RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeastyeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1YDR457W RTT109Q07794 436 aa2.84□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CTI6Q08923 506 aa2.84□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W MGM1P32266 881 aa2.84□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CUE1P38428 203 aa2.84□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W SCC4P40090 624 aa2.84□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ALA1P40825 983 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ERG12P07277 443 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W MAS2P11914 482 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W HNM1P19807 563 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W RIT1P23796 513 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CAD1P24813 409 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W MEF1P25039 761 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W MCM4P30665 933 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CAB2P40506 365 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W YGL108CP53139 140 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W PEX30Q06169 523 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W SRL2Q12020 392 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W DRS2P39524 1355 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W PRI1P10363 409 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ERG11P10614 530 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W GRR1P24814 1151 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CMK1P27466 446 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W PEX3P28795 441 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W EUG1P32474 517 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W NIC96P34077 839 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W MAP2P38174 421 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W COS8P38723 381 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W OSH7P38755 437 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W AXL1P40851 1208 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ATF2P53296 535 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W IPI3P53877 555 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CSN9Q03981 162 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W NUR1Q12066 484 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ARG82P07250 355 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W NFT1P0CE68 1218 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ADH4P10127 382 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W VAN1P23642 535 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W GPI10P30777 616 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W HSE1P38753 452 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W UBP7P40453 1071 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W MKT1P40850 830 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ELP2P42935 788 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W NPA3P47122 385 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CBK1P53894 756 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W MEH1Q02205 184 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W YOL057WQ08225 711 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W KRE5P22023 1365 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W COS2P0CX12 379 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W COS3P0CX13 379 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W RAM1P22007 431 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W MGT1P26188 188 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W GCD11P32481 527 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W PDR3P33200 976 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W UBX7P38349 436 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W HAT2P39984 401 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W AIP1P46680 615 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W SHR3Q02774 210 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W SIZ1Q04195 904 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W PEX12Q04370 399 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ARP9Q05123 467 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W YOR214CQ12282 236 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W HRT3Q12347 344 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W CHD1P32657 1468 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W GSY2P27472 705 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W VMA22P38784 181 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W LRP1P38801 184 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W FHL1P39521 936 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W IRC6P43615 237 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W HAP5Q02516 242 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W YEH2Q07950 538 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W GRX6Q12438 231 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W SRB8P25648 1427 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W SEN2P16658 377 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W HSP60P19882 572 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W VMA5P31412 392 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W TFB1P32776 642 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W YBR259WP38338 688 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W RTS2P40962 232 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W YDR248CQ03786 193 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W GNT1Q12096 491 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W IDP1P21954 428 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W HSM3P38348 480 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W APM2P38700 605 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W NPR2P39923 615 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W LSM8P47093 109 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W YNL140CP53910 189 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W TIM8P57744 87 aa2.83□□□□□ -1.96
TOM1YDR457W NUP116Q02630 1113 aa2.83□□□□□ -1.96
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