RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sall2Q9QX96 1004 aa19.06■□□□□ 0.64
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Carmil1Q6EDY6 1374 aa19.04■□□□□ 0.64
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cux1P53564 1515 aa19.03■□□□□ 0.64
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd26Q811D2 1581 aa19.01■□□□□ 0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa18.99■□□□□ 0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmod2Q3UHZ5 550 aa18.98■□□□□ 0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Setd1bQ8CFT2 1985 aa18.96■□□□□ 0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Disp1Q3TDN0 1521 aa18.95■□□□□ 0.62
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2r1Q62028 1487 aa18.94■□□□□ 0.62
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Magi3Q9EQJ9 1476 aa18.94■□□□□ 0.62
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa18.94■□□□□ 0.62
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grin2aP35436 1464 aa18.93■□□□□ 0.62
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcf11G3X9Z4 1553 aa18.9■□□□□ 0.62
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BlmO88700 1416 aa18.88■□□□□ 0.61
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erich3F6QRE9 1637 aa18.88■□□□□ 0.61
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aebp1Q640N1 1128 aa18.84■□□□□ 0.61
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpap1Q80TE0 1409 aa18.83■□□□□ 0.61
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fyco1Q8VDC1 1437 aa18.83■□□□□ 0.61
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naip1Q9QWK5 1403 aa18.83■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slx4Q6P1D7 1565 aa18.82■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ift140E9PY46 1464 aa18.82■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tiam1Q60610 1591 aa18.82■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CadpsQ80TJ1 1355 aa18.79■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr66E9Q743 1299 aa18.78■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap27A2AB59 869 aa18.77■□□□□ 0.6
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa18.76■□□□□ 0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PxdnQ3UQ28 1475 aa18.76■□□□□ 0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa18.75■□□□□ 0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CntlnA2AM05 1397 aa18.72■□□□□ 0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts12Q811B3 1600 aa18.7■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abca16E9PWJ7 1678 aa18.69■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csrnp3P59055 597 aa18.69■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpatch8A2A6A1 1505 aa18.69■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abca5Q8K448 1642 aa18.68■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anks4bQ8K3X6 423 aa18.67■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa18.67■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa18.67■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa18.65■□□□□ 0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WrnO09053 1401 aa18.64■□□□□ 0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa18.63■□□□□ 0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif27Q7M6Z4 1394 aa18.63■□□□□ 0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa18.6■□□□□ 0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Soga1E1U8D0 1418 aa18.6■□□□□ 0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rusc2Q80U22 1514 aa18.59■□□□□ 0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcc2Q8VI47 1543 aa18.57■□□□□ 0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Peg3Q3URU2 1571 aa18.53■□□□□ 0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa18.52■□□□□ 0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AknaQ80VW7 1404 aa18.52■□□□□ 0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eid3Q3V124 375 aa18.52■□□□□ 0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shroom2A2ALU4 1481 aa18.5■□□□□ 0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC005561E9Q5E2 1589 aa18.49■□□□□ 0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccnb3Q810T2 1396 aa18.49■□□□□ 0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClspnQ80YR7 1315 aa18.49■□□□□ 0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chic2Q9D9G3 165 aa18.48■□□□□ 0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neo1P97798 1493 aa18.46■□□□□ 0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NexmifQ5DTT1 1515 aa18.44■□□□□ 0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa18.42■□□□□ 0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncoa3O09000 1398 aa18.42■□□□□ 0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TonslQ6NZL6 1363 aa18.4■□□□□ 0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa18.4■□□□□ 0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mug1P28665 1476 aa18.38■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2uB1AUC4 352 aa18.38■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgd6Q69ZL1 1399 aa18.37■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jph4Q80WT0 628 aa18.36■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map3k4O08648 1597 aa18.36■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdm5bQ80Y84 1544 aa18.35■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A2mQ6GQT1 1474 aa18.35■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm38655A0A286YDK6 273 aa18.35■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa18.34■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa18.33■□□□□ 0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef11Q68FM7 1552 aa18.32■□□□□ 0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa18.3■□□□□ 0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mroh2aD3Z750 1679 aa18.3■□□□□ 0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gcc2Q8CHG3 1679 aa18.28■□□□□ 0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa18.27■□□□□ 0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naip2Q9QUK4 1447 aa18.27■□□□□ 0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prex2Q3LAC4 1598 aa18.27■□□□□ 0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cabp1Q9JLK7 227 aa18.26■□□□□ 0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa18.26■□□□□ 0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Magi1Q6RHR9 1471 aa18.25■□□□□ 0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa18.23■□□□□ 0.51
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