Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.16e-7■■■■□ 23.9
STAU2Q9NUL3 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 32.9□□□□□ -1.956e-7■■■■□ 23.9
STAU2Q9NUL3 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.266e-7■■■■□ 23.8
STAU2Q9NUL3 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.286e-7■■■■□ 23.8
STAU2Q9NUL3 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.876e-7■■■■□ 23.8
STAU2Q9NUL3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.799e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.799e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 415.14■□□□□ 0.019e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 213.94□□□□□ -0.189e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.349e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 511.99□□□□□ -0.499e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.499e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-7■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.875e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.355e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.145e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.125e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.735e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-205ENST00000485923 1078 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-207ENST00000615547 3488 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.762e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.052e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-206ENST00000492132 819 ntTSL 57.75□□□□□ -1.172e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.472e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-201ENST00000466234 585 ntTSL 22.58□□□□□ -22e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 519.4■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 319.4■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 517.57■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 517.17■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 416.88■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 510.94□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.31□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.19e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.619e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC11.99□□□□□ -0.499e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CHTF8-206ENST00000519534 723 ntTSL 211.14□□□□□ -0.639e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.054e-13■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-13■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-13■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.572e-7■■■■□ 22.8
STAU2Q9NUL3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 22.8
STAU2Q9NUL3 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 54.85□□□□□ -1.632e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.42e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 216.66■□□□□ 0.262e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 GET4-205ENST00000441491 682 ntTSL 515.4■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 215.15■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.049e-7■■■■□ 22.2
STAU2Q9NUL3 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 516.37■□□□□ 0.219e-7■■■■□ 22.2
STAU2Q9NUL3 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 22.2
STAU2Q9NUL3 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 22.2
STAU2Q9NUL3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.192e-6■■■■□ 22.1
STAU2Q9NUL3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 22.1
STAU2Q9NUL3 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.1
STAU2Q9NUL3 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 22.1
STAU2Q9NUL3 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.411e-323■■■■□ 21.8
STAU2Q9NUL3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-14■■■■□ 21.7
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.725e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.695e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 216.34■□□□□ 0.215e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-203ENST00000561765 2374 ntTSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.887e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.477e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-221ENST00000577079 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.14■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 416.47■□□□□ 0.237e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.147e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.147e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-217ENST00000575634 571 ntTSL 415.01□□□□□ -0.017e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 413.77□□□□□ -0.217e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 324.29■■□□□ 1.481e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 222.82■■□□□ 1.241e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 522.79■■□□□ 1.241e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 319.06■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 313.51□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 MSI2-214ENST00000581776 493 ntTSL 25.24□□□□□ -1.571e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.68□□□□□ -1.661e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.987e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.767e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-214ENST00000423251 734 ntTSL 319.21■□□□□ 0.677e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 PIGT-248ENST00000639783 1691 ntTSL 218.32■□□□□ 0.527e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.477e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-218ENST00000575736 566 ntTSL 517.06■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-210ENST00000409954 574 ntTSL 514.55□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.167e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.437e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-231ENST00000494043 896 ntTSL 311.85□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 UPF1-213ENST00000601981 556 ntTSL 510.33□□□□□ -0.767e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-223ENST00000473345 399 ntTSL 39.48□□□□□ -0.897e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 OAZ1-206ENST00000589739 657 ntTSL 218.34■□□□□ 0.532e-18■■■■□ 21.2
STAU2Q9NUL3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 21.1
STAU2Q9NUL3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 21.1
STAU2Q9NUL3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 21.1
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