Protein–RNA interactions for Protein: Q12428

PDH1, Probable 2-methylcitrate dehydratase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDH1Q12428 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.1■□□□□ 0.97
PDH1Q12428 NOP1YDL014W 984 nt20.7■□□□□ 0.9
PDH1Q12428 NSR1YGR159C 1245 nt20.61■□□□□ 0.89
PDH1Q12428 YKL036CYKL036C 393 nt19.48■□□□□ 0.71
PDH1Q12428 YJL027CYJL027C 417 nt18.26■□□□□ 0.51
PDH1Q12428 Q0297Q0297 156 nt18.24■□□□□ 0.51
PDH1Q12428 SRX1YKL086W 384 nt18.07■□□□□ 0.48
PDH1Q12428 SCS3YGL126W 1143 nt17.92■□□□□ 0.46
PDH1Q12428 MDJ1YFL016C 1536 nt17.88■□□□□ 0.45
PDH1Q12428 YCR051WYCR051W 669 nt17.19■□□□□ 0.34
PDH1Q12428 YOL085CYOL085C 342 nt16.86■□□□□ 0.29
PDH1Q12428 PKP1YIL042C 1185 nt16.55■□□□□ 0.24
PDH1Q12428 SCJ1YMR214W 1134 nt16.43■□□□□ 0.22
PDH1Q12428 RPP1BYDL130W 321 nt16.37■□□□□ 0.21
PDH1Q12428 ATS1YAL020C 1002 nt16.16■□□□□ 0.18
PDH1Q12428 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.08■□□□□ 0.16
PDH1Q12428 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.08■□□□□ 0.16
PDH1Q12428 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.08■□□□□ 0.16
PDH1Q12428 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.08■□□□□ 0.16
PDH1Q12428 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.08■□□□□ 0.16
PDH1Q12428 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.08■□□□□ 0.16
PDH1Q12428 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.08■□□□□ 0.16
PDH1Q12428 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.08■□□□□ 0.16
PDH1Q12428 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.08■□□□□ 0.16
PDH1Q12428 DBP2YNL112W 1641 nt15.97■□□□□ 0.15
PDH1Q12428 CCC1YLR220W 969 nt15.94■□□□□ 0.14
PDH1Q12428 PET122YER153C 765 nt15.58■□□□□ 0.08
PDH1Q12428 SCR1SCR1 522 nt15.56■□□□□ 0.08
PDH1Q12428 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.37■□□□□ 0.05
PDH1Q12428 RRN5YLR141W 1092 nt15.19■□□□□ 0.02
PDH1Q12428 RVS167YDR388W 1449 nt15.16■□□□□ 0.02
PDH1Q12428 YBR190WYBR190W 312 nt15.15■□□□□ 0.02
PDH1Q12428 RSB1YOR049C 1065 nt15□□□□□ -0.01
PDH1Q12428 RTC3YHR087W 336 nt14.94□□□□□ -0.02
PDH1Q12428 PST2YDR032C 597 nt14.89□□□□□ -0.03
PDH1Q12428 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.89□□□□□ -0.03
PDH1Q12428 YDJ1YNL064C 1230 nt14.86□□□□□ -0.03
PDH1Q12428 SHR5YOL110W 714 nt14.72□□□□□ -0.05
PDH1Q12428 YKL097CYKL097C 411 nt14.53□□□□□ -0.08
PDH1Q12428 GAR1YHR089C 618 nt14.46□□□□□ -0.09
PDH1Q12428 SHU1YHL006C 453 nt14.18□□□□□ -0.14
PDH1Q12428 DEP1YAL013W 1218 nt14.16□□□□□ -0.14
PDH1Q12428 URN1YPR152C 1398 nt14.05□□□□□ -0.16
PDH1Q12428 YNL208WYNL208W 600 nt14□□□□□ -0.17
PDH1Q12428 TIR1YER011W 765 nt13.96□□□□□ -0.17
PDH1Q12428 RPN10YHR200W 807 nt13.96□□□□□ -0.17
PDH1Q12428 YOR139CYOR139C 393 nt13.85□□□□□ -0.19
PDH1Q12428 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.84□□□□□ -0.19
PDH1Q12428 OPI9YLR338W 858 nt13.76□□□□□ -0.21
PDH1Q12428 SSA1YAL005C 1929 nt13.68□□□□□ -0.22
PDH1Q12428 NPL3YDR432W 1245 nt13.67□□□□□ -0.22
PDH1Q12428 SAH1YER043C 1350 nt13.56□□□□□ -0.24
PDH1Q12428 SRB2YHR041C 633 nt13.52□□□□□ -0.25
PDH1Q12428 YGR021WYGR021W 873 nt13.47□□□□□ -0.25
PDH1Q12428 YJR018WYJR018W 363 nt13.43□□□□□ -0.26
PDH1Q12428 HOM6YJR139C 1080 nt13.43□□□□□ -0.26
PDH1Q12428 MNP1YGL068W 585 nt13.42□□□□□ -0.26
PDH1Q12428 WWM1YFL010C 636 nt13.41□□□□□ -0.26
PDH1Q12428 PUT4YOR348C 1884 nt13.4□□□□□ -0.26
PDH1Q12428 YOL037CYOL037C 354 nt13.38□□□□□ -0.27
PDH1Q12428 PUN1YLR414C 792 nt13.37□□□□□ -0.27
PDH1Q12428 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.3□□□□□ -0.28
PDH1Q12428 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.3□□□□□ -0.28
PDH1Q12428 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.3□□□□□ -0.28
PDH1Q12428 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.3□□□□□ -0.28
PDH1Q12428 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.3□□□□□ -0.28
PDH1Q12428 RPP2BYDR382W 333 nt13.29□□□□□ -0.28
PDH1Q12428 ARE1YCR048W 1833 nt13.29□□□□□ -0.28
PDH1Q12428 YJR120WYJR120W 351 nt13.28□□□□□ -0.28
PDH1Q12428 RKM5YLR137W 1104 nt13.24□□□□□ -0.29
PDH1Q12428 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.2□□□□□ -0.3
PDH1Q12428 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.13□□□□□ -0.31
PDH1Q12428 PTC2YER089C 1395 nt13.12□□□□□ -0.31
PDH1Q12428 BDH2YAL061W 1254 nt13.08□□□□□ -0.32
PDH1Q12428 PUS2YGL063W 1113 nt13.07□□□□□ -0.32
PDH1Q12428 POA1YBR022W 534 nt13.05□□□□□ -0.32
PDH1Q12428 SSA3YBL075C 1950 nt13.05□□□□□ -0.32
PDH1Q12428 YLR281CYLR281C 468 nt13.04□□□□□ -0.32
PDH1Q12428 LSM3YLR438C-A 270 nt13.01□□□□□ -0.33
PDH1Q12428 MOT3YMR070W 1473 nt12.94□□□□□ -0.34
PDH1Q12428 WHI5YOR083W 888 nt12.94□□□□□ -0.34
PDH1Q12428 INM2YDR287W 879 nt12.92□□□□□ -0.34
PDH1Q12428 NAB2YGL122C 1578 nt12.9□□□□□ -0.35
PDH1Q12428 BUD23YCR047C 828 nt12.89□□□□□ -0.35
PDH1Q12428 YBL100CYBL100C 315 nt12.85□□□□□ -0.35
PDH1Q12428 DAL1YIR027C 1383 nt12.81□□□□□ -0.36
PDH1Q12428 FPR4YLR449W 1179 nt12.8□□□□□ -0.36
PDH1Q12428 TRM9YML014W 840 nt12.78□□□□□ -0.36
PDH1Q12428 BSC6YOL137W 1494 nt12.77□□□□□ -0.37
PDH1Q12428 Q0182Q0182 405 nt12.75□□□□□ -0.37
PDH1Q12428 FMP45YDL222C 930 nt12.73□□□□□ -0.37
PDH1Q12428 FIS1YIL065C 468 nt12.72□□□□□ -0.37
PDH1Q12428 DSK2YMR276W 1122 nt12.71□□□□□ -0.37
PDH1Q12428 FUN26YAL022C 1554 nt12.7□□□□□ -0.38
PDH1Q12428 YPR011CYPR011C 981 nt12.69□□□□□ -0.38
PDH1Q12428 PHO4YFR034C 939 nt12.67□□□□□ -0.38
PDH1Q12428 IMP2'YIL154C 1041 nt12.67□□□□□ -0.38
PDH1Q12428 YCH1YGR203W 447 nt12.63□□□□□ -0.39
PDH1Q12428 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.63□□□□□ -0.39
PDH1Q12428 YLR236CYLR236C 324 nt12.62□□□□□ -0.39
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