RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W MAS1P10507 462 aa9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W PGS1P25578 521 aa9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W PIH1P38768 344 aa9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W LSB6P42951 607 aa9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W BFA1P47113 574 aa9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W YGR153WP48238 217 aa9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W EEB1Q02891 456 aa9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W REC8Q12188 680 aa9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W OSH2Q12451 1283 aa9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W CYS3P31373 394 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W ENV11P53246 860 aa9.97□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W ARK1P53974 638 aa9.97□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W TRS130Q03660 1102 aa9.97□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W HIS5P07172 385 aa9.96□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W ALG1P16661 449 aa9.96□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W HCM1P25364 564 aa9.96□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W NUP82P40368 713 aa9.96□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SHE10P53075 577 aa9.96□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W RTC4P53850 401 aa9.96□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PSK2Q08217 1101 aa9.96□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W DCS2Q12123 353 aa9.96□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W YEL076C-AP0CX16 216 aa9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W YLR464WP0CX17 216 aa9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W CKA2P19454 339 aa9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W NAM7P30771 971 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SEG2P34250 1132 aa9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PGM2P37012 569 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W MMS4P38257 691 aa9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W YEL076CP39971 216 aa9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W NSE5Q03718 556 aa9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W ADY4Q05955 493 aa9.95□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PFK1P16861 987 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W VTC3Q02725 835 aa9.94□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W MFB1Q04922 465 aa9.94□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W NSE1Q07913 336 aa9.94□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W TRP2P00899 507 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PDE1P22434 369 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data9.93□□□□□ -0.82not detected
CPD1YGR247W SGF29P25554 259 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PEX34P25584 144 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W YSC83P32792 385 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SIP5P40210 489 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W ENT3P47160 408 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W CTF18P49956 741 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W STB4P50104 949 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W TAM41P53230 385 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SPC98P53540 846 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W ADA2Q02336 434 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SHS1Q07657 551 aa9.93□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PRR1P28708 518 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W RAM2P29703 316 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W TRM2P33753 639 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PTC4P38089 393 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W YBR284WP38150 797 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data9.92□□□□□ -0.82not detected
CPD1YGR247W ORC5P50874 479 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W GUP1P53154 560 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SFB2P53953 876 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W STP1Q00947 519 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PTC5Q12511 572 aa9.92□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W RNR2P09938 399 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W MNN4P36044 1178 aa9.91□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PET10P36139 283 aa9.91□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W UBP13P38187 747 aa9.91□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W ULI1P43604 169 aa9.91□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SLG1P54867 378 aa9.91□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W CUR1Q06469 252 aa9.91□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W APM4Q99186 491 aa9.91□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W TAF13P11747 167 aa9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W RGD1P38339 666 aa9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W UBP5P39944 805 aa9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W FYV8P46949 817 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W ATH1P48016 1211 aa9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W UBA2P52488 636 aa9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W TOF1P53840 1238 aa9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W FAR11P53917 953 aa9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W PEX19Q07418 342 aa9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W FMP25Q08023 583 aa9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CPD1YGR247W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W GAL80P04387 435 aa9.89□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W SPO11P23179 398 aa9.89□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W VPS3P23643 1011 aa9.89□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W THI6P41835 540 aa9.89□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W TAF1P46677 1066 aa9.89□□□□□ -0.83
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