Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHG1

Nrdc, Nardilysin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrdcQ8BHG1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
NrdcQ8BHG1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
NrdcQ8BHG1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
NrdcQ8BHG1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
NrdcQ8BHG1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
NrdcQ8BHG1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
NrdcQ8BHG1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
NrdcQ8BHG1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
NrdcQ8BHG1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
NrdcQ8BHG1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NrdcQ8BHG1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
NrdcQ8BHG1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NrdcQ8BHG1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
NrdcQ8BHG1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NrdcQ8BHG1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NrdcQ8BHG1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NrdcQ8BHG1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NrdcQ8BHG1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NrdcQ8BHG1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NrdcQ8BHG1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
NrdcQ8BHG1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NrdcQ8BHG1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NrdcQ8BHG1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NrdcQ8BHG1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
NrdcQ8BHG1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NrdcQ8BHG1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
NrdcQ8BHG1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
NrdcQ8BHG1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NrdcQ8BHG1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NrdcQ8BHG1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NrdcQ8BHG1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NrdcQ8BHG1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
NrdcQ8BHG1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NrdcQ8BHG1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NrdcQ8BHG1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NrdcQ8BHG1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NrdcQ8BHG1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NrdcQ8BHG1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NrdcQ8BHG1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NrdcQ8BHG1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NrdcQ8BHG1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NrdcQ8BHG1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NrdcQ8BHG1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NrdcQ8BHG1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
NrdcQ8BHG1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.92
NrdcQ8BHG1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NrdcQ8BHG1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
NrdcQ8BHG1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NrdcQ8BHG1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NrdcQ8BHG1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NrdcQ8BHG1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NrdcQ8BHG1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NrdcQ8BHG1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NrdcQ8BHG1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NrdcQ8BHG1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NrdcQ8BHG1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
NrdcQ8BHG1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NrdcQ8BHG1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NrdcQ8BHG1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NrdcQ8BHG1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
NrdcQ8BHG1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NrdcQ8BHG1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NrdcQ8BHG1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NrdcQ8BHG1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NrdcQ8BHG1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NrdcQ8BHG1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NrdcQ8BHG1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NrdcQ8BHG1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NrdcQ8BHG1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NrdcQ8BHG1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
NrdcQ8BHG1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NrdcQ8BHG1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NrdcQ8BHG1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NrdcQ8BHG1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NrdcQ8BHG1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NrdcQ8BHG1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NrdcQ8BHG1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
NrdcQ8BHG1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NrdcQ8BHG1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NrdcQ8BHG1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NrdcQ8BHG1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
NrdcQ8BHG1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NrdcQ8BHG1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NrdcQ8BHG1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NrdcQ8BHG1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NrdcQ8BHG1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NrdcQ8BHG1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NrdcQ8BHG1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NrdcQ8BHG1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NrdcQ8BHG1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NrdcQ8BHG1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NrdcQ8BHG1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NrdcQ8BHG1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NrdcQ8BHG1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NrdcQ8BHG1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NrdcQ8BHG1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NrdcQ8BHG1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NrdcQ8BHG1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NrdcQ8BHG1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NrdcQ8BHG1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms