RNA–Protein interactions for RNA: YPL178W

CBC2, Transcript of Small subunit of the heterodimeric cap binding complex with Sto1p, yeastyeast

Gene CBC2, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CBC2YPL178W PHO13P19881 312 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W DAL2P25335 343 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PGS1P25578 521 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W FRE1P32791 686 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SLA2P33338 968 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W STB5P38699 743 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W VFA1P40080 203 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YIR016WP40572 265 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W HXT8P40886 569 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W VPS25P47142 202 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W MUB1Q03162 620 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PPM1Q04081 328 aa5.7□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YMR084WA2P2R3 262 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W TPK1P06244 397 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YER152CP10356 443 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W CLC1P17891 233 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W VMA4P22203 233 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W LRE1P25579 583 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SPC110P32380 944 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W MET4P32389 672 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W TKL2P33315 681 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W JNM1P36224 373 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YMC2P38087 329 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W AGP2P38090 596 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W DYS1P38791 387 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W MAF1P41910 395 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W REF2P42073 533 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W HFM1P51979 1187 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W UME1Q03010 460 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W APC5Q08683 685 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W GPM2Q12008 311 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W HRT3Q12347 344 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W APM4Q99186 491 aa5.69□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W JIP3O13555 125 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W QCR6P00127 147 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W HMG2P12684 1045 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W VBA3P25594 458 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W CDC11P32458 415 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PEX2P32800 271 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W MPE1P35728 441 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W VBA5P36172 582 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YBR284WP38150 797 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YHR131CP38835 850 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W DSE1P40077 573 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W MOB1P40484 314 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W NUP85P46673 744 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W MND1P53102 219 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W HOP2P53187 214 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PRM6Q04705 352 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W HMI1Q12039 706 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W ATG9Q12142 997 aa5.68□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W CCH1P50077 2039 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W RPS3P05750 240 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SPE1P08432 466 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PDE1P22434 369 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PEX1P24004 1043 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SCJ1P25303 377 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W TSA1P34760 196 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W MDJ1P35191 511 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PEX28P38848 579 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W RTT107P38850 1070 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W RAD55P38953 406 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W TRE1Q08919 783 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W DAP1Q12091 152 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa5.67□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PDC6P26263 563 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W RDH54P38086 958 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W EXO5P38289 585 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SAF1P38352 637 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PSY2P40164 858 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YTA12P40341 825 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W MMM1P41800 426 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W IES1P43579 692 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PHO86P46956 311 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PFD1P46988 109 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YJL045WP47052 634 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W VTC4P47075 721 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W VPS70P47161 811 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W NSE5Q03718 556 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W ARO80Q04052 950 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W YCG1Q06680 1035 aa5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W TRP2P00899 507 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W TUP1P16649 713 aa5.65□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SPO12P17123 173 aa5.65□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W AEP2P22136 580 aa5.65□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W SAT4P25333 603 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W GYP6P32806 458 aa5.65□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W PXL1P36166 706 aa5.65□□□□□ -1.5
CBC2YPL178W CBR1P38626 284 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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