RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261647.9

TTC19-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC19, Length 3,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-201ENST00000261647 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TTC19-201ENST00000261647 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TTC19-201ENST00000261647 KIF27Q86VH2 1401 aa26.7■■□□□ 1.86
TTC19-201ENST00000261647 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.66■■□□□ 1.86
TTC19-201ENST00000261647 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.63■■□□□ 1.85
TTC19-201ENST00000261647 P3H3Q8IVL6 736 aa26.62■■□□□ 1.85
TTC19-201ENST00000261647 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TTC19-201ENST00000261647 NEFLP07196 543 aa26.61■■□□□ 1.85
TTC19-201ENST00000261647 ANP32CO43423 234 aa26.54■■□□□ 1.84
TTC19-201ENST00000261647 TIAM1Q13009 1591 aa26.51■■□□□ 1.83
TTC19-201ENST00000261647 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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TTC19-201ENST00000261647 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.48■■□□□ 1.83
TTC19-201ENST00000261647 IGF1RP08069 1367 aa26.48■■□□□ 1.83
TTC19-201ENST00000261647 CCER2I3L3R5 266 aa26.45■■□□□ 1.82
TTC19-201ENST00000261647 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.37■■□□□ 1.81
TTC19-201ENST00000261647 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
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TTC19-201ENST00000261647 TONSLQ96HA7 1378 aa26.29■■□□□ 1.8
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TTC19-201ENST00000261647 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.26■■□□□ 1.79
TTC19-201ENST00000261647 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TTC19-201ENST00000261647 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.19■■□□□ 1.78
TTC19-201ENST00000261647 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.19■■□□□ 1.78
TTC19-201ENST00000261647 HMGXB3Q12766 1538 aa26.18■■□□□ 1.78
TTC19-201ENST00000261647 CCDC184Q52MB2 194 aa26.17■■□□□ 1.78
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TTC19-201ENST00000261647 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.14■■□□□ 1.78
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TTC19-201ENST00000261647 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.11■■□□□ 1.77
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TTC19-201ENST00000261647 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.779e-7■■■■□ 21.9
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TTC19-201ENST00000261647 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TTC19-201ENST00000261647 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC19-201ENST00000261647 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.02■■□□□ 1.76
TTC19-201ENST00000261647 UACAQ9BZF9 1416 aa26.02■■□□□ 1.76
TTC19-201ENST00000261647 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.01■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.01■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.01■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.99■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.98■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.98■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.98■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 HFM1A2PYH4 1435 aa25.97■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.97■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.96■■□□□ 1.75
TTC19-201ENST00000261647 NAIPQ13075 1403 aa25.96■■□□□ 1.75
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TTC19-201ENST00000261647 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.94■■□□□ 1.74
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TTC19-201ENST00000261647 MRS2Q9HD23 443 aa25.87■■□□□ 1.73
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TTC19-201ENST00000261647 NCOA2Q15596 1464 aa25.82■■□□□ 1.72
TTC19-201ENST00000261647 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.82■■□□□ 1.72
TTC19-201ENST00000261647 PRDM2Q13029 1718 aa25.81■■□□□ 1.72
TTC19-201ENST00000261647 FMN1Q68DA7 1419 aa25.8■■□□□ 1.72
TTC19-201ENST00000261647 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
TTC19-201ENST00000261647 NBR1Q14596 966 aa25.8■■□□□ 1.72
TTC19-201ENST00000261647 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.79■■□□□ 1.72
TTC19-201ENST00000261647 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.79■■□□□ 1.72
TTC19-201ENST00000261647 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.78■■□□□ 1.72
TTC19-201ENST00000261647 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
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TTC19-201ENST00000261647 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.74■■□□□ 1.71
TTC19-201ENST00000261647 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.74■■□□□ 1.71
TTC19-201ENST00000261647 CCDC7Q96M83 1385 aa25.73■■□□□ 1.71
TTC19-201ENST00000261647 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.73■■□□□ 1.71
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TTC19-201ENST00000261647 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.68■■□□□ 1.7
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TTC19-201ENST00000261647 NCOA1Q15788 1441 aa25.66■■□□□ 1.7
TTC19-201ENST00000261647 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
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TTC19-201ENST00000261647 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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TTC19-201ENST00000261647 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.64■■□□□ 1.7
TTC19-201ENST00000261647 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.64■■□□□ 1.7
TTC19-201ENST00000261647 GRIN2BQ13224 1484 aa25.62■■□□□ 1.69
TTC19-201ENST00000261647 TOPBP1Q92547 1522 aa25.62■■□□□ 1.69
TTC19-201ENST00000261647 NESP48681 1621 aa25.59■■□□□ 1.69
TTC19-201ENST00000261647 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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TTC19-201ENST00000261647 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.56■■□□□ 1.68
TTC19-201ENST00000261647 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.54■■□□□ 1.68
TTC19-201ENST00000261647 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.54■■□□□ 1.68
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