RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601545.5

SNRPA-211, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A, humanhuman

TSL 5

Gene SNRPA, Length 695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA-211ENST00000601545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.68■■■■■ 5.86
SNRPA-211ENST00000601545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.97■■■■■ 4.95
SNRPA-211ENST00000601545 ABCC9O60706 1549 aa45.74■■■■■ 4.91
SNRPA-211ENST00000601545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.76■■■■■ 4.6
SNRPA-211ENST00000601545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.63■■■■■ 4.57
SNRPA-211ENST00000601545 NACADO15069 1562 aa43.45■■■■■ 4.55
SNRPA-211ENST00000601545 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.97■■■■■ 4.47
SNRPA-211ENST00000601545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
SNRPA-211ENST00000601545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.81■■■■■ 4.443e-10■■■□□ 15.3
SNRPA-211ENST00000601545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.62■■■■■ 4.41
SNRPA-211ENST00000601545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.54■■■■■ 4.4
SNRPA-211ENST00000601545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.51■■■■■ 4.4
SNRPA-211ENST00000601545 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.31■■■■■ 4.36
SNRPA-211ENST00000601545 SCRIBQ14160 1630 aa42.08■■■■■ 4.33
SNRPA-211ENST00000601545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.72■■■■■ 4.27
SNRPA-211ENST00000601545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
SNRPA-211ENST00000601545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.23■■■■■ 4.19
SNRPA-211ENST00000601545 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.11■■■■■ 4.17
SNRPA-211ENST00000601545 NCAPD3P42695 1498 aa40.17■■■■■ 4.02
SNRPA-211ENST00000601545 SMARCA4P51532 1647 aa40.14■■■■■ 4.02
SNRPA-211ENST00000601545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.13■■■■■ 4.02
SNRPA-211ENST00000601545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
SNRPA-211ENST00000601545 SMARCA2P51531 1590 aa39.99■■■■□ 3.99
SNRPA-211ENST00000601545 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.86■■■■□ 3.97
SNRPA-211ENST00000601545 HMGXB3Q12766 1538 aa39.81■■■■□ 3.96
SNRPA-211ENST00000601545 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
SNRPA-211ENST00000601545 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.69■■■■□ 3.94
SNRPA-211ENST00000601545 ERCC6Q03468 1493 aa39.44■■■■□ 3.9
SNRPA-211ENST00000601545 NESP48681 1621 aa39.41■■■■□ 3.9
SNRPA-211ENST00000601545 WIZO95785 1651 aa39.36■■■■□ 3.89
SNRPA-211ENST00000601545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
SNRPA-211ENST00000601545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.11■■■■□ 3.85
SNRPA-211ENST00000601545 CUX2O14529 1486 aa39.08■■■■□ 3.85
SNRPA-211ENST00000601545 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.05■■■■□ 3.84
SNRPA-211ENST00000601545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.98■■■■□ 3.83
SNRPA-211ENST00000601545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
SNRPA-211ENST00000601545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.78■■■■□ 3.8
SNRPA-211ENST00000601545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
SNRPA-211ENST00000601545 CFTRP13569 1480 aa38.64■■■■□ 3.78
SNRPA-211ENST00000601545 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.63■■■■□ 3.77
SNRPA-211ENST00000601545 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.56■■■■□ 3.76
SNRPA-211ENST00000601545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.55■■■■□ 3.76
SNRPA-211ENST00000601545 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.54■■■■□ 3.76
SNRPA-211ENST00000601545 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.53■■■■□ 3.76
SNRPA-211ENST00000601545 WDR62O43379 1518 aa38.38■■■■□ 3.74
SNRPA-211ENST00000601545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.18■■■■□ 3.7
SNRPA-211ENST00000601545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
SNRPA-211ENST00000601545 PRDM2Q13029 1718 aa38.07■■■■□ 3.68
SNRPA-211ENST00000601545 TOPBP1Q92547 1522 aa37.87■■■■□ 3.65
SNRPA-211ENST00000601545 ABCC8Q09428 1581 aa37.81■■■■□ 3.64
SNRPA-211ENST00000601545 IFT140Q96RY7 1462 aa37.74■■■■□ 3.63
SNRPA-211ENST00000601545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.72■■■■□ 3.63
SNRPA-211ENST00000601545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
SNRPA-211ENST00000601545 OSCARQ8IYS5 282 aa37.6■■■■□ 3.61
SNRPA-211ENST00000601545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
SNRPA-211ENST00000601545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.45■■■■□ 3.598e-7■■■■■ 31
SNRPA-211ENST00000601545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.45■■■■□ 3.59
SNRPA-211ENST00000601545 SOGA1O94964 1423 aa37.44■■■■□ 3.58
SNRPA-211ENST00000601545 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
SNRPA-211ENST00000601545 CUX1P39880 1505 aa37.4■■■■□ 3.58
SNRPA-211ENST00000601545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.37■■■■□ 3.57
SNRPA-211ENST00000601545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
SNRPA-211ENST00000601545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
SNRPA-211ENST00000601545 TRIM41Q8WV44 630 aa37.28■■■■□ 3.56
SNRPA-211ENST00000601545 FBLN2P98095 1184 aa37.25■■■■□ 3.55
SNRPA-211ENST00000601545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.03■■■■□ 3.52
SNRPA-211ENST00000601545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.01■■■■□ 3.51
SNRPA-211ENST00000601545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
SNRPA-211ENST00000601545 GRIN2BQ13224 1484 aa36.99■■■■□ 3.51
SNRPA-211ENST00000601545 WDR97A6NE52 1622 aa36.99■■■■□ 3.51
SNRPA-211ENST00000601545 CHD1O14646 1710 aa36.96■■■■□ 3.51
SNRPA-211ENST00000601545 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.94■■■■□ 3.5
SNRPA-211ENST00000601545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.94■■■■□ 3.5
SNRPA-211ENST00000601545 SYNJ1O43426 1573 aa36.89■■■■□ 3.5
SNRPA-211ENST00000601545 TOP2BQ02880 1626 aa36.88■■■■□ 3.5
SNRPA-211ENST00000601545 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.5
SNRPA-211ENST00000601545 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.84■■■■□ 3.49
SNRPA-211ENST00000601545 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.84■■■■□ 3.49
SNRPA-211ENST00000601545 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.84■■■■□ 3.49
SNRPA-211ENST00000601545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.83■■■■□ 3.49
SNRPA-211ENST00000601545 ARHGEF11O15085 1522 aa36.81■■■■□ 3.48
SNRPA-211ENST00000601545 SYNJ2O15056 1496 aa36.78■■■■□ 3.48
SNRPA-211ENST00000601545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.75■■■■□ 3.47
SNRPA-211ENST00000601545 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.73■■■■□ 3.47
SNRPA-211ENST00000601545 PBRM1Q86U86 1689 aa36.73■■■■□ 3.47
SNRPA-211ENST00000601545 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.58■■■■□ 3.45
SNRPA-211ENST00000601545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.5■■■■□ 3.43
SNRPA-211ENST00000601545 ARAP1Q96P48 1450 aa36.5■■■■□ 3.43
SNRPA-211ENST00000601545 GRIN2AQ12879 1464 aa36.49■■■■□ 3.43
SNRPA-211ENST00000601545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.46■■■■□ 3.43
SNRPA-211ENST00000601545 ADAMTS12P58397 1594 aa36.45■■■■□ 3.43
SNRPA-211ENST00000601545 NUP160Q12769 1436 aa36.34■■■■□ 3.41
SNRPA-211ENST00000601545 KIF27Q86VH2 1401 aa36.31■■■■□ 3.4
SNRPA-211ENST00000601545 CEP170Q5SW79 1584 aa36.3■■■■□ 3.4
SNRPA-211ENST00000601545 IGF1RP08069 1367 aa36.27■■■■□ 3.4
SNRPA-211ENST00000601545 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
SNRPA-211ENST00000601545 JPH4Q96JJ6 628 aa36.15■■■■□ 3.38
SNRPA-211ENST00000601545 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.13■■■■□ 3.37
SNRPA-211ENST00000601545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.05■■■■□ 3.36
SNRPA-211ENST00000601545 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms