Protein–RNA interactions for Protein: P47076

RPC17, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC17P47076 NSR1YGR159C 1245 nt21.36■■□□□ 1.01
RPC17P47076 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.19■□□□□ 0.98
RPC17P47076 NOP1YDL014W 984 nt20.47■□□□□ 0.87
RPC17P47076 MDJ1YFL016C 1536 nt19.28■□□□□ 0.68
RPC17P47076 YKL036CYKL036C 393 nt18.55■□□□□ 0.56
RPC17P47076 SRX1YKL086W 384 nt17.87■□□□□ 0.45
RPC17P47076 Q0297Q0297 156 nt17.79■□□□□ 0.44
RPC17P47076 YJL027CYJL027C 417 nt17.77■□□□□ 0.44
RPC17P47076 YCR051WYCR051W 669 nt16.92■□□□□ 0.3
RPC17P47076 DBP2YNL112W 1641 nt16.92■□□□□ 0.3
RPC17P47076 SCS3YGL126W 1143 nt16.71■□□□□ 0.27
RPC17P47076 YBR190WYBR190W 312 nt16.54■□□□□ 0.24
RPC17P47076 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RPC17P47076 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RPC17P47076 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RPC17P47076 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RPC17P47076 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RPC17P47076 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RPC17P47076 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RPC17P47076 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RPC17P47076 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RPC17P47076 CCC1YLR220W 969 nt16.18■□□□□ 0.18
RPC17P47076 RTC3YHR087W 336 nt16.15■□□□□ 0.18
RPC17P47076 YOL085CYOL085C 342 nt16.07■□□□□ 0.16
RPC17P47076 RPP1BYDL130W 321 nt15.96■□□□□ 0.15
RPC17P47076 PKP1YIL042C 1185 nt15.86■□□□□ 0.13
RPC17P47076 RVS167YDR388W 1449 nt15.85■□□□□ 0.13
RPC17P47076 SCJ1YMR214W 1134 nt15.68■□□□□ 0.1
RPC17P47076 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.36■□□□□ 0.05
RPC17P47076 PET122YER153C 765 nt15.29■□□□□ 0.04
RPC17P47076 PUT4YOR348C 1884 nt15.28■□□□□ 0.04
RPC17P47076 SHR5YOL110W 714 nt15.21■□□□□ 0.03
RPC17P47076 SSA3YBL075C 1950 nt15.07■□□□□ 0
RPC17P47076 SCR1SCR1 522 nt15.05■□□□□ -0
RPC17P47076 URN1YPR152C 1398 nt14.99□□□□□ -0.01
RPC17P47076 ARE1YCR048W 1833 nt14.9□□□□□ -0.02
RPC17P47076 DEP1YAL013W 1218 nt14.87□□□□□ -0.03
RPC17P47076 YDJ1YNL064C 1230 nt14.87□□□□□ -0.03
RPC17P47076 OPI9YLR338W 858 nt14.85□□□□□ -0.03
RPC17P47076 SAH1YER043C 1350 nt14.84□□□□□ -0.03
RPC17P47076 ATS1YAL020C 1002 nt14.83□□□□□ -0.04
RPC17P47076 RRN5YLR141W 1092 nt14.8□□□□□ -0.04
RPC17P47076 POA1YBR022W 534 nt14.76□□□□□ -0.05
RPC17P47076 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.71□□□□□ -0.05
RPC17P47076 RPN10YHR200W 807 nt14.71□□□□□ -0.05
RPC17P47076 YNL208WYNL208W 600 nt14.62□□□□□ -0.07
RPC17P47076 GAR1YHR089C 618 nt14.58□□□□□ -0.08
RPC17P47076 BSC6YOL137W 1494 nt14.51□□□□□ -0.09
RPC17P47076 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.51□□□□□ -0.09
RPC17P47076 PUN1YLR414C 792 nt14.42□□□□□ -0.1
RPC17P47076 RSB1YOR049C 1065 nt14.4□□□□□ -0.1
RPC17P47076 BUD23YCR047C 828 nt14.34□□□□□ -0.11
RPC17P47076 PTC2YER089C 1395 nt14.29□□□□□ -0.12
RPC17P47076 YJR018WYJR018W 363 nt14.28□□□□□ -0.12
RPC17P47076 NAB2YGL122C 1578 nt14.17□□□□□ -0.14
RPC17P47076 TIR1YER011W 765 nt14.12□□□□□ -0.15
RPC17P47076 SPT5YML010W 3192 nt14.1□□□□□ -0.15
RPC17P47076 SSA1YAL005C 1929 nt14.02□□□□□ -0.17
RPC17P47076 YJR120WYJR120W 351 nt13.98□□□□□ -0.17
RPC17P47076 FIS1YIL065C 468 nt13.94□□□□□ -0.18
RPC17P47076 RPP2BYDR382W 333 nt13.92□□□□□ -0.18
RPC17P47076 DAL1YIR027C 1383 nt13.92□□□□□ -0.18
RPC17P47076 FPR4YLR449W 1179 nt13.85□□□□□ -0.19
RPC17P47076 INM2YDR287W 879 nt13.82□□□□□ -0.2
RPC17P47076 PST2YDR032C 597 nt13.79□□□□□ -0.2
RPC17P47076 PHO4YFR034C 939 nt13.78□□□□□ -0.2
RPC17P47076 SSA4YER103W 1929 nt13.74□□□□□ -0.21
RPC17P47076 SRB2YHR041C 633 nt13.7□□□□□ -0.22
RPC17P47076 MEP2YNL142W 1500 nt13.66□□□□□ -0.22
RPC17P47076 YPS1YLR120C 1710 nt13.64□□□□□ -0.23
RPC17P47076 YBL100CYBL100C 315 nt13.64□□□□□ -0.23
RPC17P47076 BDH2YAL061W 1254 nt13.57□□□□□ -0.24
RPC17P47076 YDR095CYDR095C 411 nt13.5□□□□□ -0.25
RPC17P47076 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.5□□□□□ -0.25
RPC17P47076 FUN26YAL022C 1554 nt13.46□□□□□ -0.25
RPC17P47076 DCW1YKL046C 1350 nt13.44□□□□□ -0.26
RPC17P47076 WWM1YFL010C 636 nt13.43□□□□□ -0.26
RPC17P47076 TRM9YML014W 840 nt13.37□□□□□ -0.27
RPC17P47076 ALF1YNL148C 765 nt13.34□□□□□ -0.27
RPC17P47076 LSM3YLR438C-A 270 nt13.33□□□□□ -0.28
RPC17P47076 SHU1YHL006C 453 nt13.32□□□□□ -0.28
RPC17P47076 YGR021WYGR021W 873 nt13.28□□□□□ -0.28
RPC17P47076 CCT6YDR188W 1641 nt13.27□□□□□ -0.29
RPC17P47076 EMI2YDR516C 1503 nt13.26□□□□□ -0.29
RPC17P47076 RPP2AYOL039W 321 nt13.25□□□□□ -0.29
RPC17P47076 BDF1YLR399C 2061 nt13.25□□□□□ -0.29
RPC17P47076 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.24□□□□□ -0.29
RPC17P47076 PTP1YDL230W 1008 nt13.21□□□□□ -0.29
RPC17P47076 YMR090WYMR090W 684 nt13.21□□□□□ -0.29
RPC17P47076 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.2□□□□□ -0.3
RPC17P47076 HOM6YJR139C 1080 nt13.19□□□□□ -0.3
RPC17P47076 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.18□□□□□ -0.3
RPC17P47076 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.18□□□□□ -0.3
RPC17P47076 CAC2YML102W 1407 nt13.15□□□□□ -0.3
RPC17P47076 YDL221WYDL221W 552 nt13.14□□□□□ -0.31
RPC17P47076 SIS1YNL007C 1059 nt13.14□□□□□ -0.31
RPC17P47076 YBR220CYBR220C 1683 nt13.12□□□□□ -0.31
RPC17P47076 MNP1YGL068W 585 nt13.08□□□□□ -0.32
RPC17P47076 YKL097CYKL097C 411 nt13.08□□□□□ -0.32
RPC17P47076 TAT1YBR069C 1860 nt13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.7 ms