RNA–Protein interactions for RNA: YOR104W

PIN2, Transcript of Exomer-dependent cargo protein, yeast

Gene PIN2, Length 849 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIN2	YOR104W	PTC5	Q12511	572 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	FOB1	O13329	566 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	IME2	P32581	645 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	ATG19	P35193	415 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	YEL025C	P39991	1188 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	YGR153W	P48238	217 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	YMR321C	Q04898	105 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	FUS2	Q05670	677 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	SRD1	P09007	221 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	MBR1	P23493	339 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	MSP1	P28737	362 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	UBP11	P36026	717 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	SEA4	P38164	1038 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	DJP1	P40564	432 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	THI6	P41835	540 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	SKP2	P42843	763 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	VTC2	P43585	828 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	UBA2	P52488	636 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	PGA2	P53903	129 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	CTR9	P89105	1077 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	GPI13	Q07830	1017 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	SMC5	Q08204	1093 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	RTP1	Q12751	981 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	NUP82	P40368	713 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	FIS1	P40515	155 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	CIR1	P42940	261 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	CTR1	P49573	406 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	SEC5	P89102	971 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	ADY4	Q05955	493 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	GIC2	Q06648	383 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	MAS2	P11914	482 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	CDC15	P27636	974 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	VPS35	P34110	944 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	UIP5	P36137	443 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	PET10	P36139	283 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	SIP3	P38717	1229 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	YFL040W	P43562	540 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	DIP5	P53388	608 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	SDH1	Q00711	640 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	FMP30	Q02883	468 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	MSC2	Q03455	724 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	PSR2	Q07949	397 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PIN2	YOR104W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	YLR464W	P0CX17	216 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	RPC53	P25441	422 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	HIR1	P32479	840 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	BCS1	P32839	456 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	FLR1	P38124	548 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	PIH1	P38768	344 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	YER130C	P39959	443 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	YEL076C	P39971	216 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	YPT11	P48559	417 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	SCS3	P53012	380 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	HFI1	Q12060	488 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	HIF1	Q12373	385 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	ATG11	Q12527	1178 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	DID4	P36108	232 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	UBP13	P38187	747 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	AFG3	P39925	761 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	EAF5	P39995	279 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	OSW2	Q12202	724 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	GPA1	P08539	472 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	PCK1	P10963	549 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	KIN82	P25341	720 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PIN2	YOR104W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44

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