RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	GPM2	Q12008	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	COX6	P00427	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	ASF1	P32447	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TFB1	P32776	642 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TKL2	P33315	681 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SAP190	P36123	1033 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	NUP60	P39705	539 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	GDH3	P39708	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	UBA2	P52488	636 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
YNL057W	YNL057W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	OPT2	Q06593	877 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	FLC1	Q08967	793 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	DCS2	Q12123	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	ALG1	P16661	449 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	CKA2	P19454	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	KIN3	P22209	435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YEL1	P34225	687 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	PPS1	P38148	807 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	RAD55	P38953	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YIR007W	P40566	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	PTC5	Q12511	572 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	BI4	P03879	638 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	DAL1	P32375	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	LEU5	P38702	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	RTC4	P53850	401 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YNL011C	P53980	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	HPF1	Q05164	967 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	CUR1	Q06469	252 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	MSF1	P08425	469 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	REV1	P12689	985 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	DAL7	P21826	554 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	MET4	P32389	672 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SRX1	P36077	127 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YBR225W	P38321	900 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	PIK1	P39104	1066 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	AVT2	P39981	480 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	NPP2	P39997	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	OSW5	P40219	148 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	NPA3	P47122	385 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TOF2	Q02208	771 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	MUB1	Q03162	620 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	RAD3	P06839	778 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	CHS1	P08004	1131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	PHO8	P11491	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	SEC2	P17065	759 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	FRE1	P32791	686 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
YNL057W	YNL057W	ATG12	P38316	186 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YHL017W	P38745	532 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YPS6	P40583	537 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	CTF18	P49956	741 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	NPY1	P53164	384 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	SNF5	P18480	905 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.2 ms