Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI75

Ipo4, Importin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo4Q8VI75 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Ipo4Q8VI75 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ipo4Q8VI75 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ipo4Q8VI75 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ipo4Q8VI75 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Ipo4Q8VI75 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ipo4Q8VI75 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ipo4Q8VI75 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ipo4Q8VI75 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ipo4Q8VI75 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ipo4Q8VI75 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ipo4Q8VI75 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ipo4Q8VI75 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ipo4Q8VI75 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ipo4Q8VI75 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ipo4Q8VI75 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ipo4Q8VI75 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ipo4Q8VI75 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ipo4Q8VI75 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ipo4Q8VI75 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Ipo4Q8VI75 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Ipo4Q8VI75 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ipo4Q8VI75 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ipo4Q8VI75 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Ipo4Q8VI75 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ipo4Q8VI75 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ipo4Q8VI75 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ipo4Q8VI75 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ipo4Q8VI75 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ipo4Q8VI75 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ipo4Q8VI75 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ipo4Q8VI75 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ipo4Q8VI75 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ipo4Q8VI75 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ipo4Q8VI75 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ipo4Q8VI75 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ipo4Q8VI75 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ipo4Q8VI75 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ipo4Q8VI75 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ipo4Q8VI75 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ipo4Q8VI75 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ipo4Q8VI75 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ipo4Q8VI75 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ipo4Q8VI75 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
Ipo4Q8VI75 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ipo4Q8VI75 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ipo4Q8VI75 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Ipo4Q8VI75 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ipo4Q8VI75 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ipo4Q8VI75 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ipo4Q8VI75 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ipo4Q8VI75 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ipo4Q8VI75 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ipo4Q8VI75 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ipo4Q8VI75 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ipo4Q8VI75 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ipo4Q8VI75 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ipo4Q8VI75 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ipo4Q8VI75 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ipo4Q8VI75 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ipo4Q8VI75 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ipo4Q8VI75 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ipo4Q8VI75 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ipo4Q8VI75 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ipo4Q8VI75 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ipo4Q8VI75 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Ipo4Q8VI75 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ipo4Q8VI75 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ipo4Q8VI75 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ipo4Q8VI75 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ipo4Q8VI75 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ipo4Q8VI75 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ipo4Q8VI75 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ipo4Q8VI75 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ipo4Q8VI75 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ipo4Q8VI75 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ipo4Q8VI75 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ipo4Q8VI75 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ipo4Q8VI75 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ipo4Q8VI75 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ipo4Q8VI75 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ipo4Q8VI75 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ipo4Q8VI75 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ipo4Q8VI75 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ipo4Q8VI75 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ipo4Q8VI75 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ipo4Q8VI75 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ipo4Q8VI75 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ipo4Q8VI75 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ipo4Q8VI75 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ipo4Q8VI75 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ipo4Q8VI75 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ipo4Q8VI75 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ipo4Q8VI75 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ipo4Q8VI75 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Ipo4Q8VI75 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ipo4Q8VI75 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ipo4Q8VI75 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ipo4Q8VI75 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ipo4Q8VI75 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms