Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.92■■■■■ 5.42
Stra8P70278 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
Stra8P70278 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
Stra8P70278 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Stra8P70278 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Stra8P70278 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Stra8P70278 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
Stra8P70278 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Stra8P70278 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
Stra8P70278 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Stra8P70278 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Stra8P70278 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Stra8P70278 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Stra8P70278 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
Stra8P70278 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Stra8P70278 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Stra8P70278 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Stra8P70278 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Stra8P70278 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Stra8P70278 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Stra8P70278 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Stra8P70278 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Stra8P70278 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Stra8P70278 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Stra8P70278 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Stra8P70278 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Stra8P70278 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
Stra8P70278 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Stra8P70278 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Stra8P70278 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Stra8P70278 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Stra8P70278 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Stra8P70278 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Stra8P70278 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Stra8P70278 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Stra8P70278 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Stra8P70278 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Stra8P70278 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Stra8P70278 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Stra8P70278 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Stra8P70278 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Stra8P70278 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Stra8P70278 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Stra8P70278 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Stra8P70278 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Stra8P70278 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Stra8P70278 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Stra8P70278 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Stra8P70278 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Stra8P70278 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Stra8P70278 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
Stra8P70278 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Stra8P70278 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Stra8P70278 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Stra8P70278 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Stra8P70278 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Stra8P70278 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Stra8P70278 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Stra8P70278 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Stra8P70278 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Stra8P70278 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Stra8P70278 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Stra8P70278 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Stra8P70278 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Stra8P70278 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Stra8P70278 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Stra8P70278 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Stra8P70278 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Stra8P70278 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Stra8P70278 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Stra8P70278 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Stra8P70278 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Stra8P70278 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Stra8P70278 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Stra8P70278 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Stra8P70278 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Stra8P70278 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Stra8P70278 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Stra8P70278 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Stra8P70278 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Stra8P70278 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Stra8P70278 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Stra8P70278 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Stra8P70278 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Stra8P70278 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Stra8P70278 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Stra8P70278 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Stra8P70278 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Stra8P70278 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Stra8P70278 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Stra8P70278 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Stra8P70278 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Stra8P70278 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Stra8P70278 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Stra8P70278 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Stra8P70278 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Stra8P70278 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Stra8P70278 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Stra8P70278 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Stra8P70278 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms