RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa37.97■■■■□ 3.67
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep170Q6A065 1588 aa37.93■■■■□ 3.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcc1O35379 1528 aa37.92■■■■□ 3.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CadpsQ80TJ1 1355 aa37.9■■■■□ 3.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa37.87■■■■□ 3.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abca16E9PWJ7 1678 aa37.82■■■■□ 3.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 WizO88286 1684 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adamts12Q811B3 1600 aa37.8■■■■□ 3.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap27A2AB59 869 aa37.8■■■■□ 3.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm156Q58A37 223 aa37.8■■■■□ 3.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HrcG5E8J6 738 aa37.79■■■■□ 3.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcc2Q8VI47 1543 aa37.78■■■■□ 3.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PxdnQ3UQ28 1475 aa37.76■■■■□ 3.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map3k4O08648 1597 aa37.73■■■■□ 3.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Carmil1Q6EDY6 1374 aa37.73■■■■□ 3.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chd1P40201 1711 aa37.72■■■■□ 3.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Soga1E1U8D0 1418 aa37.71■■■■□ 3.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37.7■■■■□ 3.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Neo1P97798 1493 aa37.7■■■■□ 3.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa37.7■■■■□ 3.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gab3Q8BSM5 595 aa37.65■■■■□ 3.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map3k1P53349 1493 aa37.64■■■■□ 3.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa37.64■■■■□ 3.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BC005561E9Q5E2 1589 aa37.63■■■■□ 3.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap35Q91YM2 1499 aa37.63■■■■□ 3.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtprtQ99M80 1454 aa37.61■■■■□ 3.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm14025A2AP89 1413 aa37.6■■■■□ 3.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpap1Q80TE0 1409 aa37.53■■■■□ 3.6
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slx4Q6P1D7 1565 aa37.51■■■■□ 3.59
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep162Q6ZQ06 1403 aa37.38■■■■□ 3.57
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pprc1Q6NZN1 1644 aa37.38■■■■□ 3.57
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clip1Q922J3 1391 aa37.38■■■■□ 3.57
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abca5Q8K448 1642 aa37.36■■■■□ 3.57
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jph4Q80WT0 628 aa37.36■■■■□ 3.57
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa37.32■■■■□ 3.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AI481877A2ALV5 1481 aa37.32■■■■□ 3.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Setbp1Q9Z180 1582 aa37.31■■■■□ 3.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cux1P53564 1515 aa37.25■■■■□ 3.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 WrnO09053 1401 aa37.22■■■■□ 3.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myt1lP97500 1187 aa37.19■■■■□ 3.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fyco1Q8VDC1 1437 aa37.19■■■■□ 3.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ak9G3UYQ4 1894 aa37.12■■■■□ 3.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa37.07■■■■□ 3.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa37.07■■■■□ 3.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igf1rQ60751 1373 aa37.03■■■■□ 3.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdm5bQ80Y84 1544 aa36.99■■■■□ 3.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa36.89■■■■□ 3.5
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankrd26Q811D2 1581 aa36.89■■■■□ 3.5
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa36.85■■■■□ 3.49
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa36.84■■■■□ 3.49
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arid3cA6PWV5 409 aa36.81■■■■□ 3.48
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr7Q920I9 1489 aa36.77■■■■□ 3.48
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aebp1Q640N1 1128 aa36.75■■■■□ 3.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NhsB1AV60 1647 aa36.74■■■■□ 3.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc37F8VPK0 1563 aa36.74■■■■□ 3.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf608Q56A10 1511 aa36.71■■■■□ 3.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cul7Q8VE73 1689 aa36.69■■■■□ 3.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Setd5Q5XJV7 1441 aa36.68■■■■□ 3.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ncoa2Q61026 1462 aa36.67■■■■□ 3.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AdgbG3UZ78 1657 aa36.67■■■■□ 3.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa36.65■■■■□ 3.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif27Q7M6Z4 1394 aa36.65■■■■□ 3.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa36.64■■■■□ 3.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp10dQ8K2X1 1416 aa36.62■■■■□ 3.45
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BlmO88700 1416 aa36.6■■■■□ 3.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mroh2aD3Z750 1679 aa36.59■■■■□ 3.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Depdc5P61460 1591 aa36.59■■■■□ 3.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfyve16Q80U44 1528 aa36.58■■■■□ 3.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eea1Q8BL66 1411 aa36.57■■■■□ 3.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gcc2Q8CHG3 1679 aa36.57■■■■□ 3.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fancd2Q80V62 1450 aa36.54■■■■□ 3.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa36.53■■■■□ 3.44
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arap1Q4LDD4 1452 aa36.48■■■■□ 3.43
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcf11G3X9Z4 1553 aa36.44■■■■□ 3.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abca8bQ8K440 1620 aa36.41■■■■□ 3.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef11Q68FM7 1552 aa36.4■■■■□ 3.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AglF8VPN4 1532 aa36.39■■■■□ 3.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fndc1E9Q043 1732 aa36.33■■■■□ 3.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam163aQ8CAA5 168 aa36.31■■■■□ 3.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prex2Q3LAC4 1598 aa36.28■■■■□ 3.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ncoa3O09000 1398 aa36.27■■■■□ 3.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CntlnA2AM05 1397 aa36.25■■■■□ 3.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mug1P28665 1476 aa36.24■■■■□ 3.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 A2mQ6GQT1 1474 aa36.18■■■■□ 3.38
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