Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 57.9
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TRA2AQ13595 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-12■■■■■ 57.6
TRA2AQ13595 NBPF15-203ENST00000577412 4707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.991e-12■■■■■ 57.6
TRA2AQ13595 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.251e-12■■■■■ 57.6
TRA2AQ13595 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.564e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 TNRC6B-208ENST00000489500 564 ntTSL 28.78□□□□□ -14e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.124e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.34e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-204ENST00000469515 785 ntTSL 35.91□□□□□ -1.464e-13■■■■■ 57.5
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TRA2AQ13595 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.654e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.674e-13■■■■■ 57.5
TRA2AQ13595 SEC62-208ENST00000481435 627 ntTSL 24.64□□□□□ -1.674e-13■■■■■ 57.5
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TRA2AQ13595 SEC62-209ENST00000487736 508 ntTSL 52.14□□□□□ -2.074e-13■■■■■ 57.5
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TRA2AQ13595 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.072e-11■■■■■ 56.8
TRA2AQ13595 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 56.8
TRA2AQ13595 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-15■■■■■ 56.1
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TRA2AQ13595 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.272e-18■■■■■ 54.7
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TRA2AQ13595 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.592e-11■■■■■ 49.5
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