RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000164147.7

Rbms1-209, Transcript of RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rbms1, Length 2,543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa27.02■■□□□ 1.92
Rbms1-209ENSMUST00000164147 SynmQ70IV5 1561 aa26.99■■□□□ 1.91
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cux1P53564 1515 aa26.99■■□□□ 1.91
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Plb1Q3TTY0 1478 aa26.94■■□□□ 1.9
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Erich3F6QRE9 1637 aa26.89■■□□□ 1.9
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Pcf11G3X9Z4 1553 aa26.86■■□□□ 1.89
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Neurod1Q60867 357 aa26.85■■□□□ 1.89
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Naip1Q9QWK5 1403 aa26.84■■□□□ 1.89
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Tiam1Q60610 1591 aa26.83■■□□□ 1.89
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Pla2r1Q62028 1487 aa26.81■■□□□ 1.88
Rbms1-209ENSMUST00000164147 BlmO88700 1416 aa26.8■■□□□ 1.88
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Magi3Q9EQJ9 1476 aa26.79■■□□□ 1.88
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Lmod2Q3UHZ5 550 aa26.77■■□□□ 1.88
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Slx4Q6P1D7 1565 aa26.77■■□□□ 1.88
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Disp1Q3TDN0 1521 aa26.76■■□□□ 1.87
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa26.76■■□□□ 1.87
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Fyco1Q8VDC1 1437 aa26.75■■□□□ 1.87
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Grin2aP35436 1464 aa26.73■■□□□ 1.87
Rbms1-209ENSMUST00000164147 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Aebp1Q640N1 1128 aa26.71■■□□□ 1.87
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Sall2Q9QX96 1004 aa26.71■■□□□ 1.87
Rbms1-209ENSMUST00000164147 CntlnA2AM05 1397 aa26.66■■□□□ 1.86
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
Rbms1-209ENSMUST00000164147 CadpsQ80TJ1 1355 aa26.63■■□□□ 1.85
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Rpap1Q80TE0 1409 aa26.6■■□□□ 1.85
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa26.59■■□□□ 1.85
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Setd1bQ8CFT2 1985 aa26.57■■□□□ 1.84
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa26.56■■□□□ 1.84
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ift140E9PY46 1464 aa26.56■■□□□ 1.84
Rbms1-209ENSMUST00000164147 WizO88286 1684 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Rbms1-209ENSMUST00000164147 PxdnQ3UQ28 1475 aa26.51■■□□□ 1.83
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Gpatch8A2A6A1 1505 aa26.5■■□□□ 1.83
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa26.5■■□□□ 1.83
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Adamts12Q811B3 1600 aa26.48■■□□□ 1.83
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Abca5Q8K448 1642 aa26.48■■□□□ 1.83
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Peg3Q3URU2 1571 aa26.45■■□□□ 1.82
Rbms1-209ENSMUST00000164147 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa26.43■■□□□ 1.82
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Kdm5bQ80Y84 1544 aa26.39■■□□□ 1.82
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Soga1E1U8D0 1418 aa26.39■■□□□ 1.82
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Abca16E9PWJ7 1678 aa26.37■■□□□ 1.81
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Kif27Q7M6Z4 1394 aa26.37■■□□□ 1.81
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Arhgap27A2AB59 869 aa26.37■■□□□ 1.81
Rbms1-209ENSMUST00000164147 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa26.36■■□□□ 1.81
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Eid3Q3V124 375 aa26.33■■□□□ 1.81
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Wdr66E9Q743 1299 aa26.33■■□□□ 1.81
Rbms1-209ENSMUST00000164147 WrnO09053 1401 aa26.33■■□□□ 1.8
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa26.31■■□□□ 1.8
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Abcc2Q8VI47 1543 aa26.26■■□□□ 1.79
Rbms1-209ENSMUST00000164147 TonslQ6NZL6 1363 aa26.26■■□□□ 1.79
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ccnb3Q810T2 1396 aa26.26■■□□□ 1.79
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Anks4bQ8K3X6 423 aa26.25■■□□□ 1.79
Rbms1-209ENSMUST00000164147 BC005561E9Q5E2 1589 aa26.21■■□□□ 1.79
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Rusc2Q80U22 1514 aa26.18■■□□□ 1.78
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Shroom2A2ALU4 1481 aa26.18■■□□□ 1.78
Rbms1-209ENSMUST00000164147 ClspnQ80YR7 1315 aa26.17■■□□□ 1.78
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa26.16■■□□□ 1.78
Rbms1-209ENSMUST00000164147 NexmifQ5DTT1 1515 aa26.16■■□□□ 1.78
Rbms1-209ENSMUST00000164147 A2mQ6GQT1 1474 aa26.14■■□□□ 1.78
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ncoa3O09000 1398 aa26.13■■□□□ 1.77
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Chic2Q9D9G3 165 aa26.12■■□□□ 1.77
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Naip2Q9QUK4 1447 aa26.1■■□□□ 1.77
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Mug1P28665 1476 aa26.07■■□□□ 1.76
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa26.05■■□□□ 1.76
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Fhad1A6PWD2 1420 aa26.04■■□□□ 1.76
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa26.03■■□□□ 1.76
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Mia2Q91ZV0 1396 aa26.02■■□□□ 1.76
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa26.01■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Neo1P97798 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Vps8Q0P5W1 1427 aa25.98■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Gcc2Q8CHG3 1679 aa25.97■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Csrnp3P59055 597 aa25.96■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Map3k4O08648 1597 aa25.96■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 AknaQ80VW7 1404 aa25.96■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Arhgef11Q68FM7 1552 aa25.95■■□□□ 1.75
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa25.92■■□□□ 1.74
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Rbms1-209ENSMUST00000164147 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa25.91■■□□□ 1.74
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa25.91■■□□□ 1.74
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ube2uB1AUC4 352 aa25.91■■□□□ 1.74
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Jph4Q80WT0 628 aa25.88■■□□□ 1.73
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cabp1Q9JLK7 227 aa25.88■■□□□ 1.73
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Fgd6Q69ZL1 1399 aa25.87■■□□□ 1.73
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Mroh2aD3Z750 1679 aa25.87■■□□□ 1.73
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa25.86■■□□□ 1.73
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa25.85■■□□□ 1.73
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Magi1Q6RHR9 1471 aa25.85■■□□□ 1.73
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Abcc5Q9R1X5 1436 aa25.85■■□□□ 1.73
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.9 ms