RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NrkQ9R0G8 1455 aa24.72■■□□□ 1.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa24.72■■□□□ 1.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cux2P70298 1426 aa24.71■■□□□ 1.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Shroom4Q1W617 1475 aa24.69■■□□□ 1.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc18Q640L5 1455 aa24.69■■□□□ 1.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Grin2bQ01097 1482 aa24.66■■□□□ 1.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam135aQ6NS59 1506 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.51■■□□□ 1.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf710Q3U288 666 aa24.51■■□□□ 1.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arap1Q4LDD4 1452 aa24.5■■□□□ 1.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Baz1bQ9Z277 1479 aa24.5■■□□□ 1.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eea1Q8BL66 1411 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.45■■□□□ 1.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Setd5Q5XJV7 1441 aa24.45■■□□□ 1.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Map3k1P53349 1493 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Duox2A2AQ99 1517 aa24.37■■□□□ 1.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Supt16hQ920B9 1047 aa24.36■■□□□ 1.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Efcab5A0JP43 1406 aa24.33■■□□□ 1.48
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa24.31■■□□□ 1.48
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rpap1Q80TE0 1409 aa24.3■■□□□ 1.48
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Calr4Q3TQS0 420 aa24.29■■□□□ 1.48
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stra8P70278 393 aa24.28■■□□□ 1.48
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ankrd26Q811D2 1581 aa24.26■■□□□ 1.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Samd9lQ69Z37 1561 aa24.22■■□□□ 1.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eid3Q3V124 375 aa24.22■■□□□ 1.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cux1P53564 1515 aa24.21■■□□□ 1.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fgd1P52734 960 aa24.21■■□□□ 1.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kdm5bQ80Y84 1544 aa24.21■■□□□ 1.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rad54l2Q99NG0 1466 aa24.2■■□□□ 1.46
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Carmil1Q6EDY6 1374 aa24.18■■□□□ 1.46
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lmod2Q3UHZ5 550 aa24.16■■□□□ 1.46
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Naip1Q9QWK5 1403 aa24.16■■□□□ 1.46
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 BlmO88700 1416 aa24.14■■□□□ 1.46
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pcf11G3X9Z4 1553 aa24.14■■□□□ 1.45
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tiam1Q60610 1591 aa24.14■■□□□ 1.45
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa24.12■■□□□ 1.45
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif21aQ9QXL2 1672 aa24.11■■□□□ 1.45
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Erich3F6QRE9 1637 aa24.11■■□□□ 1.45
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mrc2Q64449 1479 aa24.11■■□□□ 1.45
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa24.1■■□□□ 1.45
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slx4Q6P1D7 1565 aa24.09■■□□□ 1.45
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SynmQ70IV5 1561 aa24.09■■□□□ 1.45
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NrdcQ8BHG1 1161 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Crocc2F6XLV1 1638 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc27Q3V036 639 aa24.01■■□□□ 1.43
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa23.98■■□□□ 1.43
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pknox2Q8BG99 474 aa23.98■■□□□ 1.43
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Washc2Q6PGL7 1334 aa23.98■■□□□ 1.43
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Aebp1Q640N1 1128 aa23.97■■□□□ 1.43
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plcd4Q8K3R3 807 aa23.97■■□□□ 1.43
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plb1Q3TTY0 1478 aa23.96■■□□□ 1.43
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fyco1Q8VDC1 1437 aa23.94■■□□□ 1.42
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CntlnA2AM05 1397 aa23.93■■□□□ 1.42
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pla2r1Q62028 1487 aa23.92■■□□□ 1.42
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pak3Q61036 559 aa23.91■■□□□ 1.42
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Irx3P81067 507 aa23.9■■□□□ 1.42
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Magi3Q9EQJ9 1476 aa23.88■■□□□ 1.41
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NclP09405 707 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa23.85■■□□□ 1.41
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Liat1Q810M6 228 aa23.83■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Disp1Q3TDN0 1521 aa23.82■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Grin2aP35436 1464 aa23.82■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CadpsQ80TJ1 1355 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm13697A2AK42 830 aa23.8■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Egfem1Q8C088 590 aa23.8■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 UacaQ8CGB3 1411 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa23.74■■□□□ 1.39
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gpatch8A2A6A1 1505 aa23.73■■□□□ 1.39
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Peg3Q3URU2 1571 aa23.71■■□□□ 1.39
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 WizO88286 1684 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PxdnQ3UQ28 1475 aa23.69■■□□□ 1.38
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ipo4Q8VI75 1082 aa23.66■■□□□ 1.38
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.66■■□□□ 1.38
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca5Q8K448 1642 aa23.64■■□□□ 1.38
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Setd1bQ8CFT2 1985 aa23.63■■□□□ 1.37
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif27Q7M6Z4 1394 aa23.63■■□□□ 1.37
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ipo9Q91YE6 1041 aa23.61■■□□□ 1.37
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccnb3Q810T2 1396 aa23.61■■□□□ 1.37
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