Protein–RNA interactions for Protein: Q06648

GIC2, GTPase-interacting component 2, yeastyeast

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIC2Q06648 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.41■□□□□ 0.7
GIC2Q06648 NSR1YGR159C 1245 nt19.2■□□□□ 0.66
GIC2Q06648 NOP1YDL014W 984 nt18.99■□□□□ 0.63
GIC2Q06648 YKL036CYKL036C 393 nt17.63■□□□□ 0.41
GIC2Q06648 MDJ1YFL016C 1536 nt16.84■□□□□ 0.29
GIC2Q06648 Q0297Q0297 156 nt16.65■□□□□ 0.26
GIC2Q06648 SRX1YKL086W 384 nt16.56■□□□□ 0.24
GIC2Q06648 YJL027CYJL027C 417 nt16.48■□□□□ 0.23
GIC2Q06648 SCS3YGL126W 1143 nt16.1■□□□□ 0.17
GIC2Q06648 YCR051WYCR051W 669 nt15.71■□□□□ 0.11
GIC2Q06648 YOL085CYOL085C 342 nt15.25■□□□□ 0.03
GIC2Q06648 PKP1YIL042C 1185 nt14.97□□□□□ -0.01
GIC2Q06648 DBP2YNL112W 1641 nt14.96□□□□□ -0.01
GIC2Q06648 RPP1BYDL130W 321 nt14.94□□□□□ -0.02
GIC2Q06648 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.88□□□□□ -0.03
GIC2Q06648 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.88□□□□□ -0.03
GIC2Q06648 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.88□□□□□ -0.03
GIC2Q06648 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.88□□□□□ -0.03
GIC2Q06648 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.88□□□□□ -0.03
GIC2Q06648 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.88□□□□□ -0.03
GIC2Q06648 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.88□□□□□ -0.03
GIC2Q06648 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.88□□□□□ -0.03
GIC2Q06648 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.88□□□□□ -0.03
GIC2Q06648 CCC1YLR220W 969 nt14.7□□□□□ -0.06
GIC2Q06648 SCJ1YMR214W 1134 nt14.51□□□□□ -0.09
GIC2Q06648 ATS1YAL020C 1002 nt14.45□□□□□ -0.1
GIC2Q06648 YBR190WYBR190W 312 nt14.37□□□□□ -0.11
GIC2Q06648 PET122YER153C 765 nt14.22□□□□□ -0.13
GIC2Q06648 Q0182Q0182 405 nt14.21□□□□□ -0.13
GIC2Q06648 RVS167YDR388W 1449 nt14.17□□□□□ -0.14
GIC2Q06648 SCR1SCR1 522 nt14.16□□□□□ -0.14
GIC2Q06648 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.12□□□□□ -0.15
GIC2Q06648 RTC3YHR087W 336 nt14.04□□□□□ -0.16
GIC2Q06648 RRN5YLR141W 1092 nt13.83□□□□□ -0.2
GIC2Q06648 SSA3YBL075C 1950 nt13.78□□□□□ -0.2
GIC2Q06648 MOT3YMR070W 1473 nt13.73□□□□□ -0.21
GIC2Q06648 SHR5YOL110W 714 nt13.7□□□□□ -0.22
GIC2Q06648 YDJ1YNL064C 1230 nt13.69□□□□□ -0.22
GIC2Q06648 RSB1YOR049C 1065 nt13.6□□□□□ -0.23
GIC2Q06648 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.57□□□□□ -0.24
GIC2Q06648 PST2YDR032C 597 nt13.36□□□□□ -0.27
GIC2Q06648 GAR1YHR089C 618 nt13.32□□□□□ -0.28
GIC2Q06648 DEP1YAL013W 1218 nt13.2□□□□□ -0.3
GIC2Q06648 URN1YPR152C 1398 nt13.2□□□□□ -0.3
GIC2Q06648 RPN10YHR200W 807 nt13.09□□□□□ -0.31
GIC2Q06648 YNL208WYNL208W 600 nt13.07□□□□□ -0.32
GIC2Q06648 OPI9YLR338W 858 nt12.99□□□□□ -0.33
GIC2Q06648 YKL097CYKL097C 411 nt12.92□□□□□ -0.34
GIC2Q06648 PUT4YOR348C 1884 nt12.89□□□□□ -0.35
GIC2Q06648 TIR1YER011W 765 nt12.88□□□□□ -0.35
GIC2Q06648 SAH1YER043C 1350 nt12.83□□□□□ -0.36
GIC2Q06648 SHU1YHL006C 453 nt12.76□□□□□ -0.37
GIC2Q06648 ARE1YCR048W 1833 nt12.7□□□□□ -0.38
GIC2Q06648 SSA1YAL005C 1929 nt12.67□□□□□ -0.38
GIC2Q06648 PUN1YLR414C 792 nt12.63□□□□□ -0.39
GIC2Q06648 YJR018WYJR018W 363 nt12.61□□□□□ -0.39
GIC2Q06648 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.55□□□□□ -0.4
GIC2Q06648 POA1YBR022W 534 nt12.5□□□□□ -0.41
GIC2Q06648 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.48□□□□□ -0.41
GIC2Q06648 SRB2YHR041C 633 nt12.45□□□□□ -0.42
GIC2Q06648 RPP2BYDR382W 333 nt12.42□□□□□ -0.42
GIC2Q06648 PTC2YER089C 1395 nt12.42□□□□□ -0.42
GIC2Q06648 YJR120WYJR120W 351 nt12.41□□□□□ -0.42
GIC2Q06648 YGR021WYGR021W 873 nt12.35□□□□□ -0.43
GIC2Q06648 YOR139CYOR139C 393 nt12.34□□□□□ -0.43
GIC2Q06648 WWM1YFL010C 636 nt12.31□□□□□ -0.44
GIC2Q06648 FPS1YLL043W 2010 nt12.31□□□□□ -0.44
GIC2Q06648 HOM6YJR139C 1080 nt12.28□□□□□ -0.44
GIC2Q06648 BUD23YCR047C 828 nt12.27□□□□□ -0.45
GIC2Q06648 NAB2YGL122C 1578 nt12.26□□□□□ -0.45
GIC2Q06648 NPL3YDR432W 1245 nt12.24□□□□□ -0.45
GIC2Q06648 MNP1YGL068W 585 nt12.21□□□□□ -0.45
GIC2Q06648 BSC6YOL137W 1494 nt12.2□□□□□ -0.46
GIC2Q06648 BDH2YAL061W 1254 nt12.18□□□□□ -0.46
GIC2Q06648 INM2YDR287W 879 nt12.16□□□□□ -0.46
GIC2Q06648 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.16□□□□□ -0.46
GIC2Q06648 YOL037CYOL037C 354 nt12.14□□□□□ -0.47
GIC2Q06648 DAL1YIR027C 1383 nt12.13□□□□□ -0.47
GIC2Q06648 NVJ2YPR091C 2313 nt12.11□□□□□ -0.47
GIC2Q06648 RKM5YLR137W 1104 nt12.11□□□□□ -0.47
GIC2Q06648 LSM3YLR438C-A 270 nt12.08□□□□□ -0.48
GIC2Q06648 FIS1YIL065C 468 nt12.07□□□□□ -0.48
GIC2Q06648 FPR4YLR449W 1179 nt12.07□□□□□ -0.48
GIC2Q06648 YBL100CYBL100C 315 nt12.05□□□□□ -0.48
GIC2Q06648 PHO4YFR034C 939 nt11.99□□□□□ -0.49
GIC2Q06648 PAC11YDR488C 1602 nt11.97□□□□□ -0.49
GIC2Q06648 TRM9YML014W 840 nt11.93□□□□□ -0.5
GIC2Q06648 FUN26YAL022C 1554 nt11.91□□□□□ -0.5
GIC2Q06648 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.87□□□□□ -0.51
GIC2Q06648 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.87□□□□□ -0.51
GIC2Q06648 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.87□□□□□ -0.51
GIC2Q06648 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.87□□□□□ -0.51
GIC2Q06648 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.87□□□□□ -0.51
GIC2Q06648 YLR281CYLR281C 468 nt11.81□□□□□ -0.52
GIC2Q06648 CCT6YDR188W 1641 nt11.8□□□□□ -0.52
GIC2Q06648 WHI5YOR083W 888 nt11.75□□□□□ -0.53
GIC2Q06648 PUS2YGL063W 1113 nt11.73□□□□□ -0.53
GIC2Q06648 ALF1YNL148C 765 nt11.73□□□□□ -0.53
GIC2Q06648 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.72□□□□□ -0.53
GIC2Q06648 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms