Protein–RNA interactions for Protein: P25364

HCM1, Forkhead transcription factor HCM1, yeastyeast

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCM1P25364 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.6■□□□□ 0.89
HCM1P25364 NOP1YDL014W 984 nt20.32■□□□□ 0.84
HCM1P25364 NSR1YGR159C 1245 nt19.94■□□□□ 0.78
HCM1P25364 YKL036CYKL036C 393 nt19.31■□□□□ 0.68
HCM1P25364 YJL027CYJL027C 417 nt18.14■□□□□ 0.49
HCM1P25364 Q0297Q0297 156 nt17.95■□□□□ 0.46
HCM1P25364 SCS3YGL126W 1143 nt17.85■□□□□ 0.45
HCM1P25364 SRX1YKL086W 384 nt17.72■□□□□ 0.43
HCM1P25364 MDJ1YFL016C 1536 nt17.06■□□□□ 0.32
HCM1P25364 YCR051WYCR051W 669 nt16.88■□□□□ 0.29
HCM1P25364 YOL085CYOL085C 342 nt16.67■□□□□ 0.26
HCM1P25364 SCJ1YMR214W 1134 nt16.65■□□□□ 0.26
HCM1P25364 PKP1YIL042C 1185 nt16.34■□□□□ 0.21
HCM1P25364 ATS1YAL020C 1002 nt16.15■□□□□ 0.18
HCM1P25364 RPP1BYDL130W 321 nt16.12■□□□□ 0.17
HCM1P25364 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.63■□□□□ 0.09
HCM1P25364 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.63■□□□□ 0.09
HCM1P25364 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.63■□□□□ 0.09
HCM1P25364 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.63■□□□□ 0.09
HCM1P25364 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.63■□□□□ 0.09
HCM1P25364 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.63■□□□□ 0.09
HCM1P25364 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.63■□□□□ 0.09
HCM1P25364 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.63■□□□□ 0.09
HCM1P25364 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.63■□□□□ 0.09
HCM1P25364 CCC1YLR220W 969 nt15.51■□□□□ 0.07
HCM1P25364 SCR1SCR1 522 nt15.37■□□□□ 0.05
HCM1P25364 DBP2YNL112W 1641 nt15.32■□□□□ 0.04
HCM1P25364 PET122YER153C 765 nt15.3■□□□□ 0.04
HCM1P25364 RTC3YHR087W 336 nt15.11■□□□□ 0.01
HCM1P25364 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15□□□□□ -0.01
HCM1P25364 RRN5YLR141W 1092 nt14.93□□□□□ -0.02
HCM1P25364 PST2YDR032C 597 nt14.84□□□□□ -0.03
HCM1P25364 RSB1YOR049C 1065 nt14.84□□□□□ -0.03
HCM1P25364 RVS167YDR388W 1449 nt14.66□□□□□ -0.06
HCM1P25364 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.63□□□□□ -0.07
HCM1P25364 YKL097CYKL097C 411 nt14.62□□□□□ -0.07
HCM1P25364 YDJ1YNL064C 1230 nt14.53□□□□□ -0.08
HCM1P25364 YBR190WYBR190W 312 nt14.42□□□□□ -0.1
HCM1P25364 SHR5YOL110W 714 nt14.26□□□□□ -0.13
HCM1P25364 GAR1YHR089C 618 nt14.09□□□□□ -0.15
HCM1P25364 SHU1YHL006C 453 nt14.08□□□□□ -0.16
HCM1P25364 YOR139CYOR139C 393 nt13.86□□□□□ -0.19
HCM1P25364 SSA3YBL075C 1950 nt13.8□□□□□ -0.2
HCM1P25364 NPL3YDR432W 1245 nt13.68□□□□□ -0.22
HCM1P25364 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.66□□□□□ -0.22
HCM1P25364 DEP1YAL013W 1218 nt13.62□□□□□ -0.23
HCM1P25364 TIR1YER011W 765 nt13.59□□□□□ -0.23
HCM1P25364 YNL208WYNL208W 600 nt13.51□□□□□ -0.25
HCM1P25364 RPN10YHR200W 807 nt13.47□□□□□ -0.25
HCM1P25364 URN1YPR152C 1398 nt13.46□□□□□ -0.25
HCM1P25364 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.29□□□□□ -0.28
HCM1P25364 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.29□□□□□ -0.28
HCM1P25364 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.29□□□□□ -0.28
HCM1P25364 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.29□□□□□ -0.28
HCM1P25364 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.29□□□□□ -0.28
HCM1P25364 YOL037CYOL037C 354 nt13.29□□□□□ -0.28
HCM1P25364 YGR021WYGR021W 873 nt13.26□□□□□ -0.29
HCM1P25364 SSA1YAL005C 1929 nt13.25□□□□□ -0.29
HCM1P25364 MNP1YGL068W 585 nt13.2□□□□□ -0.3
HCM1P25364 HOM6YJR139C 1080 nt13.19□□□□□ -0.3
HCM1P25364 OPI9YLR338W 858 nt13.14□□□□□ -0.31
HCM1P25364 BSC6YOL137W 1494 nt13.1□□□□□ -0.31
HCM1P25364 SRB2YHR041C 633 nt13.1□□□□□ -0.31
HCM1P25364 WWM1YFL010C 636 nt13.08□□□□□ -0.32
HCM1P25364 MOT3YMR070W 1473 nt13.04□□□□□ -0.32
HCM1P25364 RKM5YLR137W 1104 nt13.01□□□□□ -0.33
HCM1P25364 PUS2YGL063W 1113 nt12.99□□□□□ -0.33
HCM1P25364 PUT4YOR348C 1884 nt12.96□□□□□ -0.33
HCM1P25364 YLR281CYLR281C 468 nt12.9□□□□□ -0.34
HCM1P25364 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.89□□□□□ -0.35
HCM1P25364 YJR018WYJR018W 363 nt12.89□□□□□ -0.35
HCM1P25364 SAH1YER043C 1350 nt12.87□□□□□ -0.35
HCM1P25364 RPP2BYDR382W 333 nt12.85□□□□□ -0.35
HCM1P25364 MRPL8YJL063C 717 nt12.79□□□□□ -0.36
HCM1P25364 PUN1YLR414C 792 nt12.79□□□□□ -0.36
HCM1P25364 WHI5YOR083W 888 nt12.77□□□□□ -0.37
HCM1P25364 YJR120WYJR120W 351 nt12.74□□□□□ -0.37
HCM1P25364 FMP45YDL222C 930 nt12.66□□□□□ -0.38
HCM1P25364 BDH2YAL061W 1254 nt12.66□□□□□ -0.38
HCM1P25364 LSM3YLR438C-A 270 nt12.63□□□□□ -0.39
HCM1P25364 YCH1YGR203W 447 nt12.59□□□□□ -0.39
HCM1P25364 DSK2YMR276W 1122 nt12.58□□□□□ -0.4
HCM1P25364 ADO1YJR105W 1023 nt12.57□□□□□ -0.4
HCM1P25364 IMP2'YIL154C 1041 nt12.54□□□□□ -0.4
HCM1P25364 UBX6YJL048C 1191 nt12.52□□□□□ -0.41
HCM1P25364 ARE1YCR048W 1833 nt12.52□□□□□ -0.41
HCM1P25364 YPR011CYPR011C 981 nt12.51□□□□□ -0.41
HCM1P25364 PTC2YER089C 1395 nt12.5□□□□□ -0.41
HCM1P25364 YLR236CYLR236C 324 nt12.46□□□□□ -0.41
HCM1P25364 POA1YBR022W 534 nt12.44□□□□□ -0.42
HCM1P25364 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.43□□□□□ -0.42
HCM1P25364 YEL076CYEL076C 651 nt12.43□□□□□ -0.42
HCM1P25364 YLR464WYLR464W 651 nt12.43□□□□□ -0.42
HCM1P25364 SPT5YML010W 3192 nt12.41□□□□□ -0.42
HCM1P25364 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.39□□□□□ -0.43
HCM1P25364 INM2YDR287W 879 nt12.38□□□□□ -0.43
HCM1P25364 YBL100CYBL100C 315 nt12.35□□□□□ -0.43
HCM1P25364 TRM9YML014W 840 nt12.34□□□□□ -0.43
HCM1P25364 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.33□□□□□ -0.44
HCM1P25364 SIS1YNL007C 1059 nt12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.3 ms