Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPN7Q9Y6W3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN7Q9Y6W3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms