RNA–Protein interactions for RNA: YML113W

DAT1, Transcript of DNA binding protein that recognizes oligo(dA).oligo(dT) tracts, yeast

Gene DAT1, Length 747 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DAT1	YML113W	AVT2	P39981	480 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DAT1	YML113W	MND1	P53102	219 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DAT1	YML113W	HOP2	P53187	214 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DAT1	YML113W	MAL13	P53338	473 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DAT1	YML113W	TMN2	Q04562	672 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DAT1	YML113W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DAT1	YML113W	ATG23	Q06671	453 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DAT1	YML113W	NSE1	Q07913	336 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DAT1	YML113W	NBP2	Q12163	236 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DAT1	YML113W	YLR462W	O13556	202 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	DSS4	P32601	143 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YMC2	P38087	329 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YBR225W	P38321	900 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	HXT5	P38695	592 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YHL049C	P38722	271 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	NUP60	P39705	539 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YER189W	P40104	122 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	MAD1	P40957	749 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YFL064C	P43540	174 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	GUF1	P46943	645 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	ASG7	P46993	209 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	RPC17	P47076	161 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	ARO80	Q04052	950 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	DDC1	Q08949	612 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	DAL1	P32375	460 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YBL036C	P38197	257 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	CDC1	P40986	491 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	TUB4	P53378	473 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	ATG16	Q03818	150 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	URH1	Q04179	340 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	VPS54	Q12071	889 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	MED6	P38782	295 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	PFD1	P46988	109 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	ATH1	P48016	1211 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	ERV41	Q04651	352 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.81	□□□□□ -0.68	not detected
DAT1	YML113W	EMP46	Q12396	444 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	SPO21	Q12411	609 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	BI2	P03873	423 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	BI4	P03879	638 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YDR278C	Q05612	105 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	TMN3	P40071	706 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YPL062W	Q02781	134 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	UFO1	Q04511	668 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	IVY1	Q04934	453 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	HRD3	Q05787	833 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	ECI1	Q05871	280 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	MDM38	Q08179	573 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	AIM41	Q12032	185 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	FUS1	P11710	512 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	RPO26	P20435	155 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	MRM1	P25270	412 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	CNS1	P33313	385 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	ASG1	P40467	964 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	GYP8	P43570	497 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	YNR061C	P53747	219 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	VTI1	Q04338	217 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DAT1	YML113W	RGR1	P19263	1082 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	HCM1	P25364	564 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	MRP4	P32902	394 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	NEM1	P38757	446 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	SAK1	P38990	1142 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	CHS6	P40955	746 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	SNZ3	P43545	298 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	PUS2	P53167	370 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	SNZ2	P53824	298 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	APC5	Q08683	685 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	YRR1	Q12172	810 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	MPD2	Q99316	277 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	PMS1	P14242	873 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	SRB2	P34162	210 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	YBR053C	P38235	358 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	SSP1	P38871	571 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	KHA1	P40309	873 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DAT1	YML113W	VTC4	P47075	721 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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