RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504579.5

CANX-208, Transcript of calnexin, human

TSL 4

Gene CANX, Length 533 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CANX-208	ENST00000504579	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		57.12	■■■■■ 6.73
CANX-208	ENST00000504579	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.99	■■■■■ 5.75
CANX-208	ENST00000504579	ABCC9	O60706	1549 aa		50.58	■■■■■ 5.69
CANX-208	ENST00000504579	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.34	■■■■■ 5.33
CANX-208	ENST00000504579	NACAD	O15069	1562 aa		48.13	■■■■■ 5.3
CANX-208	ENST00000504579	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		48	■■■■■ 5.27
CANX-208	ENST00000504579	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.66	■■■■■ 5.22
CANX-208	ENST00000504579	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.45	■■■■■ 5.19
CANX-208	ENST00000504579	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.22	■■■■■ 5.15
CANX-208	ENST00000504579	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.19	■■■■■ 5.14
CANX-208	ENST00000504579	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47.19	■■■■■ 5.14
CANX-208	ENST00000504579	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		47.08	■■■■■ 5.13
CANX-208	ENST00000504579	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.94	■■■■■ 5.1
CANX-208	ENST00000504579	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.51	■■■■■ 5.04
CANX-208	ENST00000504579	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.36	■■■■■ 5.01
CANX-208	ENST00000504579	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.74	■■■■■ 4.91
CANX-208	ENST00000504579	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.7	■■■■■ 4.91
CANX-208	ENST00000504579	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.52	■■■■■ 4.88
CANX-208	ENST00000504579	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.47	■■■■■ 4.71
CANX-208	ENST00000504579	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.43	■■■■■ 4.7
CANX-208	ENST00000504579	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.4	■■■■■ 4.7
CANX-208	ENST00000504579	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.29	■■■■■ 4.68
CANX-208	ENST00000504579	SMARCA2	P51531	1590 aa		44.26	■■■■■ 4.68
CANX-208	ENST00000504579	HMGXB3	Q12766	1538 aa		44.15	■■■■■ 4.66
CANX-208	ENST00000504579	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.02	■■■■■ 4.64
CANX-208	ENST00000504579	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		44.02	■■■■■ 4.64
CANX-208	ENST00000504579	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.96	■■■■■ 4.63
CANX-208	ENST00000504579	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.62	■■■■■ 4.57
CANX-208	ENST00000504579	NES	P48681	1621 aa		43.59	■■■■■ 4.57
CANX-208	ENST00000504579	WIZ	O95785	1651 aa		43.48	■■■■■ 4.55
CANX-208	ENST00000504579	CUX2	O14529	1486 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CANX-208	ENST00000504579	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.34	■■■■■ 4.53
CANX-208	ENST00000504579	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.31	■■■■■ 4.52
CANX-208	ENST00000504579	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.14	■■■■■ 4.5
CANX-208	ENST00000504579	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CANX-208	ENST00000504579	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.03	■■■■■ 4.48
CANX-208	ENST00000504579	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.99	■■■■■ 4.47
CANX-208	ENST00000504579	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
CANX-208	ENST00000504579	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CANX-208	ENST00000504579	CFTR	P13569	1480 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CANX-208	ENST00000504579	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CANX-208	ENST00000504579	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CANX-208	ENST00000504579	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CANX-208	ENST00000504579	WDR62	O43379	1518 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CANX-208	ENST00000504579	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CANX-208	ENST00000504579	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.25	■■■■■ 4.35
CANX-208	ENST00000504579	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CANX-208	ENST00000504579	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.87	■■■■■ 4.29
CANX-208	ENST00000504579	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CANX-208	ENST00000504579	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.76	■■■■■ 4.28
CANX-208	ENST00000504579	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.75	■■■■■ 4.27
CANX-208	ENST00000504579	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.71	■■■■■ 4.27
CANX-208	ENST00000504579	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.66	■■■■■ 4.26
CANX-208	ENST00000504579	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.52	■■■■■ 4.24
CANX-208	ENST00000504579	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.48	■■■■■ 4.23
CANX-208	ENST00000504579	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.46	■■■■■ 4.23
CANX-208	ENST00000504579	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.42	■■■■■ 4.22
CANX-208	ENST00000504579	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.34	■■■■■ 4.21	9e-10	■■□□□ 13.2
CANX-208	ENST00000504579	CUX1	P39880	1505 aa		41.34	■■■■■ 4.21
CANX-208	ENST00000504579	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.33	■■■■■ 4.21
CANX-208	ENST00000504579	SOGA1	O94964	1423 aa		41.3	■■■■■ 4.2
CANX-208	ENST00000504579	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.28	■■■■■ 4.2
CANX-208	ENST00000504579	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.17	■■■■■ 4.18
CANX-208	ENST00000504579	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.15	■■■■■ 4.18
CANX-208	ENST00000504579	WDR97	A6NE52	1622 aa		41.05	■■■■■ 4.16
CANX-208	ENST00000504579	CHD1	O14646	1710 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CANX-208	ENST00000504579	FBLN2	P98095	1184 aa		40.96	■■■■■ 4.15
CANX-208	ENST00000504579	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CANX-208	ENST00000504579	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CANX-208	ENST00000504579	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CANX-208	ENST00000504579	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CANX-208	ENST00000504579	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CANX-208	ENST00000504579	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.86	■■■■■ 4.13
CANX-208	ENST00000504579	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
CANX-208	ENST00000504579	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.83	■■■■■ 4.13
CANX-208	ENST00000504579	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.83	■■■■■ 4.13
CANX-208	ENST00000504579	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.81	■■■■■ 4.12
CANX-208	ENST00000504579	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CANX-208	ENST00000504579	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CANX-208	ENST00000504579	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
CANX-208	ENST00000504579	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CANX-208	ENST00000504579	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CANX-208	ENST00000504579	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CANX-208	ENST00000504579	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CANX-208	ENST00000504579	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CANX-208	ENST00000504579	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CANX-208	ENST00000504579	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CANX-208	ENST00000504579	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CANX-208	ENST00000504579	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CANX-208	ENST00000504579	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CANX-208	ENST00000504579	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.31	■■■■■ 4.04
CANX-208	ENST00000504579	NUP160	Q12769	1436 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CANX-208	ENST00000504579	CEP170	Q5SW79	1584 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CANX-208	ENST00000504579	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.01	■■■■■ 4
CANX-208	ENST00000504579	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.99	■■■■□ 3.99
CANX-208	ENST00000504579	IGF1R	P08069	1367 aa		39.97	■■■■□ 3.99
CANX-208	ENST00000504579	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.96	■■■■□ 3.99
CANX-208	ENST00000504579	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.88	■■■■□ 3.97
CANX-208	ENST00000504579	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.82	■■■■□ 3.97
CANX-208	ENST00000504579	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.81	■■■■□ 3.96

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