RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	IRC5	P43610	853 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	MET14	Q02196	202 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	YLR040C	Q07988	224 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	ESC8	Q08119	714 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	IRC13	Q08630	104 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	NUP60	P39705	539 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	DAS1	P47005	663 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	TAF4	P50105	388 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	NSE5	Q03718	556 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	FRE5	Q08908	694 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	POM34	Q12445	299 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	PIF1	P07271	859 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	PEX1	P24004	1043 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	MTC7	P32633	139 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.24	□□□□□ -1.57	not detected
RPC17	YJL011C	YJL163C	P46996	555 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	ADY4	Q05955	493 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	NYV1	Q12255	253 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	GAL1	P04385	528 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	KCC4	P25389	1037 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	DGR2	P32330	852 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	KTR4	P38131	464 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	YHR033W	P38690	423 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	YEL076C	P39971	216 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	PXA1	P41909	870 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	UBC11	P52492	156 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	PIP2	P52960	996 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	HOL1	P53389	586 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	SPO1	P53541	631 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	AIM39	Q08223	395 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	KIN82	P25341	720 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	PRE4	P30657	266 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	KIN4	Q01919	800 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPC17	YJL011C	ALG7	P07286	448 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	GIP4	P39732	760 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	YIL092W	P40497	633 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	YIL077C	P40508	320 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PRM2	P40534	656 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	RNT1	Q02555	471 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PPN1	Q04119	674 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	MLC2	Q06580	163 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	NUR1	Q12066	484 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	SIR3	P06701	978 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	TUP1	P16649	713 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PHO3	P24031	467 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	BCS1	P32839	456 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	SFB3	P38810	929 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	STL1	P39932	569 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	FMP52	P40008	231 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	RFX1	P48743	811 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	HMG2	P12684	1045 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	CDS1	P38221	457 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	SUL1	P38359	859 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.19	□□□□□ -1.58	not detected
RPC17	YJL011C	PIG2	P40187	538 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	MNT2	P53059	558 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	YOL073C	Q08232	322 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PSF3	Q12146	194 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	VPS5	Q92331	675 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PTP2	P29461	750 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	TRM2	P33753	639 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PHO11	P35842	467 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	YKL133C	P36066	463 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PPS1	P38148	807 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	COS111	P38308	924 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PHO12	P38693	467 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	FTR1	P40088	404 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	AIM21	P40563	679 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	MAD2	P40958	196 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	YDL183C	P48569	320 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	FHN1	P53279	174 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	UBX4	P54730	416 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	TIM50	Q02776	476 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	YFT2	Q06676	274 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	HOP1	P20050	605 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPC17	YJL011C	SEC15	P22224	910 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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