RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262055.8

LETMD1-201, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LETMD1, Length 2,112 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-201ENST00000262055 NUP160Q12769 1436 aa23.47■■□□□ 1.35
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LETMD1-201ENST00000262055 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LETMD1-201ENST00000262055 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.37■■□□□ 1.33
LETMD1-201ENST00000262055 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.36■■□□□ 1.33
LETMD1-201ENST00000262055 MYT1Q01538 1121 aa23.36■■□□□ 1.33
LETMD1-201ENST00000262055 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.36■■□□□ 1.33
LETMD1-201ENST00000262055 IQGAP2Q13576 1575 aa23.35■■□□□ 1.33
LETMD1-201ENST00000262055 OSCARQ8IYS5 282 aa23.33■■□□□ 1.33
LETMD1-201ENST00000262055 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
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LETMD1-201ENST00000262055 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.22■■□□□ 1.31
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LETMD1-201ENST00000262055 CEP162Q5TB80 1403 aa23.22■■□□□ 1.31
LETMD1-201ENST00000262055 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.2■■□□□ 1.3
LETMD1-201ENST00000262055 DISP1Q96F81 1524 aa23.18■■□□□ 1.3
LETMD1-201ENST00000262055 SAMD9Q5K651 1589 aa23.18■■□□□ 1.3
LETMD1-201ENST00000262055 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.17■■□□□ 1.3
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LETMD1-201ENST00000262055 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
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LETMD1-201ENST00000262055 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.1■■□□□ 1.29
LETMD1-201ENST00000262055 ARAP1Q96P48 1450 aa23.09■■□□□ 1.29
LETMD1-201ENST00000262055 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.08■■□□□ 1.29
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LETMD1-201ENST00000262055 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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LETMD1-201ENST00000262055 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23■■□□□ 1.27
LETMD1-201ENST00000262055 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23■■□□□ 1.27
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LETMD1-201ENST00000262055 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.89■■□□□ 1.25
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LETMD1-201ENST00000262055 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.87■■□□□ 1.25
LETMD1-201ENST00000262055 FMN1Q68DA7 1419 aa22.86■■□□□ 1.25
LETMD1-201ENST00000262055 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.86■■□□□ 1.25
LETMD1-201ENST00000262055 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
LETMD1-201ENST00000262055 ABCA8O94911 1581 aa22.84■■□□□ 1.25
LETMD1-201ENST00000262055 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LETMD1-201ENST00000262055 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.84■■□□□ 1.25
LETMD1-201ENST00000262055 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.83■■□□□ 1.25
LETMD1-201ENST00000262055 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.79■■□□□ 1.24
LETMD1-201ENST00000262055 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.79■■□□□ 1.24
LETMD1-201ENST00000262055 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.79■■□□□ 1.24
LETMD1-201ENST00000262055 UACAQ9BZF9 1416 aa22.78■■□□□ 1.24
LETMD1-201ENST00000262055 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
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LETMD1-201ENST00000262055 ABCC2Q92887 1545 aa22.75■■□□□ 1.23
LETMD1-201ENST00000262055 ARID3CA6NKF2 412 aa22.75■■□□□ 1.23
LETMD1-201ENST00000262055 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
LETMD1-201ENST00000262055 HECW1Q76N89 1606 aa22.74■■□□□ 1.23
LETMD1-201ENST00000262055 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
LETMD1-201ENST00000262055 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.71■■□□□ 1.23
LETMD1-201ENST00000262055 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
LETMD1-201ENST00000262055 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LETMD1-201ENST00000262055 ATP10BO94823 1461 aa22.66■■□□□ 1.22
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LETMD1-201ENST00000262055 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.64■■□□□ 1.21
LETMD1-201ENST00000262055 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.64■■□□□ 1.21
LETMD1-201ENST00000262055 TIAM1Q13009 1591 aa22.62■■□□□ 1.21
LETMD1-201ENST00000262055 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.6■■□□□ 1.21
LETMD1-201ENST00000262055 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.6■■□□□ 1.21
LETMD1-201ENST00000262055 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
LETMD1-201ENST00000262055 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
LETMD1-201ENST00000262055 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LETMD1-201ENST00000262055 MAP3K1Q13233 1512 aa22.55■■□□□ 1.2
LETMD1-201ENST00000262055 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.5■■□□□ 1.19
LETMD1-201ENST00000262055 APLP2Q06481 763 aa22.5■■□□□ 1.19
LETMD1-201ENST00000262055 ASXL2Q76L83 1435 aa22.47■■□□□ 1.19
LETMD1-201ENST00000262055 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
LETMD1-201ENST00000262055 KIF14Q15058 1648 aa22.45■■□□□ 1.18
LETMD1-201ENST00000262055 MAPKBP1O60336 1514 aa22.45■■□□□ 1.18
LETMD1-201ENST00000262055 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.44■■□□□ 1.18
LETMD1-201ENST00000262055 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
LETMD1-201ENST00000262055 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.44■■□□□ 1.18
LETMD1-201ENST00000262055 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.43■■□□□ 1.18
LETMD1-201ENST00000262055 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.43■■□□□ 1.18
LETMD1-201ENST00000262055 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
LETMD1-201ENST00000262055 KCNH8Q96L42 1107 aa22.39■■□□□ 1.17
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LETMD1-201ENST00000262055 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LETMD1-201ENST00000262055 NCOA2Q15596 1464 aa22.35■■□□□ 1.17
LETMD1-201ENST00000262055 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.35■■□□□ 1.17
LETMD1-201ENST00000262055 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
LETMD1-201ENST00000262055 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.33■■□□□ 1.16
LETMD1-201ENST00000262055 DIP2BQ9P265 1576 aa22.31■■□□□ 1.16
LETMD1-201ENST00000262055 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.31■■□□□ 1.16
LETMD1-201ENST00000262055 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.3■■□□□ 1.16
LETMD1-201ENST00000262055 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.29■■□□□ 1.16
LETMD1-201ENST00000262055 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.29■■□□□ 1.16
LETMD1-201ENST00000262055 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.24■■□□□ 1.15
LETMD1-201ENST00000262055 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LETMD1-201ENST00000262055 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.23■■□□□ 1.15
LETMD1-201ENST00000262055 GLI2P10070 1586 aa22.23■■□□□ 1.15
LETMD1-201ENST00000262055 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.22■■□□□ 1.15
LETMD1-201ENST00000262055 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.21■■□□□ 1.15
LETMD1-201ENST00000262055 PREX2Q70Z35 1606 aa22.21■■□□□ 1.15
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