RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251775.8

SNX4-201, Transcript of sorting nexin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX4, Length 2,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4-201ENST00000251775 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SNX4-201ENST00000251775 MAP3K1Q13233 1512 aa27.71■■■□□ 2.03
SNX4-201ENST00000251775 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.71■■■□□ 2.03
SNX4-201ENST00000251775 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SNX4-201ENST00000251775 CUL7Q14999 1698 aa27.65■■■□□ 2.02
SNX4-201ENST00000251775 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.64■■■□□ 2.02
SNX4-201ENST00000251775 WDR97A6NE52 1622 aa27.63■■■□□ 2.01
SNX4-201ENST00000251775 P3H3Q8IVL6 736 aa27.61■■■□□ 2.01
SNX4-201ENST00000251775 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.61■■■□□ 2.01
SNX4-201ENST00000251775 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.61■■■□□ 2.01
SNX4-201ENST00000251775 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
SNX4-201ENST00000251775 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.58■■■□□ 2.01
SNX4-201ENST00000251775 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.57■■■□□ 2
SNX4-201ENST00000251775 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.57■■■□□ 2
SNX4-201ENST00000251775 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.55■■■□□ 2
SNX4-201ENST00000251775 ITGAEP38570 1179 aa27.55■■■□□ 2
SNX4-201ENST00000251775 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.53■■■□□ 2
SNX4-201ENST00000251775 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.51■■□□□ 1.99
SNX4-201ENST00000251775 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SNX4-201ENST00000251775 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.5■■□□□ 1.99
SNX4-201ENST00000251775 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.49■■□□□ 1.99
SNX4-201ENST00000251775 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SNX4-201ENST00000251775 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.48■■□□□ 1.99
SNX4-201ENST00000251775 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.45■■□□□ 1.98
SNX4-201ENST00000251775 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SNX4-201ENST00000251775 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.43■■□□□ 1.98
SNX4-201ENST00000251775 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.42■■□□□ 1.98
SNX4-201ENST00000251775 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.981e-6■■■■□ 26.1
SNX4-201ENST00000251775 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.41■■□□□ 1.98
SNX4-201ENST00000251775 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SNX4-201ENST00000251775 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SNX4-201ENST00000251775 FMN1Q68DA7 1419 aa27.33■■□□□ 1.97
SNX4-201ENST00000251775 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.33■■□□□ 1.97
SNX4-201ENST00000251775 SAMD9Q5K651 1589 aa27.33■■□□□ 1.97
SNX4-201ENST00000251775 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX4-201ENST00000251775 MAPKBP1O60336 1514 aa27.3■■□□□ 1.96
SNX4-201ENST00000251775 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.27■■□□□ 1.96
SNX4-201ENST00000251775 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.26■■□□□ 1.95
SNX4-201ENST00000251775 PBRM1Q86U86 1689 aa27.2■■□□□ 1.94
SNX4-201ENST00000251775 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
SNX4-201ENST00000251775 GRIN2BQ13224 1484 aa27.18■■□□□ 1.94
SNX4-201ENST00000251775 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.15■■□□□ 1.94
SNX4-201ENST00000251775 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.15■■□□□ 1.94
SNX4-201ENST00000251775 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.11■■□□□ 1.93
SNX4-201ENST00000251775 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.11■■□□□ 1.93
SNX4-201ENST00000251775 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SNX4-201ENST00000251775 ADAMTS12P58397 1594 aa27.07■■□□□ 1.92
SNX4-201ENST00000251775 NCOA2Q15596 1464 aa27.06■■□□□ 1.92
SNX4-201ENST00000251775 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.06■■□□□ 1.92
SNX4-201ENST00000251775 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SNX4-201ENST00000251775 KCNH8Q96L42 1107 aa27.04■■□□□ 1.92
SNX4-201ENST00000251775 IQGAP2Q13576 1575 aa27.02■■□□□ 1.92
SNX4-201ENST00000251775 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.02■■□□□ 1.92
SNX4-201ENST00000251775 PTPRKQ15262 1439 aa27.01■■□□□ 1.91
SNX4-201ENST00000251775 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27■■□□□ 1.91
SNX4-201ENST00000251775 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27■■□□□ 1.91
SNX4-201ENST00000251775 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX4-201ENST00000251775 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.95■■□□□ 1.9
SNX4-201ENST00000251775 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SNX4-201ENST00000251775 ARHGEF11O15085 1522 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX4-201ENST00000251775 HECW1Q76N89 1606 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX4-201ENST00000251775 HFM1A2PYH4 1435 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX4-201ENST00000251775 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX4-201ENST00000251775 IFT140Q96RY7 1462 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX4-201ENST00000251775 WDR62O43379 1518 aa26.91■■□□□ 1.9
SNX4-201ENST00000251775 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.89■■□□□ 1.89
SNX4-201ENST00000251775 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SNX4-201ENST00000251775 NAIPQ13075 1403 aa26.87■■□□□ 1.89
SNX4-201ENST00000251775 BCANQ96GW7 911 aa26.87■■□□□ 1.89
SNX4-201ENST00000251775 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SNX4-201ENST00000251775 UACAQ9BZF9 1416 aa26.84■■□□□ 1.89
SNX4-201ENST00000251775 FKBP8Q14318 412 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX4-201ENST00000251775 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SNX4-201ENST00000251775 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SNX4-201ENST00000251775 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SNX4-201ENST00000251775 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX4-201ENST00000251775 ARID3CA6NKF2 412 aa26.76■■□□□ 1.87
SNX4-201ENST00000251775 KIAA0556O60303 1618 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX4-201ENST00000251775 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SNX4-201ENST00000251775 DISP1Q96F81 1524 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX4-201ENST00000251775 GRIN2AQ12879 1464 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX4-201ENST00000251775 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX4-201ENST00000251775 BCL11AQ9H165 835 aa26.71■■□□□ 1.87
SNX4-201ENST00000251775 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.71■■□□□ 1.87
SNX4-201ENST00000251775 TONSLQ96HA7 1378 aa26.7■■□□□ 1.86
SNX4-201ENST00000251775 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.7■■□□□ 1.86
SNX4-201ENST00000251775 MIA2Q96PC5 1412 aa26.69■■□□□ 1.86
SNX4-201ENST00000251775 ERCC6Q03468 1493 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX4-201ENST00000251775 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SNX4-201ENST00000251775 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SNX4-201ENST00000251775 KDM6BO15054 1643 aa26.64■■□□□ 1.86
SNX4-201ENST00000251775 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SNX4-201ENST00000251775 AKNAQ7Z591 1439 aa26.63■■□□□ 1.85
SNX4-201ENST00000251775 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.63■■□□□ 1.85
SNX4-201ENST00000251775 NEFLP07196 543 aa26.61■■□□□ 1.85
SNX4-201ENST00000251775 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SNX4-201ENST00000251775 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SNX4-201ENST00000251775 CCER2I3L3R5 266 aa26.58■■□□□ 1.85
SNX4-201ENST00000251775 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.58■■□□□ 1.85
SNX4-201ENST00000251775 CEP170Q5SW79 1584 aa26.58■■□□□ 1.85
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