RNA–Protein interactions for RNA: YAL016W

TPD3, Transcript of Regulatory subunit A of the heterotrimeric PP2A complex, yeast

Gene TPD3, Length 1,908 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPD3	YAL016W	MRP7	P12687	371 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	CWH43	P25618	953 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PRE4	P30657	266 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	YPT7	P32939	208 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	UME6	P39001	836 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PRM2	P40534	656 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PKH1	Q03407	766 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	SNO4	Q04902	237 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	TRI1	Q05024	226 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	AAD4	Q07747	329 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	HSP32	Q08992	237 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	ECM3	Q99252	613 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	HMG2	P12684	1045 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	COQ2	P32378	372 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	NUP120	P35729	1037 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	RKM3	P38222	552 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	SIC1	P38634	284 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	LYS14	P40971	790 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	BIT61	P47041	543 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	SGM1	P47166	707 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	RSC1	P53236	928 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	MDR1	P53258	950 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	REC102	Q02721	264 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PLB2	Q03674	706 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PCD1	Q12524	340 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	HOM3	P10869	527 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	TFC3	P34111	1160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	CDS1	P38221	457 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	ROT1	Q03691	256 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	YKU80	Q04437	629 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	MCM21	Q06675	368 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	SWM1	Q12379	170 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	CBF2	P32504	956 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	TAT1	P38085	619 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	TAH11	P47112	604 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	YDL183C	P48569	320 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PPN1	Q04119	674 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	GPB1	Q08886	897 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	SEM1	O94742	89 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PCK1	P10963	549 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
TPD3	YAL016W	RAD16	P31244	790 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	MRPL36	P36531	177 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	APT2	P36973	181 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	YBR259W	P38338	688 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	NPR3	P38742	1146 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	GSM1	P42950	618 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	MET12	P46151	657 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	NCS6	P53088	359 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	YGR130C	P53278	816 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	MRPL19	P53875	158 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	CRD1	Q07560	283 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	MCA1	Q08601	432 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	ICL2	Q12031	575 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	TAH18	Q12181	623 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TPD3	YAL016W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
TPD3	YAL016W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	IMA1	P53051	589 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	MRPS35	P53292	345 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	TAF11	Q04226	346 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	GRC3	Q07845	632 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	COX17	Q12287	69 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	TUP1	P16649	713 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	OPI1	P21957	404 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	PGS1	P25578	521 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	CNS1	P33313	385 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	TOS1	P38288	455 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	EHT1	P38295	451 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	GET2	P40056	285 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	FTR1	P40088	404 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	CAB2	P40506	365 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TPD3	YAL016W	POL31	P46957	487 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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