Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 TMPO-206ENST00000547214 721 ntTSL 24.2□□□□□ -1.744e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ABCD3-206ENST00000493416 623 ntTSL 53.88□□□□□ -1.794e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMPO-211ENST00000552831 743 ntTSL 22.94□□□□□ -1.944e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.288e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.258e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.238e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.138e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EHMT2-211ENST00000480912 3940 ntTSL 513.44□□□□□ -0.268e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.932e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 218.37■□□□□ 0.532e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 215.8■□□□□ 0.122e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 514.53□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 514.52□□□□□ -0.091e-6■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 314.45□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 214.39□□□□□ -0.111e-6■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 212.25□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.56□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.075e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.575e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.475e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.235e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.235e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 TMEM214-212ENST00000478980 572 ntTSL 211.02□□□□□ -0.654e-10■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.289e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 PGAM1-202ENST00000467867 1187 ntTSL 215.03■□□□□ -09e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.061e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.415e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CNOT1-218ENST00000569732 906 ntTSL 38.65□□□□□ -1.022e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CNOT1-203ENST00000562046 578 ntTSL 54.93□□□□□ -1.622e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 323.07■■□□□ 1.285e-6■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 320.86■□□□□ 0.935e-6■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 316.75■□□□□ 0.275e-6■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SERPINF1-208ENST00000572517 672 ntTSL 214.29□□□□□ -0.121e-21■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.623e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 SRCAP-205ENST00000483083 5937 ntTSL 212.97□□□□□ -0.335e-13■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-211ENST00000550973 1111 ntTSL 525.42■■□□□ 1.664e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-213ENST00000552347 1645 ntTSL 522.16■■□□□ 1.144e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-201ENST00000084795 612 ntTSL 1 (best)21.28■■□□□ 14e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 14e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 14e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 14e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-212ENST00000551749 2091 ntTSL 221.08■□□□□ 0.964e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-206ENST00000549370 628 ntTSL 520.04■□□□□ 0.84e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-202ENST00000546623 541 ntTSL 519.66■□□□□ 0.744e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-204ENST00000547897 440 ntTSL 517.29■□□□□ 0.364e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.164e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RPL18-203ENST00000547892 3844 nt14.46□□□□□ -0.14e-19■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CANX-208ENST00000504579 533 ntTSL 428.51■■■□□ 2.156e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CANX-212ENST00000506654 592 ntTSL 328.51■■■□□ 2.156e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CANX-217ENST00000513246 727 ntTSL 522.39■■□□□ 1.176e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CANX-204ENST00000502498 570 ntTSL 421.95■■□□□ 1.16e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CANX-219ENST00000514383 585 ntTSL 321.61■■□□□ 1.056e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CANX-203ENST00000502296 825 ntTSL 419.2■□□□□ 0.666e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CANX-216ENST00000510810 511 ntTSL 418.97■□□□□ 0.636e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 CANX-205ENST00000502673 1000 ntTSL 514.11□□□□□ -0.156e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.051e-12■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 FLOT1-212ENST00000487376 1583 ntTSL 523.23■■□□□ 1.311e-12■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 BAG6-260ENST00000465348 639 ntTSL 221.65■■□□□ 1.061e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 BAG6-246ENST00000438149 714 ntTSL 320.2■□□□□ 0.821e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 ACADVL-230ENST00000582379 833 ntTSL 311.59□□□□□ -0.553e-8■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RTCB-204ENST00000485373 564 ntTSL 411.35□□□□□ -0.591e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 RTCB-203ENST00000476619 594 ntTSL 48□□□□□ -1.131e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 HECTD1-216ENST00000557321 571 ntTSL 36.55□□□□□ -1.361e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.518e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 NUDT21-204ENST00000566340 581 ntTSL 35.92□□□□□ -1.468e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 NUDT21-206ENST00000568822 385 ntTSL 55.72□□□□□ -1.498e-7■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 HDLBP-245ENST00000494862 356 ntTSL 214.15□□□□□ -0.143e-11■□□□□ 9.3
G3BP1Q13283 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.942e-55■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.862e-55■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.72e-55■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SLC25A3-210ENST00000548480 722 ntTSL 22.53□□□□□ -22e-7■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TMBIM6-224ENST00000551154 423 ntTSL 217.86■□□□□ 0.456e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TMBIM6-223ENST00000550951 533 ntTSL 317.2■□□□□ 0.346e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-10■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RSL1D1-202ENST00000396503 1470 ntTSL 210.08□□□□□ -0.83e-10■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-209ENST00000475459 558 ntTSL 415.99■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-206ENST00000468550 547 ntTSL 513.61□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CNP-211ENST00000592446 587 ntTSL 429.12■■■□□ 2.254e-27■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CNP-203ENST00000441615 622 ntTSL 321.43■■□□□ 1.024e-27■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 PCK1-203ENST00000470051 409 ntTSL 219.67■□□□□ 0.744e-14■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CNP-208ENST00000589772 516 ntTSL 416.38■□□□□ 0.214e-27■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 PCK1-206ENST00000498194 783 ntTSL 213.74□□□□□ -0.214e-14■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CNP-206ENST00000585452 689 ntTSL 211.89□□□□□ -0.514e-27■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 PARP1-206ENST00000469663 542 ntTSL 313.09□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SEC31A-214ENST00000505434 569 ntTSL 419.45■□□□□ 0.73e-7■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 49.24□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 48.81□□□□□ -13e-7■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-213ENST00000480978 844 ntTSL 225.75■■□□□ 1.712e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 523.98■■□□□ 1.432e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 222.81■■□□□ 1.242e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.562e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 211.88□□□□□ -0.512e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 PHGDH-225ENST00000641720 548 nt9.06□□□□□ -0.961e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 KANK1-203ENST00000382289 1926 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.222e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.823e-8■□□□□ 9.2
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 284.3 ms