Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.85■□□□□ 0.93
CLP1Q08685 NSR1YGR159C 1245 nt20.47■□□□□ 0.87
CLP1Q08685 NOP1YDL014W 984 nt20.4■□□□□ 0.86
CLP1Q08685 YKL036CYKL036C 393 nt18.99■□□□□ 0.63
CLP1Q08685 MDJ1YFL016C 1536 nt17.92■□□□□ 0.46
CLP1Q08685 Q0297Q0297 156 nt17.82■□□□□ 0.44
CLP1Q08685 YJL027CYJL027C 417 nt17.81■□□□□ 0.44
CLP1Q08685 SRX1YKL086W 384 nt17.74■□□□□ 0.43
CLP1Q08685 SCS3YGL126W 1143 nt17.34■□□□□ 0.37
CLP1Q08685 YCR051WYCR051W 669 nt16.94■□□□□ 0.3
CLP1Q08685 YOL085CYOL085C 342 nt16.39■□□□□ 0.21
CLP1Q08685 PKP1YIL042C 1185 nt16.16■□□□□ 0.18
CLP1Q08685 RPP1BYDL130W 321 nt16.02■□□□□ 0.16
CLP1Q08685 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.86■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.86■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.86■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.86■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.86■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.86■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.86■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.86■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.86■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 DBP2YNL112W 1641 nt15.85■□□□□ 0.13
CLP1Q08685 CCC1YLR220W 969 nt15.83■□□□□ 0.12
CLP1Q08685 SCJ1YMR214W 1134 nt15.68■□□□□ 0.1
CLP1Q08685 ATS1YAL020C 1002 nt15.59■□□□□ 0.09
CLP1Q08685 SCR1SCR1 522 nt15.29■□□□□ 0.04
CLP1Q08685 PET122YER153C 765 nt15.26■□□□□ 0.03
CLP1Q08685 YBR190WYBR190W 312 nt15.23■□□□□ 0.03
CLP1Q08685 RVS167YDR388W 1449 nt15.18■□□□□ 0.02
CLP1Q08685 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.12■□□□□ 0.01
CLP1Q08685 RTC3YHR087W 336 nt15.02■□□□□ -0
CLP1Q08685 RRN5YLR141W 1092 nt14.87□□□□□ -0.03
CLP1Q08685 RSB1YOR049C 1065 nt14.7□□□□□ -0.06
CLP1Q08685 YDJ1YNL064C 1230 nt14.61□□□□□ -0.07
CLP1Q08685 SHR5YOL110W 714 nt14.61□□□□□ -0.07
CLP1Q08685 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.54□□□□□ -0.08
CLP1Q08685 PST2YDR032C 597 nt14.35□□□□□ -0.11
CLP1Q08685 GAR1YHR089C 618 nt14.31□□□□□ -0.12
CLP1Q08685 SSA3YBL075C 1950 nt14.28□□□□□ -0.12
CLP1Q08685 DEP1YAL013W 1218 nt14.15□□□□□ -0.14
CLP1Q08685 URN1YPR152C 1398 nt14.08□□□□□ -0.16
CLP1Q08685 RPN10YHR200W 807 nt14.01□□□□□ -0.17
CLP1Q08685 YKL097CYKL097C 411 nt14.01□□□□□ -0.17
CLP1Q08685 YNL208WYNL208W 600 nt13.95□□□□□ -0.18
CLP1Q08685 TIR1YER011W 765 nt13.8□□□□□ -0.2
CLP1Q08685 OPI9YLR338W 858 nt13.78□□□□□ -0.2
CLP1Q08685 SHU1YHL006C 453 nt13.73□□□□□ -0.21
CLP1Q08685 SAH1YER043C 1350 nt13.64□□□□□ -0.23
CLP1Q08685 PUT4YOR348C 1884 nt13.55□□□□□ -0.24
CLP1Q08685 SSA1YAL005C 1929 nt13.51□□□□□ -0.25
CLP1Q08685 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.48□□□□□ -0.25
CLP1Q08685 YJR018WYJR018W 363 nt13.46□□□□□ -0.25
CLP1Q08685 PUN1YLR414C 792 nt13.45□□□□□ -0.26
CLP1Q08685 ARE1YCR048W 1833 nt13.39□□□□□ -0.27
CLP1Q08685 RPP2BYDR382W 333 nt13.33□□□□□ -0.28
CLP1Q08685 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.3□□□□□ -0.28
CLP1Q08685 NPL3YDR432W 1245 nt13.29□□□□□ -0.28
CLP1Q08685 YOR139CYOR139C 393 nt13.28□□□□□ -0.28
CLP1Q08685 YGR021WYGR021W 873 nt13.25□□□□□ -0.29
CLP1Q08685 POA1YBR022W 534 nt13.24□□□□□ -0.29
CLP1Q08685 SRB2YHR041C 633 nt13.22□□□□□ -0.29
CLP1Q08685 PTC2YER089C 1395 nt13.21□□□□□ -0.29
CLP1Q08685 WWM1YFL010C 636 nt13.2□□□□□ -0.3
CLP1Q08685 HOM6YJR139C 1080 nt13.13□□□□□ -0.31
CLP1Q08685 MNP1YGL068W 585 nt13.12□□□□□ -0.31
CLP1Q08685 YJR120WYJR120W 351 nt13.11□□□□□ -0.31
CLP1Q08685 BUD23YCR047C 828 nt13.1□□□□□ -0.31
CLP1Q08685 YOL037CYOL037C 354 nt13.04□□□□□ -0.32
CLP1Q08685 NAB2YGL122C 1578 nt13.02□□□□□ -0.33
CLP1Q08685 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.01□□□□□ -0.33
CLP1Q08685 BDH2YAL061W 1254 nt13.01□□□□□ -0.33
CLP1Q08685 RKM5YLR137W 1104 nt12.97□□□□□ -0.33
CLP1Q08685 INM2YDR287W 879 nt12.96□□□□□ -0.33
CLP1Q08685 FPR4YLR449W 1179 nt12.96□□□□□ -0.33
CLP1Q08685 DAL1YIR027C 1383 nt12.89□□□□□ -0.35
CLP1Q08685 LSM3YLR438C-A 270 nt12.88□□□□□ -0.35
CLP1Q08685 BSC6YOL137W 1494 nt12.87□□□□□ -0.35
CLP1Q08685 YBL100CYBL100C 315 nt12.86□□□□□ -0.35
CLP1Q08685 TRM9YML014W 840 nt12.79□□□□□ -0.36
CLP1Q08685 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CLP1Q08685 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CLP1Q08685 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CLP1Q08685 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CLP1Q08685 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CLP1Q08685 FPS1YLL043W 2010 nt12.76□□□□□ -0.37
CLP1Q08685 FIS1YIL065C 468 nt12.75□□□□□ -0.37
CLP1Q08685 PHO4YFR034C 939 nt12.73□□□□□ -0.37
CLP1Q08685 PUS2YGL063W 1113 nt12.7□□□□□ -0.38
CLP1Q08685 FUN26YAL022C 1554 nt12.69□□□□□ -0.38
CLP1Q08685 YLR281CYLR281C 468 nt12.66□□□□□ -0.38
CLP1Q08685 WHI5YOR083W 888 nt12.63□□□□□ -0.39
CLP1Q08685 ALF1YNL148C 765 nt12.58□□□□□ -0.4
CLP1Q08685 CCT6YDR188W 1641 nt12.55□□□□□ -0.4
CLP1Q08685 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.54□□□□□ -0.4
CLP1Q08685 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.54□□□□□ -0.4
CLP1Q08685 NVJ2YPR091C 2313 nt12.54□□□□□ -0.4
CLP1Q08685 SPT5YML010W 3192 nt12.51□□□□□ -0.41
CLP1Q08685 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.45□□□□□ -0.42
CLP1Q08685 PAC11YDR488C 1602 nt12.43□□□□□ -0.42
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