Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP9-2Q9BYQ4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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KRTAP9-2Q9BYQ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP9-2Q9BYQ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP9-2Q9BYQ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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KRTAP9-2Q9BYQ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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KRTAP9-2Q9BYQ4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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KRTAP9-2Q9BYQ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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KRTAP9-2Q9BYQ4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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KRTAP9-2Q9BYQ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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KRTAP9-2Q9BYQ4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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KRTAP9-2Q9BYQ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP9-2Q9BYQ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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KRTAP9-2Q9BYQ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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KRTAP9-2Q9BYQ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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