RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	MET10	P39692	1035 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	GIP2	P40036	548 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	FYV10	P40492	516 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	LSB6	P42951	607 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YJR008W	P47085	338 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YJR124C	P47159	448 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YGR122W	P53272	402 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SPR28	Q04921	423 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PSK2	Q08217	1101 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	DUR3	P33413	735 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	BEM4	P39011	633 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	BOI2	P39969	1040 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	INP52	P50942	1183 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YAF9	P53930	226 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RTC1	Q08281	1341 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SEC6	P32844	805 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YKL077W	P36081	392 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	UBP12	P39538	1254 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YIR042C	P40586	236 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ASI1	P54074	624 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	FMP30	Q02883	468 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YML119W	Q03208	357 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ARO80	Q04052	950 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ENT1	Q12518	454 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	NUF2	P33895	451 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	TFA2	P36145	328 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RIM11	P38615	370 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ERC1	P38767	581 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	FAA3	P39002	694 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	TED1	P40533	473 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ULP1	Q02724	621 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SPO19	Q03029	223 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	GIS4	Q04233	774 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	THI72	Q08579	599 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	APC5	Q08683	685 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MCD1	Q12158	566 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	FAR1	P21268	830 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	EFM2	P38347	419 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SPC72	P39723	622 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YNR065C	P53751	1116 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	DSL1	P53847	754 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PEX13	P80667	386 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	GDE1	Q02979	1223 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RMD1	Q03441	430 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SPO71	Q03868	1245 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	IQG1	Q12280	1495 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	DNF2	Q12675	1612 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	CYC8	P14922	966 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SAC7	P17121	654 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ELM1	P32801	640 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SRL3	P36167	246 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SIT1	P39980	628 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	IES1	P43579	692 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	FAR11	P53917	953 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ADI1	Q03677	179 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SVF1	Q05515	481 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	TOS4	Q06266	489 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	KOG1	P38873	1557 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SNF2	P22082	1703 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	UGA4	P32837	571 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PAN5	P38787	379 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MET18	P40469	1032 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SAP155	P43612	1002 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ORM1	P53224	222 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RSM28	Q03430	361 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SSO1	P32867	290 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	UIP5	P36137	443 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MAD1	P40957	749 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	POL31	P46957	487 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PNG1	Q02890	363 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YPL109C	Q02981	657 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.2 ms