RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	PEX1	P24004	1043 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	ADY2	P25613	283 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	PET127	P32606	800 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	DID4	P36108	232 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	YEN1	P40028	759 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	NDC80	P40460	691 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	ECM9	Q02202	377 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	YMR210W	Q03649	449 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	VHS3	Q08438	674 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	APM4	Q99186	491 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	TSR4	P25040	408 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	YKU70	P32807	602 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	HXT7	P39004	570 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	THI7	Q05998	598 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	THI22	Q06490	572 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	USV1	Q12132	391 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	SEC65	P29478	273 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	OAF3	P36023	863 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	SET3	P36124	751 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	PIG2	P40187	538 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	IMO32	P53219	342 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	FHN1	P53279	174 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	YHM2	Q04013	314 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	HFI1	Q12060	488 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	POM34	Q12445	299 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	SEC15	P22224	910 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	KIN82	P25341	720 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	BCS1	P32839	456 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	YPT7	P32939	208 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	BIT2	P38346	545 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	BIT61	P47041	543 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	RFX1	P48743	811 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	YPS7	Q06325	596 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	ZRT2	Q12436	422 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YLR224W	YLR224W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	IME1	P21190	360 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	PRP28	P23394	588 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	SEC6	P32844	805 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YIL166C	P40445	542 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	IES1	P43579	692 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	PPN1	Q04119	674 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	TRE2	Q08693	809 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	GLG1	P36143	616 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	DUN1	P39009	513 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	ARG2	P40360	574 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YIL077C	P40508	320 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	PXA1	P41909	870 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	CTR1	P49573	406 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	SPO1	P53541	631 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	ATG4	P53867	494 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	STP4	Q07351	490 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	RMP1	Q12530	201 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	ABF1	P14164	731 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	NTH1	P32356	751 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	DAL3	P32459	195 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	EUG1	P32474	517 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	FAT1	P38225	669 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	PAF1	P38351	445 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	BDH2	P39713	417 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YEL020C	P39994	560 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	BUD8	P41698	603 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	NSE5	Q03718	556 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	TMA17	Q12513	150 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.62	□□□□□ -1.83	not detected
YLR224W	YLR224W	AEP2	P22136	580 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	DMC1	P25453	334 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	VID28	P40547	921 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	TAF4	P50105	388 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	SKY1	Q03656	742 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	HOF1	Q05080	669 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	COQ11	Q05892	277 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YFT2	Q06676	274 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	CDC26	P14724	124 aa		3.61	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.4 ms