RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370291.6

CSAG1-203, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 1,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-203ENST00000370291 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.58■■■□□ 2.97
CSAG1-203ENST00000370291 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.83■■■□□ 2.37
CSAG1-203ENST00000370291 ABCC9O60706 1549 aa29.08■■■□□ 2.25
CSAG1-203ENST00000370291 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.05■■■□□ 2.08
CSAG1-203ENST00000370291 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.05■■■□□ 2.08
CSAG1-203ENST00000370291 NACADO15069 1562 aa28.04■■■□□ 2.08
CSAG1-203ENST00000370291 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CSAG1-203ENST00000370291 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.91■■■□□ 2.06
CSAG1-203ENST00000370291 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.81■■■□□ 2.04
CSAG1-203ENST00000370291 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.41■■□□□ 1.98
CSAG1-203ENST00000370291 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
CSAG1-203ENST00000370291 SCRIBQ14160 1630 aa27.18■■□□□ 1.94
CSAG1-203ENST00000370291 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.16■■□□□ 1.94
CSAG1-203ENST00000370291 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.93■■□□□ 1.9
CSAG1-203ENST00000370291 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.63■■□□□ 1.85
CSAG1-203ENST00000370291 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CSAG1-203ENST00000370291 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.32■■□□□ 1.8
CSAG1-203ENST00000370291 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.13■■□□□ 1.77
CSAG1-203ENST00000370291 SMARCA4P51532 1647 aa26.03■■□□□ 1.76
CSAG1-203ENST00000370291 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CSAG1-203ENST00000370291 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.88■■□□□ 1.73
CSAG1-203ENST00000370291 NCAPD3P42695 1498 aa25.87■■□□□ 1.73
CSAG1-203ENST00000370291 SMARCA2P51531 1590 aa25.86■■□□□ 1.73
CSAG1-203ENST00000370291 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.86■■□□□ 1.73
CSAG1-203ENST00000370291 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.79■■□□□ 1.72
CSAG1-203ENST00000370291 HMGXB3Q12766 1538 aa25.73■■□□□ 1.71
CSAG1-203ENST00000370291 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CSAG1-203ENST00000370291 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CSAG1-203ENST00000370291 WIZO95785 1651 aa25.59■■□□□ 1.69
CSAG1-203ENST00000370291 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CSAG1-203ENST00000370291 NESP48681 1621 aa25.18■■□□□ 1.62
CSAG1-203ENST00000370291 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.18■■□□□ 1.62
CSAG1-203ENST00000370291 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.12■■□□□ 1.61
CSAG1-203ENST00000370291 ERCC6Q03468 1493 aa25.08■■□□□ 1.6
CSAG1-203ENST00000370291 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.04■■□□□ 1.6
CSAG1-203ENST00000370291 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CSAG1-203ENST00000370291 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.01■■□□□ 1.59
CSAG1-203ENST00000370291 CFTRP13569 1480 aa24.97■■□□□ 1.59
CSAG1-203ENST00000370291 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.91■■□□□ 1.58
CSAG1-203ENST00000370291 PRDM2Q13029 1718 aa24.82■■□□□ 1.56
CSAG1-203ENST00000370291 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.81■■□□□ 1.56
CSAG1-203ENST00000370291 CUX2O14529 1486 aa24.8■■□□□ 1.56
CSAG1-203ENST00000370291 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CSAG1-203ENST00000370291 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.77■■□□□ 1.56
CSAG1-203ENST00000370291 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.72■■□□□ 1.55
CSAG1-203ENST00000370291 WDR62O43379 1518 aa24.63■■□□□ 1.53
CSAG1-203ENST00000370291 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CSAG1-203ENST00000370291 ABCC8Q09428 1581 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG1-203ENST00000370291 TOPBP1Q92547 1522 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG1-203ENST00000370291 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.41■■□□□ 1.5
CSAG1-203ENST00000370291 IFT140Q96RY7 1462 aa24.26■■□□□ 1.47
CSAG1-203ENST00000370291 CUX1P39880 1505 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG1-203ENST00000370291 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CSAG1-203ENST00000370291 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.17■■□□□ 1.46
CSAG1-203ENST00000370291 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CSAG1-203ENST00000370291 SOGA1O94964 1423 aa24.14■■□□□ 1.45
CSAG1-203ENST00000370291 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
CSAG1-203ENST00000370291 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CSAG1-203ENST00000370291 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.1■■□□□ 1.45
CSAG1-203ENST00000370291 TOP2BQ02880 1626 aa24.09■■□□□ 1.45
CSAG1-203ENST00000370291 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.09■■□□□ 1.45
CSAG1-203ENST00000370291 SYNJ1O43426 1573 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG1-203ENST00000370291 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CSAG1-203ENST00000370291 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.437e-7■■■□□ 16.6
CSAG1-203ENST00000370291 WDR97A6NE52 1622 aa24■■□□□ 1.43
CSAG1-203ENST00000370291 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CSAG1-203ENST00000370291 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.96■■□□□ 1.43
CSAG1-203ENST00000370291 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.95■■□□□ 1.43
CSAG1-203ENST00000370291 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.86■■□□□ 1.41
CSAG1-203ENST00000370291 GRIN2BQ13224 1484 aa23.84■■□□□ 1.41
CSAG1-203ENST00000370291 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.84■■□□□ 1.41
CSAG1-203ENST00000370291 OSCARQ8IYS5 282 aa23.82■■□□□ 1.4
CSAG1-203ENST00000370291 PBRM1Q86U86 1689 aa23.79■■□□□ 1.4
CSAG1-203ENST00000370291 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG1-203ENST00000370291 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CSAG1-203ENST00000370291 CHD1O14646 1710 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG1-203ENST00000370291 FBLN2P98095 1184 aa23.72■■□□□ 1.39
CSAG1-203ENST00000370291 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CSAG1-203ENST00000370291 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG1-203ENST00000370291 SYNJ2O15056 1496 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG1-203ENST00000370291 TRIM41Q8WV44 630 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG1-203ENST00000370291 KIF27Q86VH2 1401 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG1-203ENST00000370291 ADAMTS12P58397 1594 aa23.6■■□□□ 1.37
CSAG1-203ENST00000370291 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.59■■□□□ 1.37
CSAG1-203ENST00000370291 IGF1RP08069 1367 aa23.54■■□□□ 1.36
CSAG1-203ENST00000370291 GRIN2AQ12879 1464 aa23.52■■□□□ 1.36
CSAG1-203ENST00000370291 CUL7Q14999 1698 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAG1-203ENST00000370291 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.46■■□□□ 1.35
CSAG1-203ENST00000370291 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
CSAG1-203ENST00000370291 NUP160Q12769 1436 aa23.42■■□□□ 1.34
CSAG1-203ENST00000370291 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.41■■□□□ 1.34
CSAG1-203ENST00000370291 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.41■■□□□ 1.34
CSAG1-203ENST00000370291 CEP170Q5SW79 1584 aa23.39■■□□□ 1.33
CSAG1-203ENST00000370291 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.38■■□□□ 1.33
CSAG1-203ENST00000370291 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.38■■□□□ 1.33
CSAG1-203ENST00000370291 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.38■■□□□ 1.33
CSAG1-203ENST00000370291 ARHGEF11O15085 1522 aa23.38■■□□□ 1.33
CSAG1-203ENST00000370291 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.28■■□□□ 1.32
CSAG1-203ENST00000370291 EEA1Q15075 1411 aa23.26■■□□□ 1.31
CSAG1-203ENST00000370291 SHROOM2Q13796 1616 aa23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms