RNA–Protein interactions for RNA: YBR267W

REI1, Transcript of Cytoplasmic pre-60S factor, yeast

Gene REI1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REI1	YBR267W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PCK1	P10963	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MSH3	P25336	1018 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YSC83	P32792	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SEG2	P34250	1132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	KDX1	P36005	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RGA1	P39083	1007 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	VTC2	P43585	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
REI1	YBR267W	YGR153W	P48238	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	VPS75	P53853	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YNL165W	P53891	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	STP1	Q00947	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	VTC3	Q02725	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	GAL80	P04387	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
REI1	YBR267W	SEC65	P29478	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SPC110	P32380	944 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YET1	P35723	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SAP190	P36123	1033 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YBR284W	P38150	797 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	NEM1	P38757	446 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SPT8	P38915	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	UBP5	P39944	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	QDR2	P40474	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	THI6	P41835	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	DAK2	P43550	591 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	POL31	P46957	487 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YJR115W	P47152	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YGR237C	P50089	785 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ENV11	P53246	860 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YNL011C	P53980	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SLG1	P54867	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YML053C	Q04978	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	APL4	Q12028	832 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TAF10	Q12030	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SFI1	Q12369	946 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	APM4	Q99186	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CIT2	P08679	460 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PHO13	P19881	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PDE1	P22434	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MRC1	P25588	1096 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PRR1	P28708	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	HIR1	P32479	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PEP7	P32609	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CSE1	P33307	960 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PCH2	P38126	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PIH1	P38768	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YHR054C	P38780	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RTT107	P38850	1070 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YEL076C	P39971	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CEP3	P40969	608 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	UBA2	P52488	636 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TAM41	P53230	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	LSC2	P53312	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SPC98	P53540	846 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ARK1	P53974	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TLG2	Q08144	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CTF3	Q12748	733 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	LAA1	P39526	2014 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PET123	P17558	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PSO2	P30620	661 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	KAP122	P32767	1081 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PEX2	P32800	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SLA2	P33338	968 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	BCD1	P38772	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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