00000269385 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.63■■□□□ 1.21
CBX8-201ENST00000269385 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.59■■□□□ 1.21
CBX8-201ENST00000269385 PBRM1Q86U86 1689 aa22.57■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.56■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.54■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.53■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 TRIM52Q96A61 297 aa22.52■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.52■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CBX8-201ENST00000269385 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.191e-7■■■■■ 31.7
CBX8-201ENST00000269385 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CBX8-201ENST00000269385 MAPKBP1O60336 1514 aa22.47■■□□□ 1.19
CBX8-201ENST00000269385 PLEKHG5O94827 1062 aa22.44■■□□□ 1.18
CBX8-201ENST00000269385 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
CBX8-201ENST00000269385 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CBX8-201ENST00000269385 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.41■■□□□ 1.18
CBX8-201ENST00000269385 KCNH8Q96L42 1107 aa22.4■■□□□ 1.18
CBX8-201ENST00000269385 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CBX8-201ENST00000269385 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.37■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 ADAMTS12P58397 1594 aa22.37■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 ARHGEF11O15085 1522 aa22.36■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.36■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.36■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 GRIN2BQ13224 1484 aa22.36■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.36■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.36■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.35■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.34■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CBX8-201ENST00000269385 WDR62O43379 1518 aa22.31■■□□□ 1.16
CBX8-201ENST00000269385 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.3■■□□□ 1.16
CBX8-201ENST00000269385 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.29■■□□□ 1.16
CBX8-201ENST00000269385 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CBX8-201ENST00000269385 ERCC6Q03468 1493 aa22.23■■□□□ 1.15
CBX8-201ENST00000269385 NEFMP07197 916 aa22.23■■□□□ 1.15
CBX8-201ENST00000269385 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CBX8-201ENST00000269385 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.155e-6■■■■■ 46.2
CBX8-201ENST00000269385 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.2■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 PTPRKQ15262 1439 aa22.17■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.16■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 ANP32CO43423 234 aa22.16■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 IQGAP2Q13576 1575 aa22.14■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 FMN1Q68DA7 1419 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms