Protein–RNA interactions for Protein: P47079

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCT8P47079 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.47■□□□□ 0.87
CCT8P47079 NSR1YGR159C 1245 nt20.45■□□□□ 0.86
CCT8P47079 NOP1YDL014W 984 nt19.73■□□□□ 0.75
CCT8P47079 MDJ1YFL016C 1536 nt18.46■□□□□ 0.55
CCT8P47079 YKL036CYKL036C 393 nt18.07■□□□□ 0.48
CCT8P47079 SRX1YKL086W 384 nt17.27■□□□□ 0.36
CCT8P47079 Q0297Q0297 156 nt17.23■□□□□ 0.35
CCT8P47079 YJL027CYJL027C 417 nt16.94■□□□□ 0.3
CCT8P47079 YCR051WYCR051W 669 nt16.44■□□□□ 0.22
CCT8P47079 SCS3YGL126W 1143 nt16.38■□□□□ 0.21
CCT8P47079 DBP2YNL112W 1641 nt16.24■□□□□ 0.19
CCT8P47079 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.74■□□□□ 0.11
CCT8P47079 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.74■□□□□ 0.11
CCT8P47079 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.74■□□□□ 0.11
CCT8P47079 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.74■□□□□ 0.11
CCT8P47079 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.74■□□□□ 0.11
CCT8P47079 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.74■□□□□ 0.11
CCT8P47079 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.74■□□□□ 0.11
CCT8P47079 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.74■□□□□ 0.11
CCT8P47079 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.74■□□□□ 0.11
CCT8P47079 YOL085CYOL085C 342 nt15.7■□□□□ 0.1
CCT8P47079 YBR190WYBR190W 312 nt15.69■□□□□ 0.1
CCT8P47079 CCC1YLR220W 969 nt15.68■□□□□ 0.1
CCT8P47079 PKP1YIL042C 1185 nt15.56■□□□□ 0.08
CCT8P47079 RPP1BYDL130W 321 nt15.48■□□□□ 0.07
CCT8P47079 RTC3YHR087W 336 nt15.4■□□□□ 0.06
CCT8P47079 RVS167YDR388W 1449 nt15.11■□□□□ 0.01
CCT8P47079 SCJ1YMR214W 1134 nt15.11■□□□□ 0.01
CCT8P47079 PET122YER153C 765 nt14.87□□□□□ -0.03
CCT8P47079 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.86□□□□□ -0.03
CCT8P47079 ATS1YAL020C 1002 nt14.59□□□□□ -0.07
CCT8P47079 SCR1SCR1 522 nt14.57□□□□□ -0.08
CCT8P47079 SHR5YOL110W 714 nt14.56□□□□□ -0.08
CCT8P47079 PUT4YOR348C 1884 nt14.45□□□□□ -0.1
CCT8P47079 RRN5YLR141W 1092 nt14.43□□□□□ -0.1
CCT8P47079 DEP1YAL013W 1218 nt14.34□□□□□ -0.11
CCT8P47079 URN1YPR152C 1398 nt14.33□□□□□ -0.12
CCT8P47079 YDJ1YNL064C 1230 nt14.32□□□□□ -0.12
CCT8P47079 SAH1YER043C 1350 nt14.16□□□□□ -0.14
CCT8P47079 ARE1YCR048W 1833 nt14.14□□□□□ -0.15
CCT8P47079 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.14□□□□□ -0.15
CCT8P47079 OPI9YLR338W 858 nt14.13□□□□□ -0.15
CCT8P47079 GAR1YHR089C 618 nt14.12□□□□□ -0.15
CCT8P47079 RSB1YOR049C 1065 nt14.05□□□□□ -0.16
CCT8P47079 POA1YBR022W 534 nt14.03□□□□□ -0.16
CCT8P47079 YNL208WYNL208W 600 nt13.98□□□□□ -0.17
CCT8P47079 RPN10YHR200W 807 nt13.97□□□□□ -0.17
CCT8P47079 SSA3YBL075C 1950 nt13.96□□□□□ -0.17
CCT8P47079 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.95□□□□□ -0.18
CCT8P47079 BSC6YOL137W 1494 nt13.73□□□□□ -0.21
CCT8P47079 PUN1YLR414C 792 nt13.68□□□□□ -0.22
CCT8P47079 BUD23YCR047C 828 nt13.64□□□□□ -0.23
CCT8P47079 YJR018WYJR018W 363 nt13.64□□□□□ -0.23
CCT8P47079 PTC2YER089C 1395 nt13.63□□□□□ -0.23
CCT8P47079 TIR1YER011W 765 nt13.62□□□□□ -0.23
CCT8P47079 PST2YDR032C 597 nt13.55□□□□□ -0.24
CCT8P47079 SSA1YAL005C 1929 nt13.54□□□□□ -0.24
CCT8P47079 Q0182Q0182 405 nt13.49□□□□□ -0.25
CCT8P47079 YJR120WYJR120W 351 nt13.46□□□□□ -0.25
CCT8P47079 NAB2YGL122C 1578 nt13.42□□□□□ -0.26
CCT8P47079 SRB2YHR041C 633 nt13.37□□□□□ -0.27
CCT8P47079 RPP2BYDR382W 333 nt13.26□□□□□ -0.29
CCT8P47079 FPR4YLR449W 1179 nt13.26□□□□□ -0.29
CCT8P47079 FIS1YIL065C 468 nt13.24□□□□□ -0.29
CCT8P47079 SPT5YML010W 3192 nt13.22□□□□□ -0.29
CCT8P47079 DAL1YIR027C 1383 nt13.21□□□□□ -0.29
CCT8P47079 INM2YDR287W 879 nt13.14□□□□□ -0.31
CCT8P47079 PHO4YFR034C 939 nt13.11□□□□□ -0.31
CCT8P47079 SHU1YHL006C 453 nt13.08□□□□□ -0.32
CCT8P47079 WWM1YFL010C 636 nt13.04□□□□□ -0.32
CCT8P47079 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.02□□□□□ -0.33
CCT8P47079 YBL100CYBL100C 315 nt13.01□□□□□ -0.33
CCT8P47079 BDH2YAL061W 1254 nt12.98□□□□□ -0.33
CCT8P47079 YPS1YLR120C 1710 nt12.91□□□□□ -0.34
CCT8P47079 YKL097CYKL097C 411 nt12.88□□□□□ -0.35
CCT8P47079 MEP2YNL142W 1500 nt12.88□□□□□ -0.35
CCT8P47079 FUN26YAL022C 1554 nt12.87□□□□□ -0.35
CCT8P47079 SSA4YER103W 1929 nt12.82□□□□□ -0.36
CCT8P47079 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.8□□□□□ -0.36
CCT8P47079 YDR095CYDR095C 411 nt12.79□□□□□ -0.36
CCT8P47079 HOM6YJR139C 1080 nt12.79□□□□□ -0.36
CCT8P47079 TRM9YML014W 840 nt12.79□□□□□ -0.36
CCT8P47079 YGR021WYGR021W 873 nt12.77□□□□□ -0.37
CCT8P47079 MNP1YGL068W 585 nt12.76□□□□□ -0.37
CCT8P47079 LSM3YLR438C-A 270 nt12.76□□□□□ -0.37
CCT8P47079 DCW1YKL046C 1350 nt12.75□□□□□ -0.37
CCT8P47079 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.73□□□□□ -0.37
CCT8P47079 ALF1YNL148C 765 nt12.7□□□□□ -0.38
CCT8P47079 MOT3YMR070W 1473 nt12.68□□□□□ -0.38
CCT8P47079 CCT6YDR188W 1641 nt12.65□□□□□ -0.38
CCT8P47079 RKM5YLR137W 1104 nt12.6□□□□□ -0.39
CCT8P47079 PTP1YDL230W 1008 nt12.59□□□□□ -0.39
CCT8P47079 RPP2AYOL039W 321 nt12.56□□□□□ -0.4
CCT8P47079 CAC2YML102W 1407 nt12.55□□□□□ -0.4
CCT8P47079 EMI2YDR516C 1503 nt12.53□□□□□ -0.4
CCT8P47079 SIS1YNL007C 1059 nt12.52□□□□□ -0.41
CCT8P47079 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.51□□□□□ -0.41
CCT8P47079 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.51□□□□□ -0.41
CCT8P47079 YOR139CYOR139C 393 nt12.47□□□□□ -0.41
CCT8P47079 ART5YGR068C 1761 nt12.41□□□□□ -0.42
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